O95749  GGPPS_HUMAN

Gene name: GGPS1   Description: Geranylgeranyl pyrophosphate synthase

Length: 300    GTS: 1.127e-06   GTS percentile: 0.280     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 113      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEKTQETVQRILLEPYKYLLQLPGKQVRTKLSQAFNHWLKVPEDKLQIIIEVTEMLHNASLLIDDIEDNSKLRRGFPVAHSIYGIPSVINSANYVYFLGL 100
gnomAD_SAV:     K    R  K  P H #FV   RD     R          I  # Q T     GTF  S             G#    D   C  A  MT    #  R  
Conservation:  7300012235243433144435456564346456767773663464657746779997799979979979599769999977996759996667567969
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEE      HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                               K  R                            H               RR                          
METAL:                                                                        D   D                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKVLTLDHPDAVKLFTRQLLELHQGQGLDIYWRDNYTCPTEEEYKAMVLQKTGGLFGLAVGLMQLFSDYKEDLKPLLNTLGLFFQIRDDYANLHSKEYSE 200
gnomAD_SAV:       *  NR N      C   K  # R   V R NS    P     DV   E          FI  L     NI L   I V     K   G   P  CN 
Conservation:  6999375565772676377969949966775979575776634741977699999799779999697243179977777699699979976991715945
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  
SS_PSSPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH  H HHEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                         KT                                Q               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NKSFCEDLTEGKFSFPTIHAIWSRPESTQVQNILRQRTENIDIKKYCVHYLEDVGSFEYTRNTLKELEAKAYKQIDARGGNPELVALVKHLSKMFKEENE 300
gnomAD_SAV:     R   D   *ER   SA   TS  S  I M S  C* I    M        QV      IG   EK  T TCEET# C   #   S  R   N  T D #
Conservation:  9967799799999996679997337656997779799777397967963974347764795269229914692372137997394364157624622211
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:         H HH     HHHHHHHH  H HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:                  HHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                   DDB
DO_SPOTD:                                                                                                      DDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:        K         K