O95786  DDX58_HUMAN

Gene name: DDX58   Description: Antiviral innate immune response receptor RIG-I

Length: 925    GTS: 1.995e-06   GTS percentile: 0.652     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 427      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTTEQRRSLQAFQDYIRKTLDPTYILSYMAPWFREEEVQYIQAEKNNKGPMEAATLFLKFLLELQEEGWFRGFLDALDHAGYSGLYEAIESWDFKKIEKL 100
BenignSAV:           C                                                               H                             
gnomAD_SAV:     SIK* CN  V #   WE VY  *  NSVTS  G GKMH   #K Y  CQV# T    Q    #   CL CSL  T GR     P       NL RT  V
Conservation:  7312441361131155122446224223512431130161522342124231762354203314221575345342601337379139422669126626
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH      HHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH H  HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH   HHHHHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EEYRLLLKRLQPEFKTRIIPTDIISDLSECLINQECEEILQICSTKGMMAGAEKLVECLLRSDKENWPKTLKLALEKERNKFSELWIVEKGIKDVETEDL 200
BenignSAV:                                           L                                                             
gnomAD_SAV:      C    RH*         LANT  GP        R KL *  F   LVV V   M   R   RKDS# I E   #   S     CV  Q   H  K  P
Conservation:  2145168326333431131203421241054213535761441012701553275434624554225441521483112202125601222010120021
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH HHHHH   HHHHHHHHHH      HHH HHHHH    HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH   HHHHHH             H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH HHHH    HHHHHHHHHHH         EEEE    HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH    HHHHEH         HH H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH HHHHH   HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH HHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                    DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EDKMETSDIQIFYQEDPECQNLSENSCPPSEVSDTNLYSPFKPRNYQLELALPAMKGKNTIICAPTGCGKTFVSLLICEHHLKKFPQGQKGKVVFFANQI 300
PathogenicSAV:                                                                    F                                
BenignSAV:                                                 S                                                       
gnomAD_SAV:     G# *  A #        R S # DT       #A W* L  RIS     T L VERE IVMY     E       M  Y  Q    V#  RL L V H 
Conservation:  3200111221213263130131211102212000102001113326615631431152674665865486725641534255211205343755445344
SS_PSIPRED:    HHH      HHHH   HHHH                        HHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE  H
SS_SPIDER3:    H          E                               HHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   
SS_PSSPRED:             EEEE    HHH                       HHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_IUPRED2A:                          DDD                                                                          
NP_BIND:                                                                      APTGCGKT                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVYEQQKSVFSKYFERHGYRVTGISGATAENVPVEQIVENNDIIILTPQILVNNLKKGTIPSLSIFTLMIFDECHNTSKQHPYNMIMFNYLDQKLGGSSG 400
PathogenicSAV:                                                                         A                           
gnomAD_SAV:    SA  RR       L   #C  #D#F  R  T LM   ID     T   *    SPN EM     M  VV      SS  H SHD  LL    K    P  
Conservation:  4453861136114822034261745831230233203432366555886585824213242452376654789978815255753561156318421110
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE        HHHHHHH  EEEE HHHHHHHHHH     HHHHEEEEEE HHH     HHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHH    EEEEEEEE        HHHHHH   EEEE HHHHHHHHH      HHHEEEEEEH H       HHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE        HHHHHHH  EEEE HHHHHHHHH         EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                DECH                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLPQVIGLTASVGVGDAKNTDEALDYICKLCASLDASVIATVKHNLEELEQVVYKPQKFFRKVESRISDKFKYIIAQLMRDTESLAKRICKDLENLSQIQ 500
gnomAD_SAV:     P# IT    # S A     E GSNC    F    VL   I NN RDD Q   F           W RN Y    T   # #   T  #   FK  PHT 
Conservation:  2676545557534474443104321462226436531355772263268222112732133152141150831652157125703532241223233132
SS_PSIPRED:        EEEEE          HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHH    EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH   
SS_SPIDER3:       EEEEEEE         HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE   HHHHH      EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH 
SS_PSSPRED:        EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHH     EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NREFGTQKYEQWIVTVQKACMVFQMPDKDEESRICKALFLYTSHLRKYNDALIISEHARMKDALDYLKDFFSNVRAAGFDEIEQDLTQRFEEKLQELESV 600
PathogenicSAV:          V                                                                                          
BenignSAV:                                                  Q                                 E                    
gnomAD_SAV:     G S    * * LAI E       V E    T M  TM  # *  W  I    F KR *R       N    SL*T   E TGR   H LK E  #PQR 
Conservation:  2103747276565305651325534242337536742453564364656545664857533687066128614342515424741641274232127004
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                   DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRDPSNENPKLEDLCFILQEEYHLNPETITILFVKTRALVDALKNWIEGNPKLSFLKPGILTGRGKTNQNTGMTLPAQKCILDAFKASGDHNILIATSVA 700
PathogenicSAV:                                       P                                                             
BenignSAV:                     T                                                                                   
gnomAD_SAV:    F  S  KYH H    LT  G H   RQAVIV  M S#  MEP  Y T    N   P S  *  H E   K R  VLT*             S   D  D 
Conservation:  5142123947614402562635423235355685566784275536422441414543235373344221234433145247348522232559659788
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE HHHHHHHHHHHHH          EEEEE           HHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE   
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHH       EEEEEH HHHHHHHHHHHHH    H    EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE H
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE HHHHHHHHHHHHHH         EEEEE           HHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                                             DDD                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DEGIDIAQCNLVILYEYVGNVIKMIQTRGRGRARGSKCFLLTSNAGVIEKEQINMYKEKMMNDSILRLQTWDEAVFREKILHIQTHEKFIRDSQEKPKPV 800
BenignSAV:                                                                             K                           
gnomAD_SAV:    A ST VT* S   V   E S   I  A      G       A    I D  KT L  * IRS CLFH  I GD     NL RT*IY   FG# *   N  
Conservation:  8786653498664566626754566857988984585846554304253382171138255324510581223105114400581146125511010111
SS_PSIPRED:              EEEEE     HHHHHHHH        EEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:     H   HHH  EEEEE     HHHHHHH   E E   EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:             EEEEEE     HHHHHH          EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                           DDD                                                                       D
DO_SPOTD:                                                                                              DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                              DDDDDDD  
MODRES_P:                                                                           T                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PDKENKKLLCRKCKALACYTADVRVIEECHYTVLGDAFKECFVSRPHPKPKQFSSFEKRAKIFCARQNCSHDWGIHVKYKTFEIPVIKIESFVVEDIATG 900
PathogenicSAV:                                                                                       T             
gnomAD_SAV:    LG       Y  G  W Y A  I MT#A Y A    VS#    N##R N  H PN   GP  LY Q S TY             SFL TGC  G   VP*
Conservation:  2113223938468612681635574432364354311533441224814210311516317437121282267661446415247458534854462272
SS_PSIPRED:          EEEE     EEE HHHEEEE   EEEE  HHHHHHEE             EE  EEEE       EEEEEEEE   EEEEEEEEEEEEEE    
SS_SPIDER3:          EEEE     EE  HHH EHEE  EEE   HHHHHHEEE        E  EEEEEEEEEE        EEEEEE    E EEEEEEEEEEE    
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHH    EEEEE  EEE   HHHHHH              HHHHHHHH            EEEEE  EEEEEEEEEEEEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   
METAL:                  C  C                                                  C    C                               
MODRES_P:                                                           SS                                             
MODRES_A:                                                               K                                          

                       10        20     
AA:            VQTLYSKWKDFHFEKIPFDPAEMSK 925
BenignSAV:                    T         
gnomAD_SAV:     E  HP   E P   TS  L KI E
Conservation:  1500316942324021162114000
SS_PSIPRED:     EEEE              HHHH  
SS_SPIDER3:     EEEE  H E   E     HHHH  
SS_PSSPRED:     EEEEEE     E      HHHH  
DO_DISOPRED3:                           
DO_SPOTD:                             DD
DO_IUPRED2A: