O95832  CLD1_HUMAN

Gene name: CLDN1   Description: Claudin-1

Length: 211    GTS: 1.802e-06   GTS percentile: 0.579     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 123      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MANAGLQLLGFILAFLGWIGAIVSTALPQWRIYSYAGDNIVTAQAMYEGLWMSCVSQSTGQIQCKVFDSLLNLSSTLQATRALMVVGILLGVIAIFVATV 100
gnomAD_SAV:    IV TVR#    V#VL    RS       * M CF# SY MLI  TL*KV   P#L    ER  FN   #F   R I   AC  #M DNF   M MLM  I
Conservation:  1211313225312211411413132322233122112223323121223421122023331112111232312010343475664244443234224413
STMI:                 MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               EEEEEEE     HHHHHH  EEE EE   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E EEEEE   EEEEEEEE   EEEEEEE    EEEEE    H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHHHHHHH  HHHHH    EE HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD     D                                                                                           
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                           C         C                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GMKCMKCLEDDEVQKMRMAVIGGAIFLLAGLAILVATAWYGNRIVQEFYDPMTPVNARYEFGQALFTGWAAASLCLLGGALLCCSCPRKTTSYPTPRPYP 200
BenignSAV:                            T                                                                            
gnomAD_SAV:    SV Y# #   ND   #  # T  T   F A  T I        SI#      NLA G H# # PV     G  V  P  T F  FW QE IP QALT NS
Conservation:  9557435322220181355427833543462123243343511531163320152417543614343343421313366236321520111001100123
STMI:          MM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:    H HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH        H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE                
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                                                                                           DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                              DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                 DDDDDD

                       10 
AA:            KPAPSSGKDYV 211
gnomAD_SAV:      VT #RTH E
Conservation:  11110112346
SS_PSIPRED:               
SS_SPIDER3:               
SS_PSSPRED:               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      D       
REGION:                 YV