O95992  CH25H_HUMAN

Gene name: CH25H   Description: Cholesterol 25-hydroxylase

Length: 272    GTS: 1.305e-06   GTS percentile: 0.357     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 137      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSCHNCSDPQVLCSSGQLFLQPLWDHLRSWEALLQSPFFPVIFSITTYVGFCLPFVVLDILCSWVPALRRYKIHPDFSPSAQQLLPCLGQTLYQHVMFVF 100
gnomAD_SAV:    I F    G    Y  AH L  TF  D  R #     S    S    A MS Y  L  # #  # #STRWLC  LS  WSPT*RP L  R N  PQA    
Conservation:  1111111111110000011660394032110012156223523432253225246224723300210421455221004210121043123222532255
STMI:                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:            HHHHH      HHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHH      HHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHH E        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHH      HHHHHHHHHHH  HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:          N                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVTLLHWARSPALLPHEAPELLLLLHHILFCLLLFDMEFFVWHLLHHKVPWLYRTFHKVHHQNSSSFALATQYMSVWELFSLGFFDMMNVTLLGCHPLTT 200
BenignSAV:                                     P                                                                   
gnomAD_SAV:      M M  TC LDHP# Q       R  F       YL CLL     RRM     A    R RSP  L   A   G          #IL LA VW  QH N
Conservation:  7333311111300121069120132042223455883456237223852245611583189131145564562352184235225311231362484552
STMI:          MMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                           
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH     HHHHH   HHHHHHH HHHHHHHHHH   HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHH   HHHHHHHH   HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                  WHLLH          HKVHH                                       
CARBOHYD:                                                                    N                         N           

                       10        20        30        40        50        60        70  
AA:            LTFHVVNIWLSVEDHSGYNFPWSTHRLVPFGWYGGVVHHDLHHSHFNCNFAPYFTHWDKILGTLRTASVPAR 272
gnomAD_SAV:       QLI  C    #R S   S P Y V LC  #E L  #     #     SS  R *  T    W     PQ
Conservation:  223243334475758468567542444483433784127439821211765948276723356100000111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH        HHH         HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHH       HHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                                        HHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                      DDDD
DO_SPOTD:                                                                      DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                           
MOTIF:                                              HHDLHHS