P00352  AL1A1_HUMAN

Gene name: ALDH1A1   Description: Retinal dehydrogenase 1

Length: 501    GTS: 1.378e-06   GTS percentile: 0.393     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 200      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSSSGTPDLPVLLTDLKIQYTKIFINNEWHDSVSGKKFPVFNPATEEELCQVEEGDKEDVDKAVKAARQAFQIGSPWRTMDASERGRLLYKLADLIERDR 100
gnomAD_SAV:        SM      FSG M PC    V  K N   TS R TIV      A  H Q  EEK A       K#V#R   # CA#      # FH M  V K  H
Conservation:  2001200010020002110102475462620612432333248323214435355212546285155316210562951466217616412643237541
SS_PSIPRED:                     EE  EEEE  EEE      EEEEE      EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:                     E E EEEE  EEEE     EEEEE      EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH    H    HHHHHHHHHHHHHHHHH H
SS_PSSPRED:                     EEEEEEEE   EE                HHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDD                 DD                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   D                                               D DDD                                               
MODRES_A:                                                                                                K         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLLATMESMNGGKLYSNAYLNDLAGCIKTLRYCAGWADKIQGRTIPIDGNFFTYTRHEPIGVCGQIIPWNFPLVMLIWKIGPALSCGNTVVVKPAEQTPL 200
BenignSAV:                         S   R                          L                        F                       
gnomAD_SAV:    PQ#  I TKDD  FCFH F     A M* SH S   TVN RDH   VE I L    Y                I  F* M A   S S A       I  
Conservation:  0035443437254361054015510253034845666872561643244123345236857575664596486233248543664476536363766457
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHHHH         EEEE    EEEEEEEEE  EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE     HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH       HHHH  HHHHHHHHHHHH  HHHH   EEEEEE  EEEEEE      EEEE    HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE  H   HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHH          EEE    EEEEEE        EE    HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE     HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                     D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                         IPWN                      KPAE    
MODRES_A:                                 K                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TALHVASLIKEAGFPPGVVNIVPGYGPTAGAAISSHMDIDKVAFTGSTEVGKLIKEAAGKSNLKRVTLELGGKSPCIVLADADLDNAVEFAHHGVFYHQG 300
gnomAD_SAV:     V  MT FT  T  LS            G   L    A   AGL    K   M       #    M M            NV   S I    R L     
Conservation:  6244342933644572565665464923562544060164356863733363263255516546375768986783764575542094303605463739
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH      EEE       HHHHHHH     EEEEE  HHHHHHHHHHHHH    EEEEE     EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     EEEE     HHHHHHHH     EEEEE   HHHHHHHHHHHHH    EEEEE       EE E   HHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH     EEEE     HHHHHHHHH     EEEE   HHHHHHHHHHHHH    HHHHH      EEE     HHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                GP                  GS                     ELG                             
ACT_SITE:                                                                          E                               
MODRES_A:                                                         K                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QCCIAASRIFVEESIYDEFVRRSVERAKKYILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDKILDLIESGKKEGAKLECGGGPWGNKGYFVQPTVFSNVTDEMRIAKEE 400
gnomAD_SAV:        S# S  G#        Q    # TR T   S  AAI  S       HG   NV G  E     V W   L   NA   P    #D A K CVVE  
Conservation:  7373666536555267239424543263221297761113144354401521344244126214553633780001114424254573232414243246
SS_PSIPRED:           EEEEE HHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE               EE       HHHH  
SS_SPIDER3:     EEEE  EEEE H HHHHHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE   E    E EE  EE      H HHEHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE          E           HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:        D   DDDDDD D                      DDDDDDDDBBB D                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                            DDD                                                        
NP_BIND:                                                       EQYDK                                              E
ACT_SITE:        C                                                                                                 
MODRES_P:                                          T                                                               
MODRES_A:                                                          K             K                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IFGPVQQIMKFKSLDDVIKRANNTFYGLSAGVFTKDIDKAITISSALQAGTVWVNCYGVVSAQCPFGGFKMSGNGRELGEYGFHEYTEVKTVTVKISQKN 500
gnomAD_SAV:       TG  V R T    M   S          M    #V V#I   V     # L    MI V        I     Q    S      I   RL   R  
Conservation:  5555441533932224662764140456444344142234113302332225455443211121665546278266735313411524252633221011
SS_PSIPRED:        EEEEEE   HHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHHHH    EEEE                        HHHHHHH EEEEEEEEE     
SS_SPIDER3:        EEEEEE   HHHHHHHHH     EEEEEEE  HHHHHHHHH    EEEEEE                      HHHHHHHH  EEEEEEEE     
SS_PSSPRED:    H   EEEEE    HHHHHHHHH       EEE    HHHHHHHHHHH    EEEEE     E                 HHHHHHH  EEEEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                       DDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:       IF                                                                                                  
MODRES_P:                  S                                                                                       
MODRES_A:               K        K               K                                                           K     

                
AA:            S 501
Conservation:  1
SS_PSIPRED:     
SS_SPIDER3:     
SS_PSSPRED:     
DO_DISOPRED3:  D
DO_SPOTD:      D
DO_IUPRED2A: