P02649  APOE_HUMAN

Gene name: APOE   Description: Apolipoprotein E

Length: 317    GTS: 1.301e-06   GTS percentile: 0.356     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 19      BenignSAV: 16      gnomAD_SAV: 192      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKVLWAALLVTFLAGCQAKVEQAVETEPEPELRQQTEWQSGQRWELALGRFWDYLRWVQTLSEQVQEELLSSQVTQELRALMDETMKELKAYKSELEEQL 100
PathogenicSAV:                               K           C                                                         
BenignSAV:                                                                    H                                  K 
gnomAD_SAV:        *TV PIS#R    T  K VL   L  K C R K R S H* P V H     H   A   H   #QF  RA RK  E REK V QS# C#*    R 
Conservation:  9522143534344476161111111112112011110111001650242172164124300531231252224323643274246415621822252145
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                  
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHH                H HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHH     HHH         HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD                                                                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_IUPRED2A:                          DDDDDDDDDDDDDD                                                               
CARBOHYD:                               T         T                                                        K       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPVAEETRARLSKELQAAQARLGADMEDVCGRLVQYRGEVQAMLGQSTEELRVRLASHLRKLRKRLLRDADDLQKRLAVYQAGAREGAERGLSAIRERLG 200
PathogenicSAV:                              R                       #     C  ##           C                        
BenignSAV:      R              T      V                                             P                              
gnomAD_SAV:     R#T Q Q Q YEKR V PSW R    NMRC    CH  #   I#*    MQMS  F PG  CQ   HY    K C  AHE  S  #   S R  C C R
Conservation:  2724122124412742251158114504332520190173324324525453143225235545740792436212421602332223223431431151
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:     DD      D                                                                               D         
REGION:                                                                 HLRKLRKRLLR                                
MODRES_P:                                                    S                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PLVEQGRVRAATVGSLAGQPLQERAQAWGERLRARMEEMGSRTRDRLDEVKEQVAEVRAKLEEQAQQIRLQAEAFQARLKSWFEPLVEDMQRQWAGLVEK 300
BenignSAV:                                              Q           E              G                               
gnomAD_SAV:          P#    GS   #ELPR #T S*#K   #Q  DIR #   S  K    E V HP  KK   R C   GG *VC   C G MM A  # CTRP Q#
Conservation:  7320122112112111212130262203222311111111111111111110212234133312202430233110234213427221032122202332
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                D             D   DDDDD  DDDDDDDDDDDD                                                  
REGION:                                    GERLRARM                                         RLKSWFEPLVEDM          
CARBOHYD:                 T                                                                                        

                       10       
AA:            VQAAVGTSAAPVPSDNH 317
gnomAD_SAV:    L S M I T A  R   
Conservation:  35111111111111111
SS_PSIPRED:    HHHHH            
SS_SPIDER3:    HHHH             
SS_PSSPRED:    HHHHH            
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:           DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:       DDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:            TS     S