P02771  FETA_HUMAN

Gene name: AFP   Description: Alpha-fetoprotein

Length: 609    GTS: 8.012e-07   GTS percentile: 0.140     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 306      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKWVESIFLIFLLNFTESRTLHRNEYGIASILDSYQCTAEISLADLATIFFAQFVQEATYKEVSKMVKDALTAIEKPTGDEQSSGCLENQLPAFLEELCH 100
gnomAD_SAV:    T    * L* SQI  AD  A N  GH  P M Y       K    V#I Y      GTADT A  TLEVG #GVQR    K*YLA    #     K # R
Conservation:  2000100111103011020020000010100101011111203112244134624322331220033213211111400100121602010024221371
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                  
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH          HHH HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:        EEEEEEHEH  H          HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH           H   HHHHHHHH 
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                              H                                                                              
DISULFID:                                                                                                        C 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKEILEKYGHSDCCSQSEEGRHNCFLAHKKPTPASIPLFQVPEPVTSCEAYEEDRETFMNKFIYEIARRHPFLYAPTILLWAARYDKIIPSCCKAENAVE 200
BenignSAV:             R                                                                             Q             
gnomAD_SAV:     EQT G  R  N    R # INK   V    S T F F K  A   NF      G A #IE       SRR    TRV  *#VC GR  L  F  K EA 
Conservation:  1212012222228812020250075302611011111121031121091121221002110336235532312232144113003102310781111001
SS_PSIPRED:       HHHHH         HHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH
SS_SPIDER3:     HHHHHH           HHHHHHHHH      H         HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH
SS_PSSPRED:                      HHHHHHHHH                HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                S   S S                                                                                   
DISULFID:                  CC         C                       C                                           CC       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CFQTKAATVTKELRESSLLNQHACAVMKNFGTRTFQAITVTKLSQKFTKVNFTEIQKLVLDVAHVHEHCCRGDVLDCLQDGEKIMSYICSQQDTLSNKIT 300
gnomAD_SAV:     L   S  AA     G     # YT TQHS  Q  L LI             S N  V VA VQ#R  Y K  M    KE# R #      # I   IV 
Conservation:  6500311031102100100221081200243122212002312444332224024013302211121159164231321120132123822311362241
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHH HHHHHHHHHH      HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH HHHHHHHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                               D DDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:      C                      C                                            CC      C           C           
CARBOHYD:                                                        N                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ECCKLTTLERGQCIIHAENDEKPEGLSPNLNRFLGDRDFNQFSSGEKNIFLASFVHEYSRRHPQLAVSVILRVAKGYQELLEKCFQTENPLECQDKGEEE 400
gnomAD_SAV:    K    N#  C H    T    EL*RPPS  S SS  #HV   P  AEIV  S  LR    G  P        I  V *    Q  RIVKSV *P N V  
Conservation:  0991212122209410211521412431000132221222202011220331243433454412341113462110531141244002220181102100
SS_PSIPRED:    HHH   HHHH  HHHH             HHH       HH       HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH    HHHHHHHHHH             HHH        HH    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:    HHH   HHHH HHHHH            HHH                 HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDD               DDDDD                                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                            DDD                                                                        
MODRES_P:                                                 S                                                        
DISULFID:       CC         C                                                                      C        C       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQKYIQESQALAKRSCGLFQKLGEYYLQNAFLVAYTKKAPQLTSSELMAITRKMAATAATCCQLSEDKLLACGEGAADIIIGHLCIRHEMTPVNPGVGQC 500
gnomAD_SAV:      #C  *TE#   Q *S  #       # V  I  A E     LL  I VI N V   S       NN  T AKRVTG V EQ   SRA S   SD S  
Conservation:  2110303201122019111111311041101220324225433111510232132022109801121122172410221233037002100245114117
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHH           HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH  EEE   HHHH HHHH           HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH     HHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                 SS                                                       
DISULFID:                     C                                            CC         C            C              C

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CTSSYANRRPCFSSLVVDETYVPPAFSDDKFIFHKDLCQAQGVALQTMKQEFLINLVKQKPQITEEQLEAVIADFSGLLEKCCQGQEQEVCFAEEGQKLI 600
BenignSAV:                                                                          G                              
gnomAD_SAV:     #    #         MN    TLT  V  LVL EE   VK  V  KI ED     LN    T      G      A       D K DI   D  *N  
Conservation:  7112320311741150151151521211114131122710000122011103421444222022112201211140021227511111216500412131
SS_PSIPRED:        HHHH HHHH              HHH    HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HH   HHH                H    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH  HHHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHH                     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                         DDDD      DDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:      C         C                          C                                           CC       C         

                       1
AA:            SKTRAALGV 609
gnomAD_SAV:    *N L DSRI
Conservation:  001000100
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:   D    D D
DO_SPOTD:             DD
DO_IUPRED2A: