P02774  VTDB_HUMAN

Gene name: GC   Description: Vitamin D-binding protein

Length: 474    GTS: 1.794e-06   GTS percentile: 0.576     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 229      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKRVLVLLLAVAFGHALERGRDYEKNKVCKEFSHLGKEDFTSLSLVLYSRKFPSGTFEQVSQLVKEVVSLTEACCAEGADPDCYDTRTSALSAKSCESNS 100
gnomAD_SAV:       I       T#  GS KVQY   S F     R A KN I       G T    K     *PMN#    SKTY V  VH VSC SS   PT N  QN  
Conservation:  9100212311021203122542615446924410374327324234138576535763660154143526432992246352984144335623582025
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                    
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH HHHHHHHH       EEEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HH                
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHH H   HHHHHHHHHHHH  HHH  EEEEHEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        H HHHH H         
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      EEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
DO_DISOPRED3:  BBBBBBBBBBB                                                                                         
DO_SPOTD:                                                                                              DD DDDD DD  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                  C                                            CC       C            C    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PFPVHPGTAECCTKEGLERKLCMAALKHQPQEFPTYVEPTNDEICEAFRKDPKEYANQFMWEYSTNYGQAPLSLLVSYTKSYLSMVGSCCTSASPTVCFL 200
gnomAD_SAV:       I        I DD  * F  V    *T    INMA#  V#  GV   E  * TS# TC C    RR LR F     R    VAR      C AA L 
Conservation:  6681845412991136565578674714342345252553316382152145316412734646335234831463334224634523991210341984
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH       HHHHHH   HHHHHHHHHH      EEEH
SS_SPIDER3:            HHH  H  HHHHHHHHHH               HHHHHHHHH HHHHHHHHHHH         HHHEHHHHHHHHHHH          EHEH
SS_PSSPRED:            HHHH HHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                CC         C                      C                                           CC       C  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KERLQLKHLSLLTTLSNRVCSQYAAYGEKKSRLSNLIKLAQKVPTADLEDVLPLAEDITNILSKCCESASEDCMAKELPEHTVKLCDNLSTKNSKFEDCC 300
BenignSAV:                                                                                            D            
gnomAD_SAV:           YF  V     K Y  # #*R # LGP S T   RQLRST   NI SPV N  D       T# Q Y D D   RAI FY DS  N # I   R
Conservation:  2654204132264123323832311352242226233152632414153342144211202442781221437502542121113601511221331167
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH  HHHHHHHHH       HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH     HHHHHHHH        HHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH  HHHHHHHHH      HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                         C                                            CC      C            C            CC

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QEKTAMDVFVCTYFMPAAQLPELPDVELPTNKDVCDPGNTKVMDKYTFELSRRTHLPEVFLSKVLEPTLKSLGECCDVEDSTTCFNAKGPLLKKELSSFI 400
BenignSAV:                                                       G                                                 
gnomAD_SAV:    P  IV VI  FAH I   EV K  V  V IK  L     A      I DQ#   Q LK   N L#Q  # NVV    G    A S  E    R      L
Conservation:  1322131241722243121111241101312113610110100034242223330373444233320101020279011420394004110111110034
SS_PSIPRED:    H     EEEEEEEE  HHH                     HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HEEEEH EE                         EEEEEEEEEE       HHHHHH HHHHHHH  HH        HH    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H     EEEEEEE                            EEEEEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                 D                                                                     
DISULFID:                C                       C                                       CC       C                

                       10        20        30        40        50        60        70    
AA:            DKGQELCADYSENTFTEYKKKLAERLKAKLPDATPTELAKLVNKHSDFASNCCSINSPPLYCDSEIDAELKNIL 474
BenignSAV:                                    E   K        #                             
gnomAD_SAV:             H   I I  NIRP  Q ET  LEP AK  ER  SRY #L Y  RFVT  S FG   L T    # 
Conservation:  14322382272232523555351303110161222003112221221354368102464237103210010003
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH   HHHHH            HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHHHHH    H  HHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH HHHHH          E      HHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH              H HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                       BBBBB               D
DO_SPOTD:                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                             
DISULFID:            C                                            CC        C