P03999  OPSB_HUMAN

Gene name: OPN1SW   Description: Short-wave-sensitive opsin 1

Length: 348    GTS: 2.891e-06   GTS percentile: 0.886     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 209      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRKMSEEEFYLFKNISSVGPWDGPQYHIAPVWAFYLQAAFMGTVFLIGFPLNAMVLVATLRYKKLRQPLNYILVNVSFGGFLLCIFSVFPVFVASCNGYF 100
PathogenicSAV:                                                                               R                     
gnomAD_SAV:    T  TL K      IL    L     H T LAR     VV L I  VV VLVSVT P    SD#  W T  HVP    LR    YV F     IT G RH#
Conservation:  7111030231340213101643435333410125014425332431181247224534322548943465457463213333211142202312410353
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:             EE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH    
SS_SPIDER3:            EEEE                  HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEEEE       HHHHEHHHHHHHHHHHHH   HHHEH E    
SS_PSSPRED:          HHHEE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH   EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                   N                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFGRHVCALEGFLGTVAGLVTGWSLAFLAFERYIVICKPFGNFRFSSKHALTVVLATWTIGIGVSIPPFFGWSRFIPEGLQCSCGPDWYTVGTKYRSESY 200
PathogenicSAV:                                                                                          I          
BenignSAV:        H                                                                                                
gnomAD_SAV:    IYSSQA   K  R       I  P   PD GH T    SLS #CV#     P     *IT # ICV  S D# W   *     RS    AM    H K  
Conservation:  2360026226432432343123355323326432444333623061105621252248125212114412965242366345456233431123212144
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                          M
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHH                                 HHH
SS_SPIDER3:    H  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H  EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 EE  EEEE        HH
SS_PSSPRED:    E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE          HHHHHHHHHHHHHHHH                         E        HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:            C                                                                            C                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TWFLFIFCFIVPLSLICFSYTQLLRALKAVAAQQQESATTQKAEREVSRMVVVMVGSFCVCYVPYAAFAMYMVNNRNHGLDLRLVTIPSFFSKSACIYNP 300
PathogenicSAV:              P                                                 S                                    
gnomAD_SAV:    ML    I      P     HI     V  F VP  K TM     W   ST A IG YL A  MSHVD TT V   S R  A #V AF P   N   T  S
Conservation:  2164412631153114244513551323154224333336646553973465265244415429742243423221100343453435524246626555
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        MMMMMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH         HHH HHHHHHHHHHH  H
SS_SPIDER3:    HHHHHHH   HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHEHHH         HHEE  HHHH   H HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH HHHHHEEEEEE       EEEEHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        
AA:            IIYCFMNKQFQACIMKMVCGKAMTDESDTCSSQKTEVSTVSSTQVGPN 348
gnomAD_SAV:    VV  LTSNE RV TV V #   IAN  HR# #    AF LL    R S
Conservation:  376245854522331142213021221111403143452133135381
STMI:          MMMMMM                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHH HHHHHHHHHH                EEEEE          
SS_SPIDER3:    HHHHH  HHHHHHHHHHH                              
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH                EE            
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                    D      DDD