P04000  OPSR_HUMAN

Gene name: OPN1LW   Description: Long-wave-sensitive opsin 1

Length: 364    GTS: 7.933e-07   GTS percentile: 0.137     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 132      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAQQWSLQRLAGRHPQDSYEDSTQSSIFTYTNSNSTRGPFEGPNYHIAPRWVYHLTSVWMIFVVTASVFTNGLVLAATMKFKKLRHPLNWILVNLAVADL 100
gnomAD_SAV:     V  R    FTD QLP      #   V     NDF  DS K     M    M YV  I  MS IIT I     M E NV  E  # L   N    VFT  
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111111111113100413344355444446444744892442124125242537759755675
STMI:                                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:          HHH                                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHH H
SS_SPIDER3:          HHH                  EEE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEH       HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHH                 EE                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                           S           N                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AETVIASTISIVNQVSGYFVLGHPMCVLEGYTVSLCGITGLWSLAIISWERWLVVCKPFGNVRFDAKLAIVGIAFSWIWSAVWTAPPIFGWSRYWPHGLK 200
BenignSAV:               V    Y                                    M                        V A                    
gnomAD_SAV:    T  I      V    Y  L     L  P         V                    C   I G#  V MS V  RN      TL V A       S  
Conservation:  4244431432434220204233002613492233326344625664993364238212001011100021114425842844464485424829217322
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHHH  HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE            HHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHH    EEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH    EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE             HHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                               C                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSCGPDVFSGSSYPGVQSYMIVLMVTCCIIPLAIIMLCYLQVWLAIRAVAKQQKESESTQKAEKEVTRMVVVMIFAYCVCWGPYTFFACFAAANPGYAFH 300
PathogenicSAV:   R                                                                                                 
BenignSAV:                                  T                                           V                       P  
gnomAD_SAV:          M RS   #R    INI R     T  SMVL      S P QG    R         Q    CI LM  VV  I   S A  P   S   A T  
Conservation:  4476243010100002024323534234335534733642054013101001000001001020132154436343644594973244221100100042
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:      E EEEEE       HHHHHHHHHHH  HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:                    EEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                            DDDD                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                           DD                                          
DISULFID:        C                                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            PLMAALPAYFAKSATIYNPVIYVFMNRQFRNCILQLFGKKVDDGSELSSASKTEVSSVSSVSPA 364
PathogenicSAV:       L                              E                          
gnomAD_SAV:      I   L FIVR G      VH    #                                     
Conservation:  2122246256575746488699343524630130001111111111111111111111111111
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH  HHHHHHHHHHH                EEEEE      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHH  HHHHHHHHHHH                E E E      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE  HHHHHHHHHHH                EEEEE      
DO_DISOPRED3:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: