P04264  K2C1_HUMAN

Gene name: KRT1   Description: Keratin, type II cytoskeletal 1

Length: 644    GTS: 1.165e-06   GTS percentile: 0.296     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 28      BenignSAV: 14      gnomAD_SAV: 354      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSRQFSSRSGYRSGGGFSSGSAGIINYQRRTTSSSTRRSGGGGGRFSSCGGGGGSFGAGGGFGSRSLVNLGGSKSISISVARGGGRGSGFGGGYGGGGFG 100
PathogenicSAV:                                                                          I                          
BenignSAV:                                          H                          W                    S              
gnomAD_SAV:      QRSN  YRFQR  #   D       K##    ##CC  E# RK    D#VS       #  NL  D   D  NM V M    ES RS RCC SC    
Conservation:  1110001001111001112022010011100000000011000111111010111111111221011111100110000111000010102011111111
SS_PSIPRED:       EEEEE          EE EEE       EEEEEEE                             EE       EEEEE                   
SS_SPIDER3:         EEE         E EEEEE       E      E                          EEEE       EEEE                    
SS_PSSPRED:      EEEEE                                                                      EE                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDDDD DDDDDD        D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                            D        
MODRES_P:                       S  S                                            S                                  
MODRES_M:                 R                                R                                    R                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GGGFGGGGFGGGGIGGGGFGGFGSGGGGFGGGGFGGGGYGGGYGPVCPPGGIQEVTINQSLLQPLNVEIDPEIQKVKSREREQIKSLNNQFASFIDKVRF 200
PathogenicSAV:                                                       #     P                        PF#   PP       
gnomAD_SAV:    V#  V#A    D   S   D   #DCA# RRD   #S HRD  SS     D   I   HG     YM T TK   ARYQ  #K      K        # 
Conservation:  1111111120110111111111111111110111111111111211001234316233236815424355514314513734655187448637546855
SS_PSIPRED:                                                         EEEE  HH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                       EEEEE  HH    E  E    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                        EEEEE          E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                              D                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_IUPRED2A:                                                                          DDD D DDDD                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNLRRRVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKVD 300
PathogenicSAV:        P     P                  L                                                                   
BenignSAV:                     H                                                                                   
gnomAD_SAV:            K  R    H YI A P   QL  KL L S *         R G  L VN IRG##   Q#RCD   S W  SD     V    #  FIN A 
Conservation:  7787565938971786332211110333236717511541123020144025227210233144435048536424421274474147755822531414
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH  EE HH  HHHH HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEHH HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHEEEEE        HHH
DO_DISOPRED3:                 D                                   D                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                     D                             DDDDDDDDDDD   D   DDDDDDDD                          
REGION:                       QQVDTSTRTHNLEPYFESF                                                                  
MODRES_M:                                                                                 K                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYEDIAQKSKAEAESLYQSKYEELQITAGRHGDSVRNSKIEISE 400
PathogenicSAV:           Q                            V                                                            
BenignSAV:                V                 T             N             N                                          
gnomAD_SAV:        #   #  T      CE V     SR ## #    #   CN NP   M       KH T N     K   E#      L    R        T M  
Conservation:  7233221403532933055339415331133554778477657079633662666248626523561655126305423541230122314424505625
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE       H HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                    D                                                 DD       D       
REGION:                                  QTQISETNVILSMDNNRSLDLDSI                                                  
MODRES_P:                                                 S                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNRVIQRLRSEIDNVKKQISNLQQSISDAEQRGENALKDAKNKLNDLEDALQQAKEDLARLLRDYQELMNTKLALDLEIATYRTLLEGEESRMSGECAPN 500
PathogenicSAV:                                                  D                        P  ##  C  #P   #          
BenignSAV:                                    C                     S                                              
gnomAD_SAV:     #C V    CKV #  R LPD      # V H  #V  GS  M     VG   # GY VL  CN#RQ TD NMT    V   G             R LK
Conservation:  3351425522343123252114412414453353144476106213440542337244424535694534363296488569336764661621121111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH   HH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                   DDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                                                                   DDDDDDD
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD                                   D  DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VSVSVSTSHTTISGGGSRGGGGGGYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGGRGSYGSGGSSYGSGGGSYGSGGGGGGHGSYGSGSSSGGYRGGSGGGGGGSSG 600
BenignSAV:                                         C                   G                                           
gnomAD_SAV:    M L  G   AI T V  *    # HSY  NR  FRD   #  VSSSCSCD F PRSG     S N  FE  S# R   S RG  ES  DA  D R# I D
Conservation:  3021100011111111111100020111111111111111111111111111121100000111111111111111111111110111111111001111
SS_PSIPRED:    EEEEEE    EE                                                                                        
SS_SPIDER3:    EEEEEEE                                                                                             
SS_PSSPRED:    EEEEEE                                                                                              
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                       R                                                                     R            

                       10        20        30        40    
AA:            GRGSGGGSSGGSIGGRGSSSGGVKSSGGSSSVKFVSTTYSGVTR 644
BenignSAV:                                     R    A      
gnomAD_SAV:    SWD    R    #ACQ TR  V   TD  P MR I AS C  A 
Conservation:  10011100001111111111111110121000000000111000
SS_PSIPRED:                                  EEEEEEE       
SS_SPIDER3:                           E      EEEEEEEEE     
SS_PSSPRED:                                  EEEEEEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD