P05060  SCG1_HUMAN

Gene name: CHGB   Description: Secretogranin-1

Length: 677    GTS: 1.021e-06   GTS percentile: 0.233     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 12      gnomAD_SAV: 374      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQPTLLLSLLGAVGLAAVNSMPVDNRNHNEGMVTRCIIEVLSNALSKSSAPPITPECRQVLKTSRKDVKDKETTENENTKFEVRLLRDPADASEAHESSS 100
BenignSAV:                                                                                                 T       
gnomAD_SAV:    V  A P     T   ED I  L GS  PS  TM C VT A L TSL FGV S  L  H    M  RYIR  K #GT   ML     KGA   L  RK   
Conservation:  8001112112221002341536342322175378399698866585734374746496448634231122324221231333253334112011010021
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH      HH     HHHHHHHHHH  HHHHHH      
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH H          HHHHHHHHH                  EEEE       H       
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH               HHHHHH      HHH     H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                    DDDDDDDDDDDDDDD D           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                    T             S     SS
DISULFID:                                         C                    C                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGEAGAPGEEDIQGPTKADTEKWAEGGGHSRERADEPQWSLYPSDSQVSEEVKTRHSEKSQREDEEEEEGENYQKGERGEDSSEEKHLEEPGETQNAFLN 200
BenignSAV:                     N                           N                                Q                     H
gnomAD_SAV:     EQT D R     D AN H#  GT RRR  * QVGKT    #SAE KLP     CY   CH KE   D  Q    E Q *E #K      SE  E # VS
Conservation:  3330112032102011111032130111312210131012011211011142211103110223242141113120111331224200224341202212
SS_PSIPRED:                       HHHH                          HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH           HHHHH      HHHHHHH
SS_SPIDER3:                          H                            H                                             H  
SS_PSSPRED:    HHH                 HHHH                        HHHH   HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHH          HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
REGION:                       TKADT                                                                                
MODRES_P:                                   S                  S                                 S                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERKQASAIKKEELVARSETHAAGHSQEKTHSREKSSQESGEETGSQENHPQESKGQPRSQEESEEGEEDATSEVDKRRTRPRHHHGRSRPDRSSQGGSLP 300
BenignSAV:                                    Q          A                                          R              
gnomAD_SAV:     GR VPVR     A  L  PT R P    R QK* #      A   GK      DHHQ  G   K G   A KMG Q#M# KP  R I  N   ERER L
Conservation:  2210111020242012010130201451233122211522430112421113411100313441624432103126511333332242312123232221
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH HHHHHHH                                                        HHHH                        
SS_SPIDER3:    HHH      HHHHHH                                                                                     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH                       HHHHHH       HHH                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                              S                                 S   S                             SS      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SEEKGHPQEESEESNVSMASLGEKRDHHSTHYRASEEEPEYGEEIKGYPGVQAPEDLEWERYRGRGSEEYRAPRPQSEESWDEEDKRNYPSLELDKMAHG 400
BenignSAV:                                                         G                           L                   
gnomAD_SAV:    AK  RQA   F    I     E  KGDR  Y# S   KT*HRD    S DI G      KH TV R         H  G#LNK NR*  R IK G V   
Conservation:  0232211120132311101024333031112222254211211404320202133222211102444331130220435212342341201131121112
SS_PSIPRED:                        HH                HHH              HH                         HHHH     HHHHHHH  
SS_SPIDER3:             H                                                                                          
SS_PSSPRED:            HHHHHH                                        HHHHHHHH                   HHHHH      HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                S                       S                               S         S  S                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YGEESEEERGLEPGKGRHHRGRGGEPRAYFMSDTREEKRFLGEGHHRVQENQMDKARRHPQGAWKELDRNYLNYGEEGAPGKWQQQGDLQDTKENREEAR 500
BenignSAV:                 L   H                                                                                   
gnomAD_SAV:     #  T D KD KLR  C    M  GSC      NG Q M     #YH      G T S  R VREG#N  D S V  #V     HKR   YAN   Q TK
Conservation:  2144112111011220201121231121110011223441113121211311031002110021232110213133521012120221122012115311
SS_PSIPRED:         HHH                          HHHHHH             HH      HHHHHHHH                      HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          H                      H      H                                                       HH  HHHH
SS_PSSPRED:         HHH                          HHHHHH        HHHHHHHHHH     HHHHHH                       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
PEPTIDE:                                              FLGEGHHRVQENQMDKARRHPQGAWKELDRNYLNYGEEGAPGKWQQQGDLQDTKENREEAR
MODRES_P:      Y   S                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FQDKQYSSHHTAEKRKRLGELFNPYYDPLQWKSSHFERRDNMNDNFLEGEEENELTLNEKNFFPEYNYDWWEKKPFSEDVNWGYEKRNLARVPKLDLKRQ 600
gnomAD_SAV:       E   PR  D  TES   PL##C Y  R    R      #     KDG     #  KR L S  SHE *K      VMSL HG    T   NMN    
Conservation:  3042130212112225521112234312124522124533111222424444221131341249263543836442131243323334222122332666
SS_PSIPRED:    HHHHHHH    HHHHHHHH          HH   HHHHH       HH HHHHH  HHHHH        HHHH   HHHHHH HH        HHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHHHH                 H H                    H           HH     H HHH           H  HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHH                HHHH         HHHHHH    HHH                HHHHHH H             HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            DDDDDDDDDDDDDD            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDD  D                     D DDDDDDDDDDD DD DDD                                         
PEPTIDE:       FQDKQYSSHHTAE                                                             PFSEDVNWGYE               
MODRES_P:                                      SS                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            YDRVAQLDQLLHYRKKSAEFPDFYDSEEPVSTHQEAENEKDRADQTVLTEDEKKELENLAAMDLELQKIAEKFSQRG 677
gnomAD_SAV:      K   ME  IRC RRLP   ALC    L N QR V S     E       KE * K M VV     #T    I* D
Conservation:  44655595488357897495636834363212321222333112434783573547546636768865663663438
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  HH              H   HHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                      DDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            DDD
DO_IUPRED2A:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
PEPTIDE:                       SAEFPDFYDSEEPVSTHQEAENEKDRADQTVLTEDEKKELENLAAMDLELQKIAEKF    
MODRES_P:                      S        S    S