P07197  NFM_HUMAN

Gene name: NEFM   Description: Neurofilament medium polypeptide

Length: 916    GTS: 6.25e-07   GTS percentile: 0.079     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 471      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSYTLDSLGNPSAYRRVTETRSSFSRVSGSPSSGFRSQSWSRGSPSTVSSSYKRSMLAPRLAYSSAMLSSAESSLDFSQSSSLLNGGSGPGGDYKLSRSN 100
gnomAD_SAV:       P EW  SA T  Q  #IG NSR  G  Q   Y  RL YG  #  A   C     P  V H# GT G T#N       W Q HS  RHS   NPPSF#
Conservation:  1111121110111121111111111111111111111111000111112011111111131012212121201110000011120311111110212203
SS_PSIPRED:                                                                                   HHH           HHHH HH
SS_SPIDER3:                 E  E                                           H               E                       
SS_PSSPRED:                                                                                                       H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DDD  D  DDDDDDDDDDD     DDDDDDD    D    DD                          DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:                                                    T                                                     
MODRES_P:                                   S                                                                    S 
MODRES_M:                                               R                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKEQLQGLNDRFAGYIEKVHYLEQQNKEIEAEIQALRQKQASHAQLGDAYDQEIRELRATLEMVNHEKAQVQLDSDHLEEDIHRLKERFEEEARLRDDTE 200
gnomAD_SAV:    K KK  E      #      H    KM M           D  T    T    T KR T   #    R #   A G V   TPP E #S KKEP  G S 
Conservation:  5541332553454354446615502511431432356232121213221332331345114212212322214212222443103314143422051223
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                 D  DDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:   DD    DD                       DDDD  D   DDD DDD                    DDDDDDDDDD   D D    DDD         
REGION:                                            RQKQASHAQLGDA                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAIRALRKDIEEASLVKVELDKKVQSLQDEVAFLRSNHEEEVADLLAQIQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEWFKCRYAKLT 300
gnomAD_SAV:       HV H  L       #    N *P L  LT      K  AD IPDK  T   MM GQ   NIN   E     Y# KR TH      AV#YT S*  I 
Conservation:  1122242322233032522432521262361124210332232542233222211011021122343256445423542231021022221321443495
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                    D                           D                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                           DDDDDDDDDD DD               
REGION:                                                        IQASHITVERKDYLKTDISTALKEIRSQLESHSDQNMHQAEEW         
MODRES_P:                               S                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EAAEQNKEAIRSAKEEIAEYRRQLQSKSIELESVRGTKESLERQLSDIEERHNHDLSSYQDTIQQLENELRGTKWEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIAA 400
gnomAD_SAV:     T KH#EV#V F #D     Q   E   # VD G SIR      F N  #H  QHF     A     T  PS  R  TH  HG    RK      TD   
Conservation:  3453142355323427525466356362457633342444645630314335114302564351464065323526552454554553644365547623
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                           D          D  D                                      DDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:        DD DDD D                          D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D                              
MODRES_P:                         Y                         S                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YRKLLEGEETRFSTFAGSITGPLYTHRPPITISSKIQKPKVEAPKLKVQHKFVEEIIEETKVEDEKSEMEEALTAITEELAVSMKEEKKEAAEEKEEEPE 500
BenignSAV:                                           T                                                             
gnomAD_SAV:            *     LSR L   V AQ#    # N SE T L    I       KK TK   AG   *K *    G IQK  L # KD  #  V   G  K
Conservation:  8966944963641113111122001313224220311222111252433344476344433242521612321320222011001111222122121111
SS_PSIPRED:    HHHHHH    EEE                 EE        EE  EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H
SS_SPIDER3:    HHHHH     EEEE                                  EEEEE EE   EEE      HHH  HHH HHHHH  HHHHHHHHHH    HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHEEE                                 EEEEEEE EEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDD   DD DDDDDDDDDDDDD  D               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:                                    T                                                                     
MODRES_P:                       S                                                S               S                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEEEEVAAKKSPVKATAPEVKEEEGEKEEEEGQEEEEEEDEGAKSDQAEEGGSEKEGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAKEEKKVEEKSEEVATKEE 600
BenignSAV:                                                                                                    D    
gnomAD_SAV:    PK#*   D R LG  P S     KVD G  KD          #   H K  EY R  FNK   CGP KE    K  V  DK EV N  K   K  DN K 
Conservation:  2121111212211011101111101111111111214211101202112021121211111111122112013211111111111110211111111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH             HH HHHHH    HHHH                                   HH  HHHHHHHHH           HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH                  H       HH                                          HHHHHH                
SS_PSSPRED:    HHHH                                                                                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                S                                 S       S    SS           T                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LVADAKVEKPEKAKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVPKSPVEEKGKSPVSKSPVEEKAKSPVPKSPVEEAKSKAEVGKGE 700
gnomAD_SAV:    V V VRM    R   L     # K D T     L  KN   S   T         LL    G      ##  A##  # Y     SM   #P   ME D 
Conservation:  1111110121111311121131111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111121112110111111110
SS_PSIPRED:    H                                                                                      HH   HHH     
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                              S    S                                 S    S               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QKEEEEKEVKEAPKEEKVEKKEEKPKDVPEKKKAESPVKEEAVAEVVTITKSVKVHLEKETKEEGKPLQQEKEKEKAGGEGGSEEEGSDKGAKGSRKEDI 800
BenignSAV:                             Q                                                                           
gnomAD_SAV:      DG ## I # S  # A TR   Q     NTQS FS  KK    MLP INL     K K       Q HD   D V RK RG  KRRNR VR      T
Conservation:  1111201110111111111211322111111112114121111111111111121211111112112120111213112110111101111131011221
SS_PSIPRED:                  HH                       HHHH                             HH                      HHH 
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                         S                                              S                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVNGEVEGKEEVEQETKEKGSGREEEKGVVTNGLDLSPADEKKGGDKSEEKVVVTKTVEKITSEGGDGATKYITKSVTVTQKVEEHEETFEEKLVSTKKV 900
gnomAD_SAV:    V     G E K   QI    R  K D AFIS D      G  RR#V NDK AMMN RIK L N AEG T R MIE   I   A K#  N   N A #Q E
Conservation:  1011221211121111120212111111102211213213141111111111114221231211112211102222222312122123112120112121
SS_PSIPRED:                                                             EE                                         
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
MODRES_P:                          S               S                                                               

                       10      
AA:            EKVTSHAIVKEVTQSD 916
gnomAD_SAV:    D    Y     L    
Conservation:  1201111011111111
SS_PSIPRED:             EE     
SS_SPIDER3:                    
SS_PSSPRED:           EEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D   DDDDDDDDDDDD