P08100  OPSD_HUMAN

Gene name: RHO   Description: Rhodopsin

Length: 348    GTS: 3.36e-06   GTS percentile: 0.943     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 101      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 211      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNGTEGPNFYVPFSNATGVVRSPFEYPQYYLAEPWQFSMLAAYMFLLIVLGFPINFLTLYVTVQHKKLRTPLNYILLNLAVADLFMVLGGFTSTLYTSLH 100
PathogenicSAV:    K          # MD    #    #           R   TLR    # R    R              S             DP#D   I      
BenignSAV:                                                       A                                                 
gnomAD_SAV:    # D GSL L*M#   VAAM#H  LK T H V   RH  L  TC#L   M A  V   MFHAAI   NRHMS KHV  H SM #        A     C N
Conservation:  8385480365493360673535852328586413205113314532631132758236525822665754568758558525424741367425314422
STMI:                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    
SS_PSIPRED:             EE                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH HHHHHH  HHHHHHHH 
SS_SPIDER3:             EEEE      E             HHHHHHHHHHHHHHHH H HH HHEEEEHEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH  
SS_PSSPRED:            EEEE                     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDD                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:       N            N                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GYFVFGPTGCNLEGFFATLGGEIALWSLVVLAIERYVVVCKPMSNFRFGENHAIMGVAFTWVMALACAAPPLAGWSRYIPEGLQCSCGIDYYTLKPEVNN 200
PathogenicSAV: V    #  R#   #          R F   P   #    S         K             # V#  R#  S   # #KS   ### #N         
gnomAD_SAV:    E  I RH * SS A Y   DS#  P        KQ M     K  IC RQSY  T#I  I# IV   TT SFTSL K   Q    L E N  M  S A  
Conservation:  6772380148028653452563349869966637544545483236362108511830247256154317981765666599594996486781242228
STMI:                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHH                   EE           
SS_SPIDER3:      EE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHH            E     EEEEEEEE       
SS_PSSPRED:      EE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE           EEEHHHHHHHHHHHHHH                       E        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                          ERY                                                                
DISULFID:               C                                                                            C             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESFVIYMFVVHFTIPMIIIFFCYGQLVFTVKEAAAQQQESATTQKAEKEVTRMVIIMVIAFLICWVPYASVAFYIFTHQGSNFGPIFMTIPAFFAKSAAI 300
PathogenicSAV:       R   #  NL#   C R                                            #  R                     E   #R   
gnomAD_SAV:    *     VLMF     LV  L   R* I  I   S  LH   S  E  NKG HT  V I TL    G  T M   VV       SHT   T       TSF
Conservation:  2876376913851384147265633954484323223132333323443343442364146324626550131457144920426213426444353343
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH        HHHHHHHHHH HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHEEHEEE        HHHHHHHHHHHH H 
SS_PSSPRED:    EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                         D DD                                                          
METAL:         E                                                                             Q                     

                       10        20        30        40        
AA:            YNPVIYIMMNKQFRNCMLTTICCGKNPLGDDEASATVSKTETSQVAPA 348
PathogenicSAV:   R                                      MN # # 
BenignSAV:                        N                            
gnomAD_SAV:      S V F #    W #KVNN#YYS  AP  NVV   A  MKKRH   D
Conservation:  448276514335321121013202001322010220103222000122
STMI:          MMMMMMMMM                                       
SS_PSIPRED:    H HHHHHH  HHHHHHHHHHH                 EEEEEE    
SS_SPIDER3:      HHHHHH  HHHHHHHHHHHH                  E  E    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                EEEE      
DO_DISOPRED3:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                    D              
LIPID:                              CC                         
REGION:                                     DDEASATVSKTETSQVAPA
MODRES_P:                                       S T S T TS