P08670  VIME_HUMAN

Gene name: VIM   Description: Vimentin

Length: 466    GTS: 1.734e-06   GTS percentile: 0.552     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 213      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSTRSVSSSSYRRMFGGPGTASRPSSSRSYVTTSTRTYSLGSALRPSTSRSLYASSPGGVYATRSSAVRLRSSVPGVRLLQDSVDFSLADAINTEFKNTR 100
gnomAD_SAV:         M #   C        V     #   L A AC    S # H NIG    V #S   C     TMP #N MSRGW   N LNL P    T A  #  
Conservation:  1111111100102001111000000001000002010100001001111111111130111111001011110001000001022211102201232123
SS_PSIPRED:                                         EE                                          EE  HHHHHH  HHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                  EEE                                  E HHHHHH  HHHHHH 
SS_PSSPRED:              EE                                                                         HHHHHHH HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:    DDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DD      D     DD        DD                                DD
CARBOHYD:            S                         TS                                                                  
MODRES_P:          S SSSS         T    SS       S    S  S    S S S Y SS    Y    S     SS         S   S             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TNEKVELQELNDRFANYIDKVRFLEQQNKILLAELEQLKGQGKSRLGDLYEEEMRELRRQVDQLTNDKARVEVERDNLAEDIMRLREKLQEEMLQREEAE 200
PathogenicSAV:                                                   K                                                 
BenignSAV:                                                                                     A                   
gnomAD_SAV:               N              R      DF      S WC  #   K IWK HQ M HVSKH GS  A S #  KAVVSV K   KVIR    TQ
Conservation:  1243143125324331434443024133113024321122111212222321331133023201111221121112131132002204313410242243
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:   D DDDDDD                                                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDD  D                                      D             DDD                               DD   DD
REGION:                                       LAELEQLKGQGKSRLGDLYEEE                                               
MODRES_P:                      Y                          S                                                        
MODRES_A:                         K        K         K                            K                   K            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NTLQSFRQDVDNASLARLDLERKVESLQEEIAFLKKLHEEEIQELQAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAALRDVRQQYESVAAKNLQEAEEWYKSKFADLSE 300
BenignSAV:                                                      R                                                  
gnomAD_SAV:    S      R   DV  TH    H  K FRD T     P DV  R     FE RR  VNM IF    MV PH IH   K ASV      K*     SS   G
Conservation:  1240023233525432432756443361584163234545531434131102121243221283543585456166523412821435366355324432
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD                                     D        D                                              
REGION:                                                     QAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAA                                
MODRES_P:                   S           S                                                                        S 
MODRES_A:                            K           K                                                          K      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AANRNNDALRQAKQESTEYRRQVQSLTCEVDALKGTNESLERQMREMEENFAVEAANYQDTIGRLQDEIQNMKEEMARHLREYQDLLNVKMALDIEIATY 400
PathogenicSAV:                                                                                       P             
gnomAD_SAV:    SSTW S TVHR R K  A Q   HC  Y   TF   S   KC IC     V I     KE N C   D   RR K  C  H H  V        #     
Conservation:  4326514143157351252544342124543346334433155434273213062223532312461422155235325636755852645556365345
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDDDDDDDDD       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDDD   D            DDDDDDDDDDDDD                        
MOTIF:                                  LTCE                                                                       
MODRES_P:                              S                                                                           
MODRES_A:                                                                              K                           

                       10        20        30        40        50        60      
AA:            RKLLEGEESRISLPLPNFSSLNLRETNLDSLPLVDTHSKRTLLIKTVETRDGQVINETSQHHDDLE 466
gnomAD_SAV:            R  Y  FA   F S        I  I   PR  P M M     E*  DKA  PDG#  
Conservation:  658545643942232011312211323010010010101202122233112211100111001110
SS_PSIPRED:    HHHH     EE          EEE               EEEEEEEEE    EEEEE         
SS_SPIDER3:    HHHH      E                               EEEEEEEE  EEEE          
SS_PSSPRED:    HHHHHHH                                 EEEEEEEE     EEEE         
DO_DISOPRED3:     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              D DDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   D           D                       DDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S  S      SS     T   S     T S       T           TS       
MODRES_A:                                                  K