P09493  TPM1_HUMAN

Gene name: TPM1   Description: Tropomyosin alpha-1 chain

Length: 284    GTS: 2.804e-07   GTS percentile: 0.009     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 38      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 59      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELD 100
PathogenicSAV:        R                               K  P          K#    C QV                    N       #  A Q   
gnomAD_SAV:    T               K   LT     NERE   SN   *   L       V                   G           # G    H         
Conservation:  2102111101302112121112201113120121101113422102223421334244202333213423330322111254345435323342364478
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDD D        DDDDDDDDD  D DDDDDDDDDD                     
MODRES_P:                                                  S                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTV 200
PathogenicSAV:              G               V      VKV I S                H     T      D N    #      Q    K     E  
gnomAD_SAV:    H   H  I         NT             * * G               Q                 ##  N       V       V         
Conservation:  3656474235344343841425237446856556276798443653674596285976768768433564446244535734632542311254564724
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:              D  DDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDD                                                                
DO_IUPRED2A:       DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDD    D                           DDDDDDDDDDDD  D    
MODRES_P:                                                                               S           S              

                       10        20        30        40        50        60        70        80    
AA:            TNNLKSLEAQAEKYSQKEDRYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI 284
PathogenicSAV:   K     T     L   N         FN                 E V                                  
BenignSAV:                                                               Q                         
gnomAD_SAV:             P V CL    K*   V        D       V    N           Q  T   R RG NK    TV NVS #
Conservation:  343274614333754134535444532424373533343433233323335452343303001111110110130111011001
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                     DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD   DDDDDDDDD                                                                DDD 
MODRES_P:           S                                             S        Y         S           S