P0DJD0  RGPD1_HUMAN

Gene name: RGPD1   Description: RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1

Length: 1748    GTS: 1.531e-07   GTS percentile: 0.019     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 43      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNVMGFNTDRLAWTRNKLRGFYFAKLYYEAKEYDLAKKYVCTYLSVQERDPRAHRFLGLLYELEENTEKAVECYRRSLELNPPQKDLVLKIAELLCKNDV 100
gnomAD_SAV:      M                 L          *                                                                    
Conservation:  3333333333333333347995999977979997799777539749775997997799775949555499579979975999497999997999974535
SS_PSIPRED:           HHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:       E   H      HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:      EEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                    
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                   T                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDGRAKYWVERAAKLFPGSPAIYKLKEHLLDCEGEDGWNKLFDWIQSELYVRPDDVHMNIRLVELYRSNKRLKDAVARCHEAERNIALRSSLEWNSCVVQ 200
gnomAD_SAV:                                                                      H          H                      
Conservation:  3775457977797954997757759994797549777797979779797349959775957993753543993799479354954315547959555974
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLKEYLESLQCLESDKSDWRATNTDLLLAYANLMLLTLSTRDVQESRELLESFDSALQSAKSSLGGNDELSATFLEMKGHFYMHAGSLLLKMGQHGNNVQ 300
Conservation:  9757994527474557357524245495775775247661554444573734992473554214321779434739579779759959999774532237
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH
DO_DISOPRED3:                                                      D        DD                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WQALSELAALCYVIAFQVPRPKIKLIKGEAGQNLLEMMACDRLSQSGHMLLNLSRGKQDFLKEVVETFANKSGQSVLYNALFSSQSSKDTSFLGSDDIGN 400
Conservation:  7445359779997577977599493374432532973794995997999957992442473777995759359524755495523452337775397954
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH                  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH    H H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH        EEE       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IDVQEPELEDLARYDVGAIQAHNGSLQHLTWLGLQWNSLPALPGIRKWLKQLFHHLPQETSRLETNAPESICILDLEVFLLGVVYTSHLQLKEKCNSHHS 500
gnomAD_SAV:                     V        R FS*                               R                       N             
Conservation:  4123294104927393977537574997949999793535277449599797975975999797757997977799999757977565577777353233
SS_PSIPRED:           HHHHHHH HHHHHH    HHHHHHH            HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHEH        H HHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH          HHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SYQPLCLPLPVCKRLCTERQKSWWDAVCTLIHRKAVPGNSAELRLVVQHEINTLRAQEKHGLQPALLVHWAKCLQKMGRGLNSSYDQQEYIGRSVHYWKK 600
Conservation:  2559577957557593755973995955375555447953977953997555599455769799775779943945791439959774696999957977
SS_PSIPRED:            HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHH H   HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:             HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD                                                                                                 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLPLLKIIKKNSIPEPIDPLFKHFHSVDIQASEIVEYEEDAHITFAILDAVHGNIEDAVTAFESIKSVVSYWNLALIFHRKAEDIENDAVFPEEQEECKN 700
Conservation:  7774972497357599357994995649792455149647737749495474955579427794735449495993777977754277535577675545
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH           H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                    DDDDDDDDDDDDD  D  
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                           DD          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YLRKTRDYLIKIIDDSDSNLSVVKKLPVPLESVKEMLKSVMQELEDYSEGGPLYKNGSLRNADSEIKHSTPSPTKYSLSPSKSYKYSPKTPPRWAEDQNS 800
gnomAD_SAV:                                                K                    T                                  
Conservation:  4927451794773474345235339494539343439315477753045412111531210424225457479344329945424579455937457533
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH                                                      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH     HHHH      HHHHHHHHHHHHHHH                                                     H  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH                                                       
DO_DISOPRED3:                       DDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                     DDD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD   DDDDDDDDD DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LRKMICQEVKAITKLNSSKSASRHRWPTENYGPDSVPDGYQGSQTFHGAPLTVATTGPSVYYSQSPAYNSQYLLRPAANVTPTKGSSNTEFKSTKEGFSI 900
gnomAD_SAV:       I R      K                                        S   A   F            # V   SL                  
Conservation:  5457754445355535331223354351745454345555332933344975434775322553774353475525533557451221111521424742
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                                                                                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH                                                                                      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH                                                                                         
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVSADGFKFGISEPGNQEKKSEKPLENDTGFQAQDISGQKNGRGVIFGQTSSTFTFADVAKSTSGEGFQFGKKDPNFKGFSGAGEKLFSSQCGKMANKAN 1000
Conservation:  3212444777334201000214132222130222222123130111742033444754454333243457733534775523343249532034121344
SS_PSIPRED:                                                         EEHHHH                         HHH             
SS_SPIDER3:                                                             HH                                         
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDDDDD          DDD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:             DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DD                                                  D    DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TSGDFEKDDDACKTEDSDDIHFEPVVQMPEKVELVTGEEGEKVLYSQGVKLFRFDAEISQWKERGLGNLKILKNEVNGKPRMLMRRDQVLKVCANHWITT 1100
Conservation:  3417354535235577297779797977979775579995955577775997999493579979959779795744597394999979779799997955
SS_PSIPRED:                         EE  EE    EEEE      EEEEE  EEEEEEE      EE    EEEEEEE     EEEEE       EEE      
SS_SPIDER3:                             E    EEE        EEEEE  EEEEEE     EEEE EEEEEEEEEE     EEEEEE      EEE EEE  
SS_PSSPRED:                                   EEE       HHHH H  EEEEE       H H    EEEEE      EEEEE       EEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDDDD  D  D DD  D       DDD                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TMNLKPLSGSDRAWMWLASDFSDGDAKLERLAAQFKTPELAEEFKQKFEECQRLLLDIPLQTPHKLVDTGRAAKLIQRAEEMKSGLKDFKTFLTNDQTKV 1200
Conservation:  7949747779775779295977954775959975999575925994799757457779777575755555747477757977755997575777575794
SS_PSIPRED:      EEEE      EEEEEEE        EEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHH     HHH         
SS_SPIDER3:     EEEEE      EEEEEEEE       EEEEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH               H HHHHHHHHHHHHH       H         
SS_PSSPRED:     EEEE       EEEEE        HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH                 
DO_DISOPRED3:                                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                       D DDD    D                  DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TEEENKGSGTGAAGASDTTIKPNPENTGPTLEWDNYDLREDALDDNVSSSSVHDSPLASSPVRKNIFRFDESTTGFNFSFKSALSLSKSPAKLNQSGTSV 1300
Conservation:  4777353312442477524557445357977777557777777574755537554759979777759557477497497977557547774749777297
SS_PSIPRED:     HH                                    HHH                                                          
SS_SPIDER3:     HHH                                                                                                
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDD  D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDDDDDDDDDDD D    DDD                         DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTDEESDVTQEEERDGQYFEPVVPLPDLVEVSSGEENEQVVFSHRAELYRYDKDVGQWKERGIGDIKILQNYDNKQVRIVMRRDQVLKLCANHRITPDMS 1400
gnomAD_SAV:                G            T      R  K            CS*Y      N K      V   FY   F  E                    
Conservation:  7795557377959797779999977997975479997959579797777977755599999979779997975777797599999799799995775595
SS_PSIPRED:                      EE  EE    EEE       HHHHH EEEEEEEE     EEE   EEEEEEEE     EEEEEEE    EEEEE       E
SS_SPIDER3:             HHH         EEE    EEE      HHHH    EEEEEE     EEEE    EEEEEEE     EEEEEEE     EEEEEE    EE
SS_PSSPRED:                          E     EEE      HHHHHHHHHEEEEE              EEEEE     EEEEEEE      EEE        E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDD                                                                                     
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DD                                                                   DDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LQNMKGTERVWVWTACDFADGERKVEHLAVRFKLQDVADSFKKIFDEAKTAQEKDSLITPHVSRSSTPRESPCGKIAVAVLEETTRERTDVIQGDDVADA 1500
Conservation:  5457777774947575997797595939957997775955994497955175754395595475447757759953997799999979993253454444
SS_PSIPRED:    EEE      EEEEEEE       EEEEEHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                      EEEEE                HH 
SS_SPIDER3:    EEE      EEEEEE       EEEHHEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHH   HHH            H
SS_PSSPRED:    EE      EEEEEE        HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        EEE                   
DO_DISOPRED3:                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D                                                      DDDDDDDDDDDDDDD   DDDDD D        DDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ASEVEVSSTSETTTKAVVSPPKFVFGSESVKRIFSSEKSNPFAFGNSSATGSLFGFSFNAPLKSNDSETSSVAQSGSESKVEPKKCELSKNSDIEQSSDS 1600
Conservation:  4555445475554397999979999577797599577997775999599979999999747395534220411322041225512243234421023255
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                    E           HH                                                                      
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD D

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KVKNLSASFPMEESSINYTFKTPEKEPPLWHAEFTKEELVQKLSSTTKSADQLNGLLRETEATSAVLMEQIKLLKSEIRRLERNQEESAANVEHLKNVLL 1700
gnomAD_SAV:                                                                                               M        
Conservation:  5345133533223445535975779333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:                                       HHHHHHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                        HHHHHHH      HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                        HHHHHHH      HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                           
DO_IUPRED2A:   DDDDD           DDDDDDD     D DD        DD  D     DDDDDD                           DDDDDD           

                       10        20        30        40        
AA:            QFIFLKPGSERESLLPVINTMLQLSPEEKGKLAAVAQGLQETSIPKKK 1748
gnomAD_SAV:                     T                              
Conservation:  333333333333333333333333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:    HHH      HHHH HHHHHHH    HHHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   D               D DD         DDD