P10827  THA_HUMAN

Gene name: THRA   Description: Thyroid hormone receptor alpha

Length: 490    GTS: 6.418e-07   GTS percentile: 0.084     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 5      BenignSAV: 1      gnomAD_SAV: 146      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEQKPSKVECGSDPEENSARSPDGKRKRKNGQCSLKTSMSGYIPSYLDKDEQCVVCGDKATGYHYRCITCEGCKGFFRRTIQKNLHPTYSCKYDSCCVID 100
PathogenicSAV:                                             I                                                       
gnomAD_SAV:         GE  Y   TA     LR   Q KTKSE                               R H#               EH Y         F IF 
Conservation:  6033000000001001133222232101412020011021464743634363775755557576655576435597777999956465969776539579
SS_PSIPRED:                                                                              EEE EEE       EE      EEE 
SS_SPIDER3:                                                        EEE        E  EE      E E  E       EEE     EEEEE
SS_PSSPRED:                                                         E        EEE          EHHHHEH      EE        EE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                           
DO_IUPRED2A:              DD D   DDDDDD                                                                            
DNA_BIND:                                                          CVVCGDKATGYHYRCITCEGCKGFFRRTIQKNLHPTYSCKYDSCCVID
ZN_FING:                                                           CVVCGDKATGYHYRCITCEGC                 CKYDSCCVID

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KITRNQCQLCRFKKCIAVGMAMDLVLDDSKRVAKRKLIEQNRERRRKEEMIRSLQQRPEPTPEEWDLIHIATEAHRSTNAQGSHWKQRRKFLPDDIGQSP 200
BenignSAV:                                                                          V                              
gnomAD_SAV:                   TTM   V                    QQWW K  #Q   RQSQ      G  YVS    C  S   N    K    SN      
Conservation:  9679977756694694377965779876385469979685995665458335442164595228955952567992396666425664567556547655
SS_PSIPRED:                HHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH             
SS_SPIDER3:                H HHH    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHH                      
SS_PSSPRED:             HHHHHHH     HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH         HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHH            
DO_DISOPRED3:                                DDDDDDDDDDBBBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                DDDDD
DO_SPOTD:                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                       DDDD  D    DDDDDDDDDD       DD D          DDD   D               
DNA_BIND:      KITRNQCQLCRFKKCIAVGMAMDLVLD                                                                         
ZN_FING:       KITRNQCQLCRFKKC                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVSMPDGDKVDLEAFSEFTKIITPAITRVVDFAKKLPMFSELPCEDQIILLKGCCMEIMSLRAAVRYDPESDTLTLSGEMAVKREQLKNGGLGVVSDAIF 300
PathogenicSAV:              G                                                V                                     
gnomAD_SAV:    #A V  E              V               L TK       V              GAH  A              W         I   #  
Conservation:  3233344469977796599777799979999999774996676555566554955564556667466554546767765457665675367663576576
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EE    EEEE    EE HHHHHH  HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE    EEEE   EEEEHHHHH    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEE       HHHHHH    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:     D                                                                                                 
BINDING:                                  R                                                S                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELGKSLSAFNLDDTEVALLQAVLLMSTDRSGLLCVDKIEKSQEAYLLAFEHYVNHRKHNIPHFWPKLLMKEREVQSSILYKGAAAEGRPGGSLGVHPEGQ 400
PathogenicSAV:                                                           Y          N                              
gnomAD_SAV:       R         P      V     A  L     E  Q    V     Q  I  # P  Q     P L QSKMK        V   WL   M I L R 
Conservation:  6772564464666576695656565635648423345663485168696888664685354666467666444433333333333333333333333333
SS_PSIPRED:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHE         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH HHHHHHHH              H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                  DD       DDDDDDDDD D 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90
AA:            QLLGMHVVQGPQVRQLEQQLGEAGSLQGPVLQHQSPKSPQQRLLELLHRSGILHARAVCGEDDSSEADSPSSSEEEPEVCEDLAGNAASP 490
gnomAD_SAV:       R YIAE    W   K VS #     L PH    E Q  C PQ   * R    *V    EN   VGPL TC   L#  KE # K P  
Conservation:  333333333333333333333333333333333333333336543445455344343343232255333333333333333333333333
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHH    HHH                                 
SS_SPIDER3:    HHHHHHH     H HHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHH                  HHHHHHHHHHHH   EEHHH                    HHHHHH      
DO_DISOPRED3:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD DDDD      DDD DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD