P11047  LAMC1_HUMAN

Gene name: LAMC1   Description: Laminin subunit gamma-1

Length: 1609    GTS: 1.418e-06   GTS percentile: 0.411     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 795      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRGSHRAAPALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFNVTVVATNTCGTPPEEYCVQTGVTGVTKSCHLCDAGQPHLQ 100
gnomAD_SAV:                        MV      V ASSE# # * M    WLH   L   # S SLN  G  M  SLLK  Y   A            TRHA M 
Conservation:  0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000210102021000213111110002211301112000
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                   
SS_PSIPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH                      EEEEE         EEE                  HHHH
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHHHHH      E     E E    HHHHE   EEEE        EEEEEE          E          
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHH   EEEEEE         EEE         E           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDD                                D                                                         
CARBOHYD:                                                                 N                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HGAAFLTDYNNQADTTWWQSQTMLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKFHTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSGSCENTYSKANRGFIRTGGDE 200
gnomAD_SAV:    Q V    N  S  H #    R V T     TCVSFR            H   YI C     V  H Q HRS VSH       KKAC  TSHSSV  E VD
Conservation:  1111201210100111110112100111010110101015234224223235344573343333420113561534443456032313001113233135
SS_PSIPRED:      HHHH               HHH        EEEEEE    EEEEEEEEEEE    HHEEEEEEE      EEEEEEE  HHHH               
SS_SPIDER3:      HHHHE         E               EEEEEE   EEEEEEEEEEEEE     EEEEEE      EEEEEEE   HHHH               
SS_PSSPRED:        EE                          EEEEEE    EEEEEEEEEE        EEEEE           E    HHH                
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                               D       
CARBOHYD:                                       N                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSPVLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFNDPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCNGHASECMKNEF 300
gnomAD_SAV:    R D  AE         #  M          TFD  D      L         V           Y A   E              R  S   GG VRSK 
Conservation:  1132433334343442533343333343322122002113214111103111113125464434232336356554445645875344246342311220
SS_PSIPRED:     EEEE             EEEEEE             HHHHHHH HHHHEEE         HH     HH   EE     EE                  
SS_SPIDER3:     EEEE             EEEEEE             HHHHHHH  EHEHEEE EE  E  HHH  HHHH   EEEH         E        E    
SS_PSSPRED:     EEEE             EEEEEE             HHHHHHHHHHEEEEE                 HHHHHHHHHH                     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                                           C C      C     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKLVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRSQECYFDPELYRSTGHGGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLGNNEACSSCHC 400
gnomAD_SAV:    N  MS  RR# H        S  S #S KTP VG #        S Q    F NS   #   R  R A        TY    *  Y C  SS V      
Conservation:  3122718364716157317255433111111201101161271842250181240242112205248117034428227517212533001100513315
SS_PSIPRED:      EEE     EE                                          HHHHH                                         
SS_SPIDER3:       EEEE    E    H          H           EE         EE  HHHHH     EE                    E             
SS_PSSPRED:        E                                                 HHH                                           
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:          C C        C  C                   C  C C      C               C  C        C  C            C  C C

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SPVGSLSTQCDSYGRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGCRPCSCDPSGSIDECNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGH 500
BenignSAV:                                                              V                                          
gnomAD_SAV:        A     GN S  N    M EN   CY RA R R KE   L F  HP IT   YV    #       V S      V  IV L   QV #S     R
Conservation:  2215511126310716073122150475071133113311641090921284230540035290870252811212423416373103317612687346
SS_PSIPRED:                   EE                                            EEE                                    
SS_SPIDER3:                   EE            E     E      E         E  E     EEEE    EEE          E                 
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:                                                 D                                                    
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:               C     C C        C  C           C  C C        C      C C        C  C              C        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SSVCTNAVGYSVYSISSTFQIDEDGWRAEQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYFPRYFIAPAKFLGKQVLSYGQNLSFSFRVDRRDTRLSAEDLVLEGA 600
BenignSAV:                                                             W                                           
gnomAD_SAV:      L    L    C V  I PT  NR LVG  E P  F QLFP GK TTM  E    WF VS  Q    LM         CIQMGKGNPHV V   MI  V
Conservation:  7117023014121061628015132813100210101325110123313011101222503621444241276451434141231111131001528491
SS_PSIPRED:              EEEEEE  EEE     EEE               EEEEEE       EEE  HHH   EEEEE  EEEEEEEE        HH EEEE  
SS_SPIDER3:       EEE   EEEEEEE  EEE     EEEE    E   EE   E EEEEE      EEEE  HHHH    EE   EEEEEEEE        HH EEEE  
SS_PSSPRED:              EEEEEE            E                 EEEE      EEEE  HHH          EEEEEEEE        HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                           DD                                                         
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                 N                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GLRVSVPLIAQGNSYPSETTVKYVFRLHEATDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTYSERSAGYLDDVTLASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQF 700
gnomAD_SAV:    VI  P AF T      N  A R   S  D AG     P   S      S  A M  S S    G     EI   N H       P M F     E AV  
Conservation:  5214331111010002000000315352301120713043122542471565341522123102131511714156111131150674081960640934
SS_PSIPRED:     EEEEE             EEEEEEEE             HHHHHHHHH    EEEE         EE EEEEEEE        HHEEEEE         
SS_SPIDER3:     EEEEEE           EEEEEEEEE             HHHHHHHHH   EEEEEE      EEEE EEEEEEEE         EEEEE         
SS_PSSPRED:     EEEEEE            EEEEEEEE             HHHHHHHHHHH  EEE              EEEEE           EEEEE         
DO_DISOPRED3:          DD DDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
CARBOHYD:                                                       N                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CEMCLSGYRRETPNLGPYSPCVLCACNGHSETCDPETGVCNCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCPGGSSCAVVPKTKEVVCTNCPTGTT 800
BenignSAV:                                   K                                                                     
gnomAD_SAV:      T   DCSG  ADFR C   L  V S   DI      I Y    M SLR  #      R   V#  FY  L L   S I V L   EDMG  S LADIA
Conservation:  9509326636103005333193281922650173315518051524140031180075622310721017229982021382111120242911541421
SS_PSIPRED:           EEE           EE               EE                              EE         EE      EEE        
SS_SPIDER3:     E E    E            EE         E     EEE     E          E        HH  E         EEE      EEE E      
SS_PSSPRED:                                                                                             EEE        
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                             C C      C      C C        C  C               C  C C     C          C  C     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDPNAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQSSCNP 900
BenignSAV:                                                                                            P            
gnomAD_SAV:    ART      R  R #P T S L V C W  #G   SSTI   SC A       HS # LC NQ R R  R # D S E   E  S  P  IV E     A
Conservation:  9018217245457331600400228018173243423324385203828547324527028418105645253210200252381932085211101842
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:         EE                  EE E                   E E                E             E  E           EE  
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:                                                                                               D      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:         C  C                 C  C C           C      C  C        C  C                C  C C           C  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCECQPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDCHPEGSLSLQCKDDGR 1000
gnomAD_SAV:    MMRH  R S#M A     W A      #      FE  G V IS   V #IS#   H#   SE   H   S VR  R    SYY RLK Y      G DC
Conservation:  0792707323723528317028544733306822919442661300752048572934952711821830255475126734727420640102811272
SS_PSIPRED:                                                        EEE                         EE                  
SS_SPIDER3:       EEEE    E                    EE            E     EEE                         EE                  
SS_PSSPRED:        EE                                               EE                                             
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:          C C        C  C            C  C C         C      C C        C  C           C  C C         C     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            CECREGFVGNRCDQCEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDRLKEAEREVMDLLREAQDVKDVDQNLM 1100
gnomAD_SAV:       KDS M HHGEE    C C#WF   Y      CQ G  E     M P   A  L  R     #  NHD K #  KTQ # I   H DE     E SF 
Conservation:  7092266280382162135621111127108629613520341131046114402311120201010100221111114112022302110213111150
SS_PSIPRED:    EE                          EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE    EE    E              E  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     E                               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                     DDDDDDDD           DDD        DDD 
DISULFID:      C C        C  C            C  C  C                                                                  
CARBOHYD:                           N                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DRLQRVNNTLSSQISRLQNIRNTIEETGNLAEQARAHVENTERLIEIASRELEKAKVAAANVSVTQPESTGDPNNMTLLAEEARKLAERHKQEADDIVRV 1200
BenignSAV:                         Q                                                                               
gnomAD_SAV:     C R A S  FN   HS   W  M  PE     VCVY   IQWV   S G   EG I#T    FAE  YSE    #    KKPL  V CR   PEEV   
Conservation:  0330032112010111311210121110111111101212200231031115113200410213200100013203202413500631241113103212
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                  DDDDDDDDDDDD                   D    
DO_SPOTD:                                                                       DDDDD                              
DO_IUPRED2A:     D             DDD   D DDDDDDDDDDDD    D                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                      S                                                   
CARBOHYD:            N                                                     N             N                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKTANDTSTEAYNLLLRTLAGENQTAFEIEELNRKYEQAKNISQDLEKQAARVHEEAKRAGDKAVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIKMEAENLEQLI 1300
BenignSAV:                                                                      K                                  
gnomAD_SAV:     E  S   A # S F    E KD PT KN  V  # D#E I  RGP   GSG # QGRS S  V K C TM  R R GF      TS V R   TR  RT
Conservation:  4114101411410131111122100001201610231211112116112311210242121102001101240200011012001301311221141003
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                     DDD DD DDD                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD        DDDDD          DD DDD     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDDDDDDDDD      
CARBOHYD:          N                 N                 N                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQKLKDYEDLREDMRGKELEVKNLLEKGKTEQQTADQLLARADAAKALAEEAAKKGRDTLQEANDILNNLKDFDRRVNDNKTAAEEALRKIPAINQTITE 1400
gnomAD_SAV:     EN E CK  K ATKA   #              T    VQG  V  RT       WHA      #  H  G NM#A NI A#TDD    MR VDHN  K
Conservation:  1111011012121211010121115111200031222711241153204116310311210331133114332111321131231112321102112401
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:         DD DDDD    DDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
CARBOHYD:                                                                                     N              N     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ANEKTREAQQALGSAAADATEAKNKAHEAERIASAVQKNATSTKAEAERTFAEVTDLDNEVNNMLKQLQEAEKELKRKQDDADQDMMMAGMASQAAQEAE 1500
gnomAD_SAV:     SG I          VV    TR    KV   V T R   N  T  VG     DAN    A #T          V     GT   VLI      ST   K
Conservation:  3123201411251131112104102201420240122202112111331111131061013112012310210031100012112100002210231130
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                          DDDDDDDDD DD  DD                          D   DDDD  DD       D        D     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                                                  S       
CARBOHYD:                                            N                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INARKAKNSVTSLLSIINDLLEQLGQLDTVDLNKLNEIEGTLNKAKDEMKVSDLDRKVSDLENEAKKQEAAIMDYNRDIEEIMKDIRNLEDIRKTLPSGC 1600
gnomAD_SAV:       K S  #FAN   VF          G        K  SS   T     GGH A   YH  S  R     V    Q T   LTG # V YVG      S
Conservation:  0131143025112411521551144211001221511110162022112200081024106211410511240032135115215416822611358117
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                   DDDDDDDDDDD DD        DD  DD DD  DD                      DDDDD     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDD                                DD   D DDD DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           D
DISULFID:                                                                                                         C

                       1
AA:            FNTPSIEKP 1609
gnomAD_SAV:       L   N 
Conservation:  322232522
SS_PSIPRED:             
SS_SPIDER3:             
SS_PSSPRED:             
DO_DISOPRED3:  DDD   DDD
DO_SPOTD:             D 
DO_IUPRED2A:   D DDDDDDD