P11586  C1TC_HUMAN

Gene name: MTHFD1   Description: C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic

Length: 935    GTS: 1.716e-06   GTS percentile: 0.544     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 6      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 412      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAPAEILNGKEISAQIRARLKNQVTQLKEQVPGFTPRLAILQVGNRDDSNLYINVKLKAAEEIGIKATHIKLPRTTTESEVMKYITSLNEDSTVHGFLVQ 100
PathogenicSAV:                                                 F P                                                 
BenignSAV:                      V                                                                                  
gnomAD_SAV:      TT     * L #   V # DE   S       I C        GG F              R  G  TN   S S  D VT TI   D    #    *
Conservation:  2200022200200023221332130041110402152534422233243212323433271447324244373014341754126014926125574254
SS_PSIPRED:        EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE       HHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHHH      EEEEE
SS_SPIDER3:        EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHH   EEEEEE      HHHHHHHHHHH     E EEEEE
SS_PSSPRED:        EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHH       EEEEE
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                     D                 
REGION:                                                           YINVK                                          VQ

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPLDSENSINTEEVINAIAPEKDVDGLTSINAGRLARGDLNDCFIPCTPKGCLELIKETGVPIAGRHAVVVGRSKIVGAPMHDLLLWNNATVTTCHSKTA 200
PathogenicSAV:                                                                         C                           
BenignSAV:                                      K                           L                                     V
gnomAD_SAV:            V S  A S # SK  M  S  VS         S S    M     K     AMLTVRKY     H  M     R  I   S A PI  AE V
Conservation:  5302312222222534552647875635326264733752025535724254535322231130542445462142212344154322352412312120
SS_PSIPRED:              HHHHHHH           HHHHHH EE           HHHHHHHHHHH       EEEEE       HHHHHHHHH   EEEEE     
SS_SPIDER3:              HHHHHHH   H           HHH             HHHHHHHHHHH       EEEEEE      HHHHHHHH    EEEEE     
SS_PSSPRED:              HHHHHHH              HHHH              HHHHHHHHHH       EEEEEE      HHHHHHHHHH  EEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                    DDD
NP_BIND:                                                                              GRS                          
BINDING:                                                                                                       S   
REGION:        L                                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HLDEEVNKGDILVVATGQPEMVKGEWIKPGAIVIDCGINYVPDDKKPNGRKVVGDVAYDEAKERASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAKRFLEKFKP 300
PathogenicSAV:                                                                     I                               
gnomAD_SAV:       K IYT Y#    A  A I   *#F     IVE  #KC      SH   #      #     V    AA  DI  T IG       DN RHVR   R 
Conservation:  0711241246436321223115312633254346242121124122010001212104014101124564886940134353533555141134411221
SS_PSIPRED:     HHHHHHH  EEEE          HH     EEEE               EEEEEE  HHHHHH  EE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     HHHHHHH  EEEEEE       HHH    EEEEE               E E     HHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH  EEEEE               EEEEE                       HHHHHHH          EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                      DDD                                              
REGION:                                                                               PGGVG                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GKWMIQYNNLNLKTPVPSDIDISRSCKPKPIGKLAREIGLLSEEVELYGETKAKVLLSALERLKHRPDGKYVVVTGITPTPLGEGKSTTTIGLVQALGAH 400
BenignSAV:           C                                                                                             
gnomAD_SAV:    AE L EC H  RN   A  T V * Y L ATA   Q  R Q  GI#SC       R LVPQC # WS R HLAA      S  K N   AV   * V VR
Conservation:  2280412326143086738337834315626105638577333848268136587383342762033685665968697688699448654995865454
SS_PSIPRED:                       HHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHH   HHHH HHHHHHH       EEEEEEE          HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       EEEE            HHHHH    E HHHHHHHH   HHHH      EEEE HHHHHHH       EEEEEEE          HHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:         EEE          HHHHHH      HHHHHHHH   HHHHHHH    EEHHHHHHHHHH      EEEEE              HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                         D                                                                             
NP_BIND:                                                                                      TPLGEGKS             
MODRES_P:                       S                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LYQNVFACVRQPSQGPTFGIKGGAAGGGYSQVIPMEEFNLHLTGDIHAITAANNLVAAAIDARIFHELTQTDKALFNRLVPSVNGVRRFSDIQIRRLKRL 500
gnomAD_SAV:     S   CERM*    # I             L THRK  K   I N    N T   I V T VWT N   *  EPV  H M   T M T  N   Q  Q  
Conservation:  4228565666587444386579467999967766356565435773686486447547753554658156455576258772116160661483287145
SS_PSIPRED:        EEEEEE                     EEE HHEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH           HHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:        EEEEEE       E            EE E HH  EE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH       E   HHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    H   EEEEEE                   EEE   HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH           HHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                      DD                                                                               
MODRES_P:                  S                                                                            S          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GIEKTDPTTLTDEEINRFARLDIDPETITWQRVLDTNDRFLRKITIGQAPTEKGHTRTAQFDISVASEIMAVLALTTSLEDMRERLGKMVVASSKKGEPV 600
gnomAD_SAV:     F   E N  K   R GLT  NV AAIV        S    #  MT R  M  # IWMV  G#     VT#I    NFP G        A   RR  K I
Conservation:  3716159128423841174784465134673695956964993596966159582183346574534858758584255155307434465624315155
SS_PSIPRED:          HH   HHHHHHHH          HHHHHH  HHHH   EEE               EEHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  EEEE      E
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHH    HHH EHEEHHHHHHHHH   EE         E    HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  EEEEE     EE
SS_PSSPRED:               HHHHHH HHH       HHHHHHHHHHHHH  EEE                HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHEEEE       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                      D    DD                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SAEDLGVSGALTVLMKDAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADRIALKLVGPEGFVVTEAGFGADIGMEKFFNIKCRYSGLCPHVVVLVAT 700
gnomAD_SAV:      K  #MT   I  T G# M SIT     I      CL V ST#     T HQ  F     GV   M V Y   TE    S    Q  SFWL#    L  
Conservation:  5436666465634655454673867656437554533844346375565346345554752266656654466637353645556515471733443556
SS_PSIPRED:    EHHHH    HHHHHHHH     EEEE     EEEEE           HHHHHHHHHHHH    EEEEE         HHH    HHH      EEEEEEE
SS_SPIDER3:     HHHH   HHHHHHHHHH    EEE E   EEEEEE  HHHH     HHHHHHHHHHHH    EEEEEE       H HHE EEH        EEEEEEE
SS_PSSPRED:     HHHH   HHHHHHHHHH     EE      EEEE           HHHHHHHHHHHHH    EEEEE           E  HHH        EEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
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gnomAD_SAV:      G  VN  SLMI P R IL V V  HQG  K A    E  T        LII VM   TM I  D VV GSF     V   M  S    #  SV     
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SS_SPIDER3:    HHHHHH              HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHH    EEEE   H    HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHH              HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE       HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE    H HHHHHHHHH
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DO_IUPRED2A:                                     D