P13521  SCG2_HUMAN

Gene name: SCG2   Description: Secretogranin-2

Length: 617    GTS: 8.336e-07   GTS percentile: 0.153     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 322      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEAKTHWLGAALSLIPLIFLISGAEAASFQRNQLLQKEPDLRLENVQKFPSPEMIRALEYIENLRQQAHKEESSPDYNPYQGVSVPLQQKENGDESHLP 100
BenignSAV:                                                                 H                                       
gnomAD_SAV:     T #  Q*F E  C  SSV F P    DT E  H  H QR   M   ## S   VT    HVQ  Q   N         T *A     L#   VN  RFA
Conservation:  3201211002202131123201103036433113212233311111111145368579876763945523021112323314321123223301320101
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                         
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH        HHHHHHHHHHHHHHHH                      HH        
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHHHHHHHH H              H H        HHHHHHHHHHHHHHHH                                
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHHH                                
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD      D         DD                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDD                             DDDDDDDDD D                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                   D  D    DDDDDDDD            D D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
PROPEP:                                   ASF                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ERDSLSEEDWMRIILEALRQAENEPQSAPKENKPYALNSEKNFPMDMSDDYETQQWPERKLKHMQFPPMYEENSRDNPFKRTNEIVEEQYTPQSLATLES 200
BenignSAV:                                                                                                    V    
gnomAD_SAV:    K EP R  G  K# VKGF  V# *A      K HS  ST    SKGV       PC    RRYT   SV KKS  N #LICAD V K R #S NP   D 
Conservation:  2110122227452342482322122101231111010010200001001242002221011210322222741142435986494456598886977869
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHH                                 HHH                    HHHHH  HH   HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHH                                                        H             HHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHH                                  HHHH                        HHH    HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D                      D DDDDDDDDDDD D          
DO_SPOTD:      DDDDDD              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDD           DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
PEPTIDE:                                                                                        TNEIVEEQYTPQSLATLES
REGION:                                                                                         TNEIVEEQYTPQSLATLES
MODRES_P:                                                                               S                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFQELGKLTGPNNQKRERMDEEQKLYTDDEDDIYKANNIAYEDVVGGEDWNPVEEKIESQTQEEVRDSKENIEKNEQINDEMKRSGQLGIQEEDLRKESK 300
BenignSAV:                                                                                                  G      
gnomAD_SAV:    LL D   PAAQS   C  T  G N  MN KG # R        A RR  CKAA K V   #HKG    E#ST    H S# I HL # D R VE Q    
Conservation:  4849946321010154200255212314443313204524945425545916345426343343123322213313212321564142223221111211
SS_PSIPRED:    HHHHHHH     HHHHHH HHHHHH      HHHHHHHHHH            HHHHHHH HHHHH  HHHHHHHHHH HHHHHHHH   HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH         HHHHH HHHH       H                               H    HHHHHH      HHHH       HHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHH             HHHHHH    HHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH  HHHHHHH     HHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:     DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD     DDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
PEPTIDE:       VFQELGKLTGPNNQ                                                                                      
MODRES_P:                                                                         S                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQLSDDVSKVIAYLKRLVNAAGSGRLQNGQNGERATRLFEKPLDSQSIYQLIEISRNLQIPPEDLIEMLKTGEKPNGSVEPERELDLPVDLDDISEADLD 400
gnomAD_SAV:       PN  P  V    K ISV  IEG H RKK #  IM   RTVV # V   #   G    #A # T T  I     E   L Q    S NI EM      
Conservation:  3414442343338734332112114020101122100011113353241465248234555846744552222101011212211112123121120002
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH           HHH      HHH  HHH  
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHH             HHHH         HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH                    HHH  HH   
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH                   HHH       
DO_DISOPRED3:  DDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD                    DDDDDDDDDDDDDDDDDD             D        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HPDLFQNRMLSKSGYPKTPGRAGTEALPDGLSVEDILNLLGMESAANQKTSYFPNPYNQEKVLPRLPYGAGRSRSNQLPKAAWIPHVENRQMAYENLNDK 500
BenignSAV:                         G                                                                               
gnomAD_SAV:        IHSG F Q    E T #    T #   ND A    SR DR TT  M#F  S             #  KA P    R  S   A  S    V P N 
Conservation:  0010111301011240302100011212332217444355614200212301311211022112321102131111012311212013222012520022
SS_PSIPRED:      HHHHH                         HHHHHHHH    HHH                                HHH     HH HHHHH   HH
SS_SPIDER3:      HH                            HHHHHHHH    H H                                HHH    HHHHHHHH      
SS_PSSPRED:       HHHH                         HHHHHHHH                                       HHH    HHH  HHHHH   H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                           DDDDDDDDDDDBBBDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDD DDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDD                       
DO_IUPRED2A:    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD  D DDDDDDDDDD
MODRES_P:                                     S                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQELGEYLARMLVKYPEIINSNQVKRVPGQGSSEDDLQEEEQIEQAIKEHLNQGSSQETDKLAPVSKRFPVGPPKNDDTPNRQYWDEDLLMKVLEYLNQE 600
BenignSAV:                                       G                            L                                    
gnomAD_SAV:     HD     P T    H F   S  *L TR*SLY    *GG   K  V  YSS  T LK   V LL#Q  #AE LN#H       #  G  R M       
Conservation:  5464325544464445111102215310120211111111302533335222202221033211013513110130310111100234141212332164
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH HHHH              HHH  HHHHHHHHHHHHHHH                                 HHHHHHHHHHH HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH                   H    HHHHHHHHHHHHH                                   HHHHHHHHHHH  H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHHHHHHHHH                                  HHHHHHHHHHH HH
DO_DISOPRED3:                         DDDDDDDDDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                DD
DO_SPOTD:                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:   D                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD          D D  
PEPTIDE:                                 VPGQGSSEDDLQEEEQIEQAIKEHLNQGSSQETDKLAPVS                                  
MODRES_P:                                     S                      SS                                            

                       10       
AA:            KAEKGREHIAKRAMENM 617
gnomAD_SAV:        E  YN  T L   
Conservation:  21213233013120865
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:        DDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD