P13569  CFTR_HUMAN

Gene name: CFTR   Description: Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator

Length: 1480    GTS: 3.759e-06   GTS percentile: 0.969     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 240      BenignSAV: 30      gnomAD_SAV: 1014      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQRSPLEKASVVSKLFFSWTRPILRKGYRQRLELSDIYQIPSVDSADNLSEKLEREWDRELASKKNPKLINALRRCFFWRFMFYGIFLYLGEVTKAVQPL 100
PathogenicSAV: #           F P           R   L          F G D   #     KG  K      L      W          # L   RK     RL 
BenignSAV:                                   C            V                              Q                         
gnomAD_SAV:    T*MALRQ  ##A I# LG #I  V E*HT CP  L VHH  FIV V KP  I   K # *   ER LN   TFWQ# LR L LCEV SC R* I  A#L 
Conservation:  3330000330333333119328672896444934495954541738826762896896695555248363384397732593359549545957968996
STMI:                                                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  
SS_PSIPRED:        HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH      HH HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         H    HHHHHHHH H HHHHHH      HHH         HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD DDDDDDDD                      D   DDDD                                  DDBBB                  
DO_SPOTD:      DDD                                                                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLGRIIASYDPDNKEERSIAIYLGIGLCLLFIVRTLLLHPAIFGLHHIGMQMRIAMFSLIYKKTLKLSSRVLDKISIGQLVSLLSNNLNKFDEGLALAHF 200
PathogenicSAV:  R  S   #HL    K#  T   R D            R D       R  V      S D   S            R          K  GK     # 
BenignSAV:                                          P                                           G                  
gnomAD_SAV:    *R GV   NELG   #G#VTFC  TS   VLT  S  PPST     QT I#IKT V TSVC  A     CII   TTEKV  I    P  V #V V #R#
Conservation:  5798997877304209634657554985696339375576657987759966969788788997987896898696766977878566587767464777
STMI:                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 MMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                          DD   D                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VWIAPLQVALLMGLIWELLQASAFCGLGFLIVLALFQAGLGRMMMKYRDQRAGKISERLVITSEMIENIQSVKAYCWEEAMEKMIENLRQTELKLTRKAA 300
PathogenicSAV:     SW                    R    D           K             G                            Y         Q   
BenignSAV:                                                                                         F               
gnomAD_SAV:    M  S#WHASF VEV #G* #V  L E  Y  DVS SE R RKT#   T   SR VNAGFG    R   T  A#  #  DSTDR F S  RR M   W TG
Conservation:  7994968638638865556333573474355555429616623423461353337749657968467855898496993566337445831552584846
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                       MM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YVRYFNSSAFFFSGFFVVFLSVLPYALIKGIILRKIFTTISFCIVLRMAVTRQFPWAVQTWYDSLGAINKIQDFLQKQEYKTLEYNLTTTEVVMENVTAF 400
PathogenicSAV:       N   L  #  E               F# K I  P    P# P  Q      K R          HN                           
BenignSAV:                          M                            S H                                               
gnomAD_SAV:    C   VS  GL   ESLG  FPM  C R   N FW #VI V  FV  #VV IQH L    IR       SE#*# *  R** P    SMS#   T Y  V 
Conservation:  3397559757989664662337463431235145376863764568866588868356847666344519466682448631456583334425334663
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH           EEEE  EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      H         EEEE EEEE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             EEEEEEEEE
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD DDD
DO_SPOTD:                                                                                      DDDDDDDD            
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WEEGFGELFEKAKQNNNNRKTSNGDDSLFFSNFSLLGTPVLKDINFKIERGQLLAVAGSTGAGKTSLLMVIMGELEPSEGKIKHSGRISFCSQFSWIMPG 500
PathogenicSAV:   D                                                 S E# V     # LP V    K     C          RF        
BenignSAV:                                                                       F  M                              
gnomAD_SAV:    *  R EK I ES P D S    KS   I  G   P DATAP YV  RTG RR  EA  F  V  NLF VMV  Q  T D    YT K *CFF* F  TAD
Conservation:  6464142462443332232101213122254662532279954957163593776659966688679974679993653944599997977693596699
SS_PSIPRED:         HHHHHHHH                          EEEEEEEEE    EEEEE      HHHHHHHHH      EEEEEEE EEEEEE        
SS_SPIDER3:    E     HHHHH                 HH         EEEEEEEEEE   EEEEEE     HHHHHHHHH      EEEEEE   EEEE    E E  
SS_PSSPRED:    E                                           EEEE   EEEEEEE     HHHHHHHHHH       EEEEE EEEEEE        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                           
DO_SPOTD:             D DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:                  DD                                                                                   
NP_BIND:                                                                GSTGAGKT                                   
BINDING:       W                                S                                                          Q       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TIKENIIFGVSYDEYRYRSVIKACQLEEDISKFAEKDNIVLGEGGITLSGGQRARISLARAVYKDADLYLLDSPFGYLDVLTEKEIFESCVCKLMANKTR 600
PathogenicSAV:  # Q LF R   G   C  #                       V    # #KQ    ST#EL# G A # SN H    G       SVI           
BenignSAV:          VVC                       E                                                                    
gnomAD_SAV:     #   #VL I  # H   NF#  *  QK # N E E #TA E S  APN S P  VTSSSELN##DN D  EFHYA# G  S  * #G   Y  V K S 
Conservation:  6677995996377639934773597956563264458261537784499998678648986597996699797984698538854686464648646959
SS_PSIPRED:     HHHH        HHHHHHHHHHH  HHHHHH      EEE        HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH   EE
SS_SPIDER3:     HHHH        HHHHHHHHHH   HHHHH       EEE    E   HHHHHHHHHHHHHH    EEEE        HHHHHHHHHH HHHH    EE
SS_PSSPRED:     HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EE        HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE         HHHHHHHHHHHHHHHHH EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
LIPID:                                C                                                                            
MODRES_P:                                                      S                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILVTSKMEHLKKADKILILHEGSSYFYGTFSELQNLQPDFSSKLMGCDSFDQFSAERRNSILTETLHRFSLEGDAPVSWTETKKQSFKQTGEFGEKRKNS 700
PathogenicSAV: F       RS  TG   TS# D     R    P              V  N             S                                   
BenignSAV:         F    F                                           G                                              
gnomAD_SAV:    # I P    I   G VFT R D  NLCRA   I TP S  G   K  N LN#VG Q    #     YH   K*VVS    V  T Y Q AR L G   K 
Conservation:  7788795779748867969959147989564695336966652759244793344599397656785549573321112251141644622221548539
SS_PSIPRED:    EEE   HHHHH   EEEEEE  EEEEEE HHHHHH  HHHHHHH      HH  HHHH                      HHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    EEE     H     EEEEEE  EEEEE  HHHHHH  HHHHHHH       H  HHH      H                H HHHHHH            
SS_PSSPRED:    EEEE  HHHHHHH EEEEE   EEEE   HHHHHHH HHHHHHHH                                    HHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                    D     DDDD  D      
MODRES_P:                                                                 S         S               S             S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILNPINSIRKFSIVQKTPLQMNGIEEDSDEPLERRLSLVPDSEQGEAILPRISVISTGPTLQARRRQSVLNLMTHSVNQGQNIHRKTTASTRKVSLAPQA 800
PathogenicSAV:         Q                                            M           M                         G       G
gnomAD_SAV:      IRV CTQ    LH  R #  V K A   L*    F  L   P  V  LLS#MFCS  M   *KKHFI     RL    H V PN     * # P SK#
Conservation:  4365323066494242221222217410021047549444415546215444223212205132998998267815222321012101332563832421
SS_PSIPRED:        HHH          HH            HHH            HH    EE      HHHHHHHHHHHHHH                          
SS_SPIDER3:                                                   H             HHHHHHHHHHHH                           
SS_PSSPRED:                                                                  HHHHHHHHHHHH                          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                     DDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDD       DD                              DDDDD  DD D  D      
MODRES_P:                 S    T                   S               S              S                     S    S     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NLTELDIYSRRLSQETGLEISEEINEEDLKECFFDDMESIPAVTTWNTYLRYITVHKSLIFVLIWCLVIFLAEVAASLVVLWLLGNTPLQDKGNSTHSRN 900
PathogenicSAV:      GM              K                            L              Y                                 K
BenignSAV:                              K                                                                          
gnomAD_SAV:     F   GM  GS     V    *D  K #  *Y L YT        *S C Q FII N F  L   Y      VL VA         PHFRG  STIYR  
Conservation:  2421265949769353135466554564544351340212316868788498442562533584463265237433533342241000000004030111
STMI:                                                                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                     
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH  HHH     HHH HHHHHH  HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
SS_SPIDER3:       HHHHHHH           HH  HHHHH H   H       E HHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
SS_PSSPRED:                                              EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   DDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                  S                                                                                       
CARBOHYD:                                                                                                   N     N

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSYAVIITSTSSYYVFYIYVGVADTLLAMGFFRGLPLVHTLITVSKILHHKMLHSVLQAPMSTLNTLKAGGILNRFSKDIAILDDLLPLTIFDFIQLLLI 1000
PathogenicSAV:        N    C   C     D   P                 L   #                    #        V             Y       
BenignSAV:       H     I  L                                                      S                                 
gnomAD_SAV:    I C L SN SNL* L  VCLR  NN#       S T L#     LQ FYRTI Y    TS#   K S  D     ##RGK V N#P   #MLG## F   
Conservation:  0003454815817944986554776476763399798683565584199359526782985535625867485899499466589499634795696356
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                   MMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:      EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH    HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:      EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         E     EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDD                                                                                                
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VIGAIAVVAVLQPYIFVATVPVIVAFIMLRAYFLQTSQQLKQLESEGRSPIFTHLVTSLKGLWTLRAFGRQPYFETLFHKALNLHTANWFLYLSTLRWFQ 1100
PathogenicSAV:     RE      L              I   C   N        Y      V D      R   ##T  #PL    P       R            # P
BenignSAV:                               T                                       V                                 
gnomAD_SAV:    LFEGR# DT   #C S T  #MR S TIM VC  *N  R Q* Q  V NAFVIQ  A   R   F#T RWR  #  P  RG   PA  CLFC    CCLP
Conservation:  9295527853438965564386234652492655365556846656777677675549479777697657627762676754759763966776399997
STMI:          MMMMMMMMMMM  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                             MMMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                            DDDDD                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRIEMIFVIFFIAVTFISILTTGEGEGRVGIILTLAMNIMSTLQWAVNSSIDVDSLMRSVSRVFKFIDMPTEGKPTKSTKPYKNGQLSKVMIIENSHVKK 1200
PathogenicSAV: #                F                  V              H G    #                                         
BenignSAV:                                                                  L                                      
gnomAD_SAV:    IK   T LV L  L STC           AV    TV VV    *DEK  VHM# FI*#  *  R VG  AQST  #   QHNK H#P  T    *LLRQ
Conservation:  7637547439935557576364223121344363655463344564633883587799993979578965280033300110210011023744912311
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH                       EE        
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EHHHHHHHH                       HHHE      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH                                 
DO_DISOPRED3:                                                                   D D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_SPOTD:                                                                               DDDDDDDD DD                
DO_IUPRED2A:                                                                             DDDDDDD                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DDIWPSGGQMTVKDLTAKYTEGGNAILENISFSISPGQRVGLLGRTGSGKSTLLSAFLRLLNTEGEIQIDGVSWDSITLQQWRKAFGVIPQKVFIFSGTF 1300
PathogenicSAV:                                  VR    G   E  R # N   P             NN           #M  S    #         
BenignSAV:                        I                                    L                                           
gnomAD_SAV:    Y V*   DKL     AV HI  RKVTSQKT   VR DK GDF V # LR N  F*VL T   IG   RMN G    # W R*K V  AVT# I     AL
Conservation:  1118953846282485659252514683559855348655859998979998974678563243966169557633454428858898579548574856
SS_PSIPRED:            EEEEEEEEEEE      EEEEEEEEE    EEEEE      HHHHHHHHHHHH     EEE    HHH  HHHHHHHH EE    EE     
SS_SPIDER3:            EEEEEEEEEEE     EEE   EEEE    EEEEE      HHHHHHHHHH      EEEE  EEHHH  HHHHHHHH E     EEE   H
SS_PSSPRED:            EEEEEEEEEEE     EEEE EEEEE    EEEEE      HHHHHHHHHHHH    EEEE        HHHHHHHHH E    EEEE    
DO_DISOPRED3:                                                   D                                                 D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                  GRTGSGKS                                                 
BINDING:                         Y                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKNLDPYEQWSDQEIWKVADEVGLRSVIEQFPGKLDFVLVDGGCVLSHGHKQLMCLARSVLSKAKILLLDEPSAHLDPVTYQIIRRTLKQAFADCTVILC 1400
PathogenicSAV:   #                    P        W P             D              V          P                     E   
gnomAD_SAV:      IV SN EGRGK    #   I    L#  #   F V P G #S QN S NH IF  GC VTRV N  FG*L  N #LL #H  GG     L HFR S  
Conservation:  6499993434382668285678866357767965969293558279768568946768768369586888866546643634566645726823566576
SS_PSIPRED:               HHHHHHHHHHH  HHHHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE
SS_SPIDER3:               HHHHHHHHHH   HHHHH       EEEEE      H HHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE
SS_PSSPRED:               HHHHHHHHHHH HHHHHHH      EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
LIPID:                                                                                                       C     

                       10        20        30        40        50        60        70        80
AA:            EHRIEAMLECQQFLVIEENKVRQYDSIQKLLNERSLFRQAISPSDRVKLFPHRNSSKCKSKPQIAALKEETEEEVQDTRL 1480
PathogenicSAV:                           T                                                     
BenignSAV:                                                         W                           
gnomAD_SAV:      K     KWP*L #   K MW   F    RKK  F W TT##FN    I  # * N      T S        #* RKP
Conservation:  99647655798358556342433756475755834163675722552443524373321223273673865875354644
SS_PSIPRED:       HHHHHH  EEEEEE  EEEE   HHHHH    HHHHHH                      HH HHHH HHHHHH   
SS_SPIDER3:    E   HHHHH  EEEEEE  EEEEE  HHHHH    HHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHEEE  EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                      DD       DDDD    D        DDD
MOTIF:                                                                                      TRL
MODRES_P:                                                 S           S