P14136  GFAP_HUMAN

Gene name: GFAP   Description: Glial fibrillary acidic protein

Length: 432    GTS: 1.825e-06   GTS percentile: 0.589     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 106      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 231      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MERRRITSAARRSYVSSGEMMVGGLAPGRRLGPGTRLSLARMPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETRASERAEMMELNDRFASYIEKVRFLEQQNKALAAE 100
PathogenicSAV:                                                               Q  #  K# ##T ####SD HM E## P  P   P   
BenignSAV:                                                   L                                                     
gnomAD_SAV:        H A   #C  I    V  #  G  C#    #H F P*TSA VL WLYCARVE  S     I SN Q            N K  HL  R   V   Q
Conservation:  0012001101010011111000111111110100100001011010001222121122012321242233134124233442434343033232114013
SS_PSIPRED:                                                        HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                                       HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                                                    EE HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDD                      
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                   
DO_IUPRED2A:   DDD                     DDDD    DDDDDDDDDDD                     D  DD                              D
MODRES_P:            T     S                        S                                           S                  
MODRES_M:                 R                                                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LNQLRAKEPTKLADVYQAELRELRLRLDQLTANSARLEVERDNLAQDLATVRQKLQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLARLDLERKIESLEEEIRFL 200
PathogenicSAV: P                          N                                                                        
BenignSAV:         W        EI                             T           N                                           
gnomAD_SAV:        Q TK A VVEI  T  Q  W W   VITDR#GVV    SPT#  DA      N I  SQ  # KM      V  GIQV# H QK T T  #*NQ S
Conservation:  3211212202122222213321320223021012211111121300220021033134102422331240022243625442532645433361584163
SS_PSIPRED:    HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                                               D               DDD                                
REGION:            RAKEPTKLADV                                                                                     
MODRES_P:               T                                       T                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKIHEEEVRELQEQLARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEWYRSKFADLTDAAARNAELLRQAKHEANDYRRQLQSLTCDLESLR 300
PathogenicSAV:     K #  K                    H   PT  #  D V  P     G   C#     P  PD       L  E          E          
BenignSAV:                           Q  M                                                                    N     
gnomAD_SAV:     T    D Q*  Q VGP LA# Q  A   H ITD     M    TE G   G K R      Y AE  S   DR     QK S      R  I*N  F  
Conservation:  2345455314341311021212432212835435854561665234128214353663553244324326514143157351252544342124543346
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                        DD  DDDDD  DD                      DDDD D                      
REGION:                      LARQQVHVELDVAKPDLTAALKEIRTQYEAMASSNMHEAEEW                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTNESLERQMREQEERHVREAASYQEALARLEEEGQSLKDEMARHLQEYQDLLNVKLALDIEIATYRKLLEGEENRITIPVQTFSNLQIRETSLDTKSVS 400
PathogenicSAV:                              GPK                S HP    PV#V # # #    # ##K#      I #I      I    #  
gnomAD_SAV:    R     A *IH*RQQQ AQQ  N   E      DR R RGK TCY     E RS  Q   M      Q   S     I  MEN  D   QKPC   Q   
Conservation:  3344341554342632130522225223124614221552353256367558526444563653456585456439312510003111110010001000
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE         EEEE         
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHH      EE          E           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           
DO_DISOPRED3:                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDD          DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:     DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDD  DDDD DD DDDDD                                                 DD DDDD  
MODRES_P:                            S                                                           T S               

                       10        20        30  
AA:            EGHLKRNIVVKTVEMRDGEVIKESKQEHKDVM 432
PathogenicSAV:       I    I   WA        L      
gnomAD_SAV:     SY  G VG   M  QN KA    RE      
Conservation:  01100202133333112211101110011111
SS_PSIPRED:         EEEEEEEEE    EEEE   HHHH   
SS_SPIDER3:           EEEEEEEEE  EEEE HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEEEEEEE    EEEEHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDD   D      D DD  DDDDDDDDDB
DO_SPOTD:      DDDDDDDD               DDDD     
DO_IUPRED2A:                      DDDDDDDDDD DD