P15428  PGDH_HUMAN

Gene name: HPGD   Description: 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)]

Length: 266    GTS: 2.492e-06   GTS percentile: 0.804     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 149      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MHVNGKVALVTGAAQGIGRAFAEALLLKGAKVALVDWNLEAGVQCKAALDEQFEPQKTLFIQCDVADQQQLRDTFRKVVDHFGRLDILVNNAGVNNEKNW 100
PathogenicSAV: L                                                                                                   
gnomAD_SAV:    VQ  VE   A    LRV        M    R T    S   A PR   P KP           Y  E K  G AL  A GRL KRN  I KPR SS T  
Conservation:  3020232333243413341303303212233644491501161132117221541232172156723113433452342218524474577785146116
SS_PSIPRED:          EEEE     HHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHH
SS_SPIDER3:         EEEEE      HHHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHHHHHHHHHH     EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHH
SS_PSSPRED:         EEEEEE   HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH     EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                  GAAQGIGRA               DW                         CDV                                   
BINDING:                                                                                                 N         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKTLQINLVSVISGTYLGLDYMSKQNGGEGGIIINMSSLAGLMPVAQQPVYCASKHGIVGFTRSAALAANLMNSGVRLNAICPGFVNTAILESIEKEENM 200
PathogenicSAV:                                        P        R                                           P       
gnomAD_SAV:    G S #N       E   S   #   S S #SV   VL SVRFV I *KLI   L YV A   G  GFTD  V RDM    T TVCF  P    TQ  D #
Conservation:  3135246425253447344336321155189357445645650521128495869376579666361540024386735459944627242112105113
SS_PSIPRED:    HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE  HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEEEE     HHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE   HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HH  HHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE  HHH          HHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                         YCASK                              VNT            
BINDING:                                            S         Q                                                    
ACT_SITE:                                                        Y                                                 

                       10        20        30        40        50        60      
AA:            GQYIEYKDHIKDMIKYYGILDPPLIANGLITLIEDDALNGAIMKITTSKGIHFQDYDTTPFQAKTQ 266
BenignSAV:                N    C   V     S                                       
gnomAD_SAV:     ES#DH  RN HV  HCRF V L   S        G F CT T  I#F   N KEC INL#   A 
Conservation:  624104120110121014242331662433054262235943425004121042141101102111
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH        EEEEE      EE            
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH      EEEEEE     EEE            
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHH      EEEEE     EEE            
DO_DISOPRED3:                                                               DDDDD
DO_SPOTD:                                                                DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                  D