P16499  PDE6A_HUMAN

Gene name: PDE6A   Description: Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha

Length: 860    GTS: 3.665e-06   GTS percentile: 0.964     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 10      BenignSAV: 11      gnomAD_SAV: 514      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGEVTAEEVEKFLDSNIGFAKQYYNLHYRAKLISDLLGAKEAAVDFSNYHSPSSMEESEIIFDLLRDFQENLQTEKCIFNVMKKLCFLLQADRMSLFMYR 100
PathogenicSAV: V           Q                                                                                       
BenignSAV:                                 Q                                                                       
gnomAD_SAV:    TDK A   M    NL    DNE  SFY*WG    N PRV AS MNV     LRN#Q R*  LGF Q    H #A   VSTITRM R   K ELI  LT Q
Conservation:  8223212252167216306510761123122111012100000110002113111373032254400332101261134226334303405543747219
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHH HHHHHHHH     HHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHH HHHHHH       HHHHHHHH                 HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE
DO_DISOPRED3:  DDD                                   D                                                             
DO_SPOTD:      DD                                       DD D DDDDD                                                 
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TRNGIAELATRLFNVHKDAVLEDCLVMPDQEIVFPLDMGIVGHVAHSKKIANVPNTEEDEHFCDFVDILTEYKTKNILASPIMNGKDVVAIIMAVNKVDG 200
PathogenicSAV:  #                                                                                                  
BenignSAV:                                                 T                                                       
gnomAD_SAV:     S   SD T WF SI  G  FKEY AISY   I SMEV  M#P T    T  L#   D  D #G AGM ID* A    S SKI   G L   T ASR   
Conservation:  2777358556267471124034154605217464837385572451265116615404212852448125341724464184404573468344478123
SS_PSIPRED:         EEEEEEEE                  EEEE    HHHHHH     EE           HHHHH    EEEEEEEEEEE    EEEEEEEEE    
SS_SPIDER3:         EEEEEEEE       HHH       EEEE     HHHHHHH   EEE E         HHHHHH      EEEEEEEE    EEEEEEEE     
SS_PSSPRED:         HHHHHHHH                 EEEEE     EE EE    EEE           HHHHHH   HHHHEEE        EEEEEEEEE    
DO_DISOPRED3:                      D                                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SHFTKRDEEILLKYLNFANLIMKVYHLSYLHNCETRRGQILLWSGSKVFEELTDIERQFHKALYTVRAFLNCDRYSVGLLDMTKQKEFFDVWPVLMGEVP 300
BenignSAV:                    S                                                            A               L       
gnomAD_SAV:    Y I R  G TP *  S     T L D     D   LCD*M P #  N   AIMNMKQE L TP   C  P  EGHYA   ET  KQ   EM SF L  A 
Conservation:  2074107413405731433413313522573448377485634567956866895688888559668156246655558885563656552843356625
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE     EE EE         
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEE    EEEEEEEE       
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE         EE         
DO_DISOPRED3:                                                                                              DDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PYSGPRTPDGREINFYKVIDYILHGKEDIKVIPNPPPDHWALVSGLPAYVAQNGLICNIMNAPAEDFFAFQKEPLDESGWMIKNVLSMPIVNKKEEIVGV 400
PathogenicSAV:                                            R                                                        
BenignSAV:       C                                                                                       M         
gnomAD_SAV:      C#LG LG    HC*E  NH  Y#  G    L ## H#     R L F S# VPT  M  VLT   L   R H A    K       L M  E   F M
Conservation:  4516636868675176644653534384546443941699382556845555453776445322552617923448248625357865866553545566
SS_PSIPRED:                 EEHHHEEEE                HHHHH    HHH       EE                      EEEEEEEEEE     EEEE
SS_SPIDER3:               EEEEEHHEEEEE      E        HHHHH  HHHHHHHH    E         H  H         EEEEEEEEEEE     EEEE
SS_PSSPRED:                  HHHHHHHHH                 HHH   HHHHHHH  EE      HHH               EEEEEE          EEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDD                                                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ATFYNRKDGKPFDEMDETLMESLTQFLGWSVLNPDTYESMNKLENRKDIFQDIVKYHVKCDNEEIQKILKTREVYGKEPWECEEEELAEILQAELPDADK 500
BenignSAV:                                                                                                H        
gnomAD_SAV:    VI  SH# E S   V QMFIQ  AHC D  L*SSE CK      Y    S V  #   T  K    QFM  K MC T# L S       V H   A    
Conservation:  5565693756775425515364676689973664755744644433746435454443473125421693333132123047442450057011571201
SS_PSIPRED:    EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH HH         HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH H    HHHHH        HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHH     H H
SS_PSSPRED:    EEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH       
DO_DISOPRED3:                                                  BBBBBBBBBD DDD                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                 D                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YEINKFHFSDLPLTELELVKCGIQMYYELKVVDKFHIPQEALVRFMYSLSKGYRKITYHNWRHGFNVGQTMFSLLVTGKLKRYFTDLEALAMVTAAFCHD 600
PathogenicSAV:                                            W                        K   P                           
gnomAD_SAV:     K    R GV SVA MG L      H Q    EN R       W T FPCNC HE  HY RWQDL LEKA LP   M#R NLCSMN  TMD # VD   Y
Conservation:  1473283858311551286348634755545727746735595654464366592644558455555655544673761542544576346555676688
SS_PSIPRED:      EEE EE      HHHHHHHHHHHHHH   HHH    HHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH  HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:        EE        HHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:         EE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHEE   HHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                                                       H                                   HD
ACT_SITE:                                                                H                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IDHRGTNNLYQMKSQNPLAKLHGSSILERHHLEFGKTLLRDESLNIFQNLNRRQHEHAIHMMDIAIIATDLALYFKKRTMFQKIVDQSKTYESEQEWTQY 700
PathogenicSAV:                                                                                     M               
gnomAD_SAV:    # D DS#KP  I    LM N    FT DGY  Q  RI   # R #M    SCQ Y#R  #LT      A  V  LN TMV#   M #     G #   K 
Conservation:  6886964795736823567566656458868843653662451578434544281414345355496778979567684575767633204230132415
SS_PSIPRED:           HHHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHH   HHHHH    HHHHHHHHHHHHHH       E    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH      HHHHHHH
SS_PSSPRED:           HHHHHHH  HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MMLEQTRKEIVMAMMMTACDLSAITKPWEVQSQVALLVAAEFWEQGDLERTVLQQNPIPMMDRNKADELPKLQVGFIDFVCTFVYKEFSRFHEEITPMLD 800
BenignSAV:                                                      H                                                  
gnomAD_SAV:    #I Q  W K II  T  T     VIRSR               K  G KCMM  R L#       G *VR  * S T     YL T   CL#G  N#V Y
Conservation:  4315366887669779857756644797565446433583869468696324634288548691423698869799959995766674545604438523
SS_PSIPRED:    H   HHHHHHHHHHHHHHHHH HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH     HH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    H   HHHHHHHHHHHHH    H     HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHH             HH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HH  HHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                        DDDDDDDD DDD                                   
METAL:                            D                                                                                

                       10        20        30        40        50        60
AA:            GITNNRKEWKALADEYDAKMKVQEEKKQKQQSAKSAAAGNQPGGNPSPGGATTSKSCCIQ 860
BenignSAV:                               Q                      V          
gnomAD_SAV:    RTAS C    VP G     T     TM    L    VSE  L EI R AVP  T   R *
Conservation:  541284148314432443312112211111111200000012222112220111022012
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                       
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   H                        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                    EEE 
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
PROPEP:                                                                 CIQ
LIPID:                                                                 C