P16615  AT2A2_HUMAN

Gene name: ATP2A2   Description: Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2

Length: 1042    GTS: 6.867e-07   GTS percentile: 0.098     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 51      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 247      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MENAHTKTVEEVLGHFGVNESTGLSLEQVKKLKERWGSNELPAEEGKTLLELVIEQFEDLLVRILLLAACISFVLAWFEEGEETITAFVEPFVILLILVA 100
PathogenicSAV: L                     E               T                         S       S                           
BenignSAV:                                    F                                                                    
gnomAD_SAV:          TSL K  SY                F  S      L      V    L     M          V           G VI            A 
Conservation:  6212211111223012131211343122210212142122685446654538728994698989966994596496565444353756769477567745
STMI:                                                          MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:       HHH  HHHHHHHH    HH   HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        H   HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHH  HHHHHHHH         HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DD                                                                                                  
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:   D                                                                                                   
MODRES_P:                                           S                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NAIVGVWQERNAENAIEALKEYEPEMGKVYRQDRKSVQRIKAKDIVPGDIVEIAVGDKVPADIRLTSIKSTTLRVDQSILTGESVSVIKHTDPVPDPRAV 200
PathogenicSAV: S                   D         Q                        V   L                         P              
gnomAD_SAV:      V  I   KH          C   I       SRN  Q   R V       V         T     R  A      V        V     I   QV 
Conservation:  7545647823344455458545554475525134224436443333755445433523133534531537748878886958574754443444433656
STMI:          MMMMMMMMMM                                                                                          
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE    EEEEE HHH     EEEEE   EE   EEEEEEEE  EEEEEHHHH   EEEE            
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHHHHHHHHH      EEEE  EEEEEEE HHH     EEEEEEE E     EEEEEE   EE EE     EEEEEE E          
SS_PSSPRED:    HHHHHEHHHHHHHHHHHHHHHH     EEE    HHHEE          EEEEE   EEE  EEEEEEEE   EEEEE     EEEEE            
DO_DISOPRED3:                                                                                 DDDDDDDDDDD          
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                             DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NQDKKNMLFSGTNIAAGKAMGVVVATGVNTEIGKIRDEMVATEQERTPLQQKLDEFGEQLSKVISLICIAVWIINIGHFNDPVHGGSWIRGAIYYFKIAV 300
PathogenicSAV:           D           #                                            F                                
gnomAD_SAV:                      GV       A            G      T                 VT            S            V       
Conservation:  5567583665645745965384545552178687863544333334579626555663558355444844563464588448468767448846454655
STMI:                                                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMM
SS_PSIPRED:          EEE   EEE  EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          EEEE EE    EEEEEEEEE    HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEE   EE    EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                            DDDD D DDDD                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDD                                  D             D                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALAVAAIPEGLPAVITTCLALGTRRMAKKNAIVRSLPSVETLGCTSVICSDKTGTLTTNQMSVCRMFILDRVEGDTCSLNEFTITGSTYAPIGEVHKDDK 400
PathogenicSAV:          V       R                             T        K                                           
gnomAD_SAV:         T                         V                           H     V      K  IGA   LAV#      V K R    
Conservation:  8658665844656666676584546764636756347457779655467565696676576663666443132110506136354753548263511110
STMI:          MMMMMMMMMMMMM                                                                                       
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EE     HHH     EEEE          EEEEEEEEE EE     EEEEEEEEE     EEEEEE  E
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHH HHHHHHH   EE     H H   EEEEE          E EEEEEEEE        EEEEEEE  E E     EEE  E
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE            EEE            EEEEEEE            EEEEEEEEE    EEE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                           T                                               
METAL:            VA I E                                         D T                                               
ACT_SITE:                                                        D                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PVNCHQYDGLVELATICALCNDSALDYNEAKGVYEKVGEATETALTCLVEKMNVFDTELKGLSKIERANACNSVIKQLMKKEFTLEFSRDRKSMSVYCTP 500
PathogenicSAV:            G                                                                                  F     
gnomAD_SAV:    SE                           TN M      V     A           K #D  ET C #              I    C    V   G  
Conservation:  1414312546365334445755847544435245784866875764676867554243311541376523742353364363368588797666864833
SS_PSIPRED:    E  HHH HHHHHHHHHHHHH   EEEE      EEE   HHHHHHHHHHHH    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE        EEEEE  
SS_SPIDER3:    EE H H HHHHHHHHHHHH    EEEEE    EEEEE  HHHHHHHHHHHH    HHH     HHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE       EEEEEE  
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHHHHHHH           EEEEEEHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH HHHE          EEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                    DD 
BINDING:                                                E                                              R           
MODRES_P:                                              T                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NKPSRTSMSKMFVKGAPEGVIDRCTHIRVGSTKVPMTSGVKQKIMSVIREWGSGSDTLRCLALATHDNPLRREEMHLEDSANFIKYETNLTFVGCVGMLD 600
PathogenicSAV:                                                            R                             P          
BenignSAV:                                               E                                                         
gnomAD_SAV:    D    A #  V                   R   AL  R E E      D    RN M   T     S       YVQ          Y   I  A    
Conservation:  1221112134686867986556680349372043242012633542266455391566566557637262133150625331921771257756688777
SS_PSIPRED:             EEEE   HHHHHHH  EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEEEE    HHH      HHHHHHH   EEEEEEE   
SS_SPIDER3:            EEEEEE   HHHHH   EEEE  EEEE  HHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEEEE    HHH     HHHHHHHHH  EEEEEEE   
SS_PSSPRED:            EEEEE   HHHHHHH  EEEE   EEE  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHEEEE               HHHHHHHH HEEEEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:           DD                                                             D                            
BINDING:                    K                                            R                                         
REGION:                                                                                  MHLEDSANFIKYETNLTFVG      
MODRES_P:                                    S                                                S                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPRIEVASSVKLCRQAGIRVIMITGDNKGTAVAICRRIGIFGQDEDVTSKAFTGREFDELNPSAQRDACLNARCFARVEPSHKSKIVEFLQSFDEITAMT 700
PathogenicSAV:  L                      AE                                             P  S       E       P      V  
BenignSAV:                                          V                                                I             
gnomAD_SAV:        K VA M   Q    W V T      A     HHV   RRV GMM   Y  Q     HT V #Y     H            MIG   CSH      
Conservation:  7771772155138116964666856367365355644458512155500344897896563111821651053967985946554765396424778977
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH   EEEEE    HHHHHHHHHHH            EEEHHHHHH  HHHHHHHH   EEEE   HHHHHHHHHHHHH   EEEEE
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHH   EEEEEE   HHHHHHHHHHH            EE  HHHH   HHHHHHHH    EEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEE
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHH  EEEEEE   HHHHHHHHHHH               HHHHHH  HHHHHHHHHH EEEE    HHHHHHHHHHHHH  EEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                      DD                                               
BINDING:                                                                                   R     K                 
MODRES_P:                                                                    S                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDGVNDAPALKKAEIGIAMGSGTAVAKTASEMVLADDNFSTIVAAVEEGRAIYNNMKQFIRYLISSNVGEVVCIFLTAALGFPEALIPVQLLWVNLVTDG 800
PathogenicSAV:  N                                          D   RW              # # R                        DS     
gnomAD_SAV:       M  V           V            I  E          I                     I K             K  V  H          
Conservation:  7797667979797767556668469775966667557666646566766667649667777979977777979664465654544667666765497796
STMI:                                                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM          MMMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:           HHHHH   EEEE    HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HH  HHHHHHHH     
SS_SPIDER3:       HH  HHHH    HHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:           HHHHHHHHEEE     HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:           N                                                                                               
REGION:                                                                                              IPVQLLWVNLVTDG
METAL:          D                                                                N  E                        N  TD 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LPATALGFNPPDLDIMNKPPRNPKEPLISGWLFFRYLAIGCYVGAATVGAAAWWFIAADGGPRVSFYQLSHFLQCKEDNPDFEGVDCAIFESPYPMTMAL 900
PathogenicSAV:   T                                  P    F                               G                        P
gnomAD_SAV:                R         SE     R    H MTV W   T    V       T      F#    R       SQ#   M         A  V  
Conservation:  5977979666796778272885436698636954885475377736675884698323138816553753554572233316143261574432766766
STMI:          MMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              MMMM
SS_PSIPRED:      HHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHH              HH      HHHHH
SS_SPIDER3:       HHH       HHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHE                    HHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHH                           HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                     DD                                                                                
REGION:        LPATALG                                                                                             
DISULFID:                                                                                C           C             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVLVTIEMCNALNSLSENQSLLRMPPWENIWLVGSICLSMSLHFLILYVEPLPLIFQITPLNVTQWLMVLKISLPVILMDETLKFVARNYLEPGKECVQP 1000
PathogenicSAV:            P       Y                      R                               R                         
BenignSAV:                                                                                      M               L  
gnomAD_SAV:     AV         S   K E S  I     V  M        F      FK F     V L  M    TL E      F   M     #SC  S  V#L* 
Conservation:  6677655558585756546754477762527944662494399747754466745543234200262343434394323541443255130410000000
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHH       E       HHHHHHHHHHHHHHHHHH  H HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                                               DDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                 DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                      WLVGSICLSMSL                                                          
METAL:               E                                                                                             

                       10        20        30        40  
AA:            ATKSCSFSACTDGISWPFVLLIMPLVIWVYSTDTNFSDMFWS 1042
BenignSAV:        Y                                      
gnomAD_SAV:    VN Y L P #I##V  R L  V         #    GNIL  
Conservation:  000000000003133333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:                   HHHHHHHHHHHHHHH     HHHH   
SS_SPIDER3:                    HHHHHHHHHHHHHH       H    
SS_PSSPRED:                    HHHHHHHHHHHEEEE    HHHHH  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                               
DO_IUPRED2A: