P17480  UBF1_HUMAN

Gene name: UBTF   Description: Nucleolar transcription factor 1

Length: 764    GTS: 3.904e-07   GTS percentile: 0.022     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1            gnomAD_SAV: 172      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MNGEADCPTDLEMAAPKGQDRWSQEDMLTLLECMKNNLPSNDSSKFKTTESHMDWEKVAFKDFSGDMCKLKWVEISNEVRKFRTLTELILDAQEHVKNPY 100
gnomAD_SAV:         # T E          #                                        G            L                    I    
Conservation:  3222122220110211001209256545287427522661180246664865548368382065544953890358144985977595626725235694
SS_PSIPRED:                           HHHHHHHHHHHHHH                 HHH       HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:               H           HHHHHHHHHHHHH                  HHH       HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                           HHHHHHHHHHHHHH                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDD D                                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                              DDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      DDDDDD D                                                 DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGKKLKKHPDFPKKPLTPYFRFFMEKRAKYAKLHPEMSNLDLTKILSKKYKELPEKKKMKYIQDFQREKQEFERNLARFREDHPDLIQNAKKSDIPEKPK 200
gnomAD_SAV:                        C  T         Y      N              RR                Q                  L V     
Conservation:  6554462675785566564457527444555554975433564544627736956479169424934753162123146422463523213333244374
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH           
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHH HHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH          
SS_PSSPRED:                     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH          
DO_DISOPRED3:      DDDDD D                                DDD       D                               DDDDDDDDDDDD D 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDD                                                                               D         
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                                                                   D      DD  DDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:                 PKKPLTPYFRFFMEKRAKYAKLHPEMSNLDLTKILSKKYKELPEKKKMKYIQDFQREKQEFERNLARFR               PEKPK

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TPQQLWYTHEKKVYLKVRPDATTKEVKDSLGKQWSQLSDKKRLKWIHKALEQRKEYEEIMRDYIQKHPELNISEEGITKSTLTKAERQLKDKFDGRPTKP 300
PathogenicSAV:          K                                                                                          
gnomAD_SAV:            Q R L         #             F                 Q              M M    L   I   T               
Conservation:  6655646266541374126364055565243457457446565878257883240533167231314941322111006449686895968646858388
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH         
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                          D                                             DDDDDDDDDDDDD    D            
DO_SPOTD:                                                                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_IUPRED2A:   DDD              DD      D DDDDD                                      D  DDDDD  DD DDDDDDDDDDDDDDD D
DNA_BIND:      TPQQLWYTHEKKVYLKVRPDATTKEVKDSLGKQWSQLSDKKRLKWIHKALEQRKEYEEIMRDYI                                 TKP
MODRES_P:      T                                                                       S                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PPNSYSLYCAELMANMKDVPSTERMVLCSQQWKLLSQKEKDAYHKKCDQKKKDYEVELLRFLESLPEEEQQRVLGEEKMLNINKKQATSPASKKPAQEGG 400
gnomAD_SAV:                  T          M               V          E     FH    VS    E          V   R N      LT# VV
Conservation:  9457657794946427643744475449876991633146626554852596465346135425662487385308351240222131332134122111
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH                  
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH H                  
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH                    
DO_DISOPRED3:                                                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   D  DDDDD            D                     D DDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:      PPNSYSLYCAELMANMKDVPSTERMVLCSQQWKLLSQKEKDAYHKKCDQKKKDYEVELLRFL                                      
MODRES_P:                                         S                           S                        S           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGGSEKPKRPVSAMFIFSEEKRRQLQEERPELSESELTRLLARMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSERKPGGEREERGKLPESPKRAEEIWQQSVIGDY 500
gnomAD_SAV:     R  K   W #           Q   K         V HV   L              Q       T#KRSSRQC D S   KF R              
Conservation:  8211125343344557556646155324345546655540854464553554334432260124363653522311222356436645643532362466
SS_PSIPRED:                HHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH          HHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH       H H          HHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHH         HHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDD                                             DDDD          DDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                           DDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
DNA_BIND:            PKRPVSAMFIFSEEKRRQLQEERPELSESELTRLLARMWNDLSEKKKAKYKAREAALKAQSERKPGGER      PESPKRAEEIWQQSVIGDY
MODRES_P:                 S                    S S                                                S          S     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LARFKNDRVKALKAMEMTWNNMEKKEKLMWIKKAAEDQKRYERELSEMRAPPAATNSSKKMKFQGEPKKPPMNGYQKFSQELLSNGELNHLPLKERMVEI 600
gnomAD_SAV:             R  N L         E R        K         T              V      R   L            S      L        
Conservation:  4553434815431253248227666655386666546566656552525233013211651663545445523645286465442446247335245343
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH             HHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHH    HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                          HHHHHHHHHHH        HHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHH             HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDD DDDDDBDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_SPOTD:      D  D    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                              
DO_IUPRED2A:                 DDD            D          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DD D   DDD   DD
DNA_BIND:      LARFKNDRVKALKAMEMTWNNMEKKEKLMWIKKAAEDQKRYERELSEMR                  KKPPMNGYQKFSQELLSNGELNHLPLKERMVEI
MODRES_P:                                                   S                                     S                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSRWQRISQSQKEHYKKLAEEQQKQYKVHLDLWVKSLSPQDRAAYKEYISNKRKSMTKLRGPNPKSSRTTLQSKSESEEDDEEDEDDEDEDEEEEDDENG 700
gnomAD_SAV:     T   HV  T     R   DQ       Q          RAC        S H R# R  C  A   Q     EL  K #G Q   EG  EA#  E K #
Conservation:  4257433431346294436633412542162074244543443281522328541025113203820222231332232434534322234345423332
SS_PSIPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH                                                
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH    H                                              
SS_PSSPRED:    HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH                                                  
DO_DISOPRED3:                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD  D  DDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DNA_BIND:      GSRWQRISQSQKEHYKKLAEEQQKQYKVHLDLWV                                                                  
MODRES_P:                                           S                                                              

                       10        20        30        40        50        60    
AA:            DSSEDGGDSSESSSEDESEDGDENEEDDEDEDDDEDDDEDEDNESEGSSSSSSSSGDSSDSDSN 764
gnomAD_SAV:    N   E SN# D G QNKC   NG   E QNDENED  E VGE  TD CG T    RAP   E #
Conservation:  2232112442223334432444311021233332243212243222221221331112200210
SS_PSIPRED:                                                                    
SS_SPIDER3:                                                                    
SS_PSSPRED:                                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD