P18074  ERCC2_HUMAN

Gene name: ERCC2   Description: General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPD

Length: 760    GTS: 3.501e-06   GTS percentile: 0.955     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 32      BenignSAV: 9      gnomAD_SAV: 462      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKLNVDGLLVYFPYDYIYPEQFSYMRELKRTLDAKGHGVLEMPSGTGKTVSLLALIMAYQRAYPLEVTKLIYCSRTVPEIEKVIEELRKLLNFYEKQEGE 100
PathogenicSAV:                                               R                            A                        
BenignSAV:                    C                                                                              G  D  
gnomAD_SAV:    #N  L     # T  C  SAE P L#* TCM  T  R I            P  P K   G  L V          LS     V  P*   SLSG LDDK
Conservation:  2363334446146344556644353235324445244466445485545454356323310103122121444434465355524676563242134142
SS_PSIPRED:      EEE  EEEE       HHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:     EEEE  EEEE       HHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE  E   HHHHHHHHHH H HHHH    
SS_PSSPRED:     EEEE  EEEE       HHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE     HHHHHHHHHHHH HHHHHH   
DO_DISOPRED3:  D                                   DDDDDDDDDDDDDD DD  D                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                MPSGTGKT                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLPFLGLALSSRKNLCIHPEVTPLRFGKDVDGKCHSLTASYVRAQYQHDTSLPHCRFYEEFDAHGREVPLPAGIYNLDDLKALGRRQGWCPYFLARYSIL 200
PathogenicSAV:            H                                                                                        
BenignSAV:                                                                                                       M 
gnomAD_SAV:    T L    T T H     R DMIL H     N  W    V C GV * YN  R Y * C     R HQML  T   SVE  TT  QCR * S  V Q #  
Conservation:  0203464344383248343362223264468447335795345242104111408256746511644264428343463551242114477763563341
SS_PSIPRED:          EE                     HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHH             HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  
SS_SPIDER3:               H H     H         HHHHHHHHH HHHHHHH           HHHHHH             HHHHHHHHHHH    HHHHHH   
SS_PSSPRED:                                 HHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH            HHHHHHHHHHH    HHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                        C                 C                    C                                  C          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            HANVVVYSYHYLLDPKIADLVSKELARKAVVVFDEAHNIDNVCIDSMSVNLTRRTLDRCQGNLETLQKTVLRIKETDEQRLRDEYRRLVEGLREASAARE 300
PathogenicSAV:                                  N                        Y                                         
BenignSAV:     Y                                                                                                   
gnomAD_SAV:    YVI  I        S   #M A  VTHTV M  N    VET  TG T ISF  GI NQY    K           I  PH WV   H #VV  K   S##
Conservation:  3766777574777997572163234352466576776665245335534433433433521521141015212322843492265124335432422533
SS_PSIPRED:       EEEEE HHHH HHHHHHH HHHH   EEEE     HH  HHHHH EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    E  EEEEEHHHH  HHHHHHHHHHH   EEEEEE    HHHHHHH   EEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:       EEEEE HHH  HHHHHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHE EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                     D
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                          DEAH                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDAHLANPVLPDEVLQEAVPGSIRTAEHFLGFLRRLLEYVKWRLRVQHVVQESPPAFLSGLAQRVCIQRKPLRFCAERLRSLLHTLEITDLADFSPLTLL 400
BenignSAV:                N                                                                                        
gnomAD_SAV:    M     K  M YQ  EDT   FT M G       Q   NM    C *    *         V #A   CQ  K    C PY  YA    YF  L L IF 
Conservation:  2314432544512351222862562723443342433445523352243154342355223023444344447682686338326543233334354263
SS_PSIPRED:      HHHH     HHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE  HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
SS_SPIDER3:     HH        HHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHH   HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH      HHH  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE  HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHH
DO_DISOPRED3:     DD D                                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ANFATLVSTYAKGFTIIIEPFDDRTPTIANPILHFSCMDASLAIKPVFERFQSVIITSGTLSPLDIYPKILDFHPVTMATFTMTLARVCLCPMIIGRGND 500
PathogenicSAV:                                                             V                       P G             
BenignSAV:                                                   I                                                     
gnomAD_SAV:        IPI   T VSA   D  HN  LIT#SLN      #TL  VE I  #  YAVM    V   Y# LE   L SIS  A  #  TQ S   #FV C I 
Conservation:  2264682456138334535654222423038432524354645346563655666676647695648944868365524763756343636944335656
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH     EEEEEE           EEEEEE    HHHHHHHH   EEEE        HHHHHHH    EEEEE         EEEEEEEE   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH     EEEEEEE       E   EEEEEE    H HHHHH    EEEEE        HHHHHH     EEEEE E      EEEEEEEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH      EEEEE            EEEEEE  HHHHHHHHHHH  EEEEE       HHHHHH     EEEEEE EEE     EEEEE     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QVAISSKFETREDIAVIRNYGNLLLEMSAVVPDGIVAFFTSYQYMESTVASWYEQGILENIQRNKLLFIETQDGAETSVALEKYQEACENGRGAILLSVA 600
PathogenicSAV:           Q                             RC   K                                             P P      
gnomAD_SAV:    PAVV F   AQ  T  M#    F     T ## S M #  G P L#G MV *  K        T    T   G #K  ITP    V FK  GRVM     
Conservation:  6554683553435335266542473334334767363674660446233335323667335433897767757335753664353364215443433333
SS_PSIPRED:       EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEE   HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH  EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE
SS_SPIDER3:      EEEEEE E   HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEE  HHHHHHHHHHHHH   HHHHH   EEEEE     HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE
SS_PSSPRED:       EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH  EEEE     HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RGKVSEGIDFVHHYGRAVIMFGVPYVYTQSRILKARLEYLRDQFQIRENDFLTFDAMRHAAQCVGRAIRGKTDYGLMVFADKRFARGDKRGKLPRWIQEH 700
PathogenicSAV: #D             #                   W                     #    R  W      G       N #                 
BenignSAV:                    C                                                                                    
gnomAD_SAV:    LDT    #  AY CRW  NT VI  I IH H  QVW    WYH   CK    IL  VC #G#RADW   S A    IAL NTLC #E  Q N SH*    
Conservation:  6643455335347577475576394579495755566443543334456479375777556775753443737774545952954736644688465342
SS_PSIPRED:                    EEEEE         HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEEHHH    HH    HHHHHH
SS_SPIDER3:       EE  E        EEEEEE        HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHH     EEEEEEE HH        H  HHHHHH
SS_PSSPRED:                    EEEEE         HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEE     HHHHH   HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                                                                                          KRFARGDKRGKLPR     

                       10        20        30        40        50        60
AA:            LTDANLNLTVDEGVQVAKYFLRQMAQPFHREDQLGLSLLSLEQLESEETLKRIEQIAQQL 760
PathogenicSAV:             R        W  P                                   
BenignSAV:                                                       Q         
gnomAD_SAV:     I #TF# IM##DI*#G C  W*TPET #Q GE   A  RV  PQ D M * LQ* PP  
Conservation:  423535585444343335285524536303343442433233453222122420232210
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH HHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:             HHHHHHHHHHHHHH      H H        HHHHH  HHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHH     HHHHHHHHHHHHHHH     HHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                    DDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: