P18206  VINC_HUMAN

Gene name: VCL   Description: Vinculin

Length: 1134    GTS: 1.542e-06   GTS percentile: 0.467     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 446      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKETVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPY 100
BenignSAV:                                                                              V                          
gnomAD_SAV:          HK  NV         Y           SE          T   G  S F      A   G#       L    Q    F    R# *I  *   
Conservation:  5211322110122324236341421333433347323332101101202101111055445747754327342322593376354337536414623475
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:       EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DD    DDDDDDDDDD D         DDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                    DDD                                
MODRES_P:                                                                                                      S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVPARDYLIDGSRGILSGTSDLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQELTHQEHRVMLVNSMNTVKE 200
gnomAD_SAV:        *                             T  GRR   H I     G L   F  A     RI EV    GD E  IIY*D *#   S I IL  
Conservation:  4657776675747997799999999977779776797677667573746397763795799777667467647664473645636756266346646674
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                         D   DDDDD      DD             
MODRES_A:                                                                              K                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIR 300
PathogenicSAV:                                                                             M                       
BenignSAV:                                      L                                                                  
gnomAD_SAV:       LVS  V  SAII #   E T  T   HHYAAG    A    THM R   R    *    S   R GSV # ARM    C  H  #   E D DR   
Conservation:  7966666433454355211327347624791563377637629566796775777737446747556949429476403893952661306931763756
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                           D                                                       DDDDDDDDDDDD DDDDD D
MODRES_P:                                                                 S           S  S            S S          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGLDVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNG 400
gnomAD_SAV:    R      I S   E TQCG   E       T N  V  CVT  AP L TT  V  I  #            C   D I       R  #V       SHC
Conservation:  4779997776977473767543463436664766535183996913413364636536977391377339337652342564343732534428755636
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   D                                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              D DDDDDDD  DD    DDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                   S                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLEGKIEQA 500
gnomAD_SAV:     L     V*D  V  W      G     ENSVHY  KLP     S   #  #      GQ  TEP  M Q  V NR S#        E   Q    T   
Conservation:  3167542632361763579467756475476577325432453563465416665455492626444337557939534374737636346464773777
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                    DD DDD D                        DDDDDDDDDDDDD   DD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD       DD  DD        DD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       
MODRES_P:                                       S                                                                  
MODRES_A:                                                                                                     K    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFS 600
PathogenicSAV:           Y                                                                                         
gnomAD_SAV:    RW T D  M  C  S   LQ    DE H    #  H Q EVPT  #*L E     S    G  W I   #  GF    F    Q L  KTV      A R
Conservation:  3573266234426552234566449759751242642955735397347374229556737943746463447059443763441266446663676477
SS_PSIPRED:    HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:  DD D DDD                                                                                            
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD      DDD                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDDDD  DDDDDDDD  
MODRES_P:                                          Y                                    S    S                    S

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKN 700
gnomAD_SAV:    E #ARV       MV   E #KKV  N  TG  A R  QVS M KTV V A     IA   R  L M L   H   L  C F M       H     I K
Conservation:  7676975735544649234437144927972397297279759979999795597277979775795597759775575777959997557157777979
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                   DD     D                                                                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:            DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDD  D DDDD DDDDDD     DDDDDD                            DD     
MODRES_P:         T                                                                   T                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMD 800
gnomAD_SAV:    P  E         GK T   C      K# E    ER        HH P      M CW  W   M N       N   HK L T   K R N  #VAVV
Conservation:  7979959779357779999779739995997597799337727299999979999999999975999977597797757551552945277247999942
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                      D      DDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDD   
REGION:                                                MANIQPQMLVAGATSIARRANRIL                                    
MODRES_P:                          S                                                                         S     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM 900
gnomAD_SAV:    T T V    NR P R   N  HWM         GV   V H LL  S     GI    VL     R     L    L     D               I 
Conservation:  9979953934413672776531444245337444634466477646836219242521599599576955797599797667557533326325447574
SS_PSIPRED:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHH                                 HH       HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HH HHH                              HH        HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHH HH                            HHH        HHHH
DO_DISOPRED3:                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                          DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDD  DDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:              S            Y                                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AARQLHDEARKWSSKPGIPAAEVGIGVVAEADAADAAGFPVPPDMEDDYEPELLLMPSNQPVNQPILAAAQSLHREATKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAE 1000
PathogenicSAV:                                                                           W                         
BenignSAV:                                      V        A                                                         
gnomAD_SAV:       E  Y  G  A  L    T  #M   V   VVNPT    HA T     SG MI# P# A D S  TT# T  L              V R   R V  
Conservation:  6666665773557573333323222002131322321441222515974775542452444754575799759957947979999597577777777777
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH       HHH       HHHHHHH             HHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH        HHHH        HHHHH               H            HHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH        HHH       HHHHHH              HHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     D                 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDD      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD  DDDDDD  DDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQ 1100
gnomAD_SAV:      W     I N     H  RY T       #   D  N               GQ        R           W      K#    D           
Conservation:  5777779457597957577779775777773497795979795777555757557577755577779774477577757775977775455555755775
SS_PSIPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:               DDDD DDDD                                                 DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                               DDDDD  DDDD  DD         

                       10        20        30    
AA:            SVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ 1134
gnomAD_SAV:     A    W      V          C      G  
Conservation:  7555559555797575745373553547555445
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEE      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH   H   EEEEE       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH        EEEEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DDDD
DO_SPOTD:                                    DDDD
DO_IUPRED2A:     D                               
REGION:                           AGFTLRWVRKTPWYQ
MODRES_P:                                      Y