P18850  ATF6A_HUMAN

Gene name: ATF6   Description: Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha

Length: 670    GTS: 1.014e-06   GTS percentile: 0.230     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 3      BenignSAV: 8      gnomAD_SAV: 333      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGEPAGVAGTMESPFSPGLFHRLDEDWDSALFAELGYFTDTDELQLEAANETYENNFDNLDFDLDLMPWESDIWDINNQICTVKDIKAEPQPLSPASSSY 100
BenignSAV:                    I                                                  #                                 
gnomAD_SAV:    R *STVFS  #  # T   SY  G YGG  V T  S         S   D KC       GLAFH V        VS    I   T            NF
Conservation:  1111111111111110101111111112112312201001112100110111111011143211223242110110112112215112313637612312
SS_PSIPRED:                              HHHHHHHHH      HHHHHHHH                                 HHH               
SS_SPIDER3:                              HHHHHHHH      HHHHHHHH                                  HHH               
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHHH      HHHHHHHHH                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  D  DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD  D                                 D DDDD                                 DDDDD DDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SVSSPRSVDSYSSTQHVPEELDLSSSSQMSPLSLYGENSNSLSSAEPLKEDKPVTGPRNKTENGLTPKKKIQVNSKPSIQPKPLLLPAAPKTQTNSSVPA 200
BenignSAV:                                                 P           S                                           
gnomAD_SAV:      L  Q AG            Y    Y V #H FHS D S P LGG    EE    S  E     IQ   VRL     V*      AGT# N  K G SE
Conservation:  3115314233117121211512121222154253333110121120111101111210011111102131121123324454323423221232222233
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD DD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KTIIIQTVPTLMPLAKQQPIISLQPAPTKGQTVLLSQPTVVQLQAPGVLPSAQPVLAVAGGVTQLPNHVVNVVPAPSANSPVNGKLSVTKPVLQSTMRNV 300
BenignSAV:                                           A                                      V                      
gnomAD_SAV:      VT #  SM TS     SV G*  #RA   M  P   AAI      I   P L V   E     L  AA  I   LV R  TR  PE     R  VI  
Conservation:  3345643453354212213343323532142233433323445224321423351113211101122121212213112131121321122112221221
SS_PSIPRED:    EEEEEE       HHH               EEEE                   EEEE                                          
SS_SPIDER3:       EE          H               EEE                     E      E                                     
SS_PSSPRED:     EEEE                          EEEE                                                                 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                   DDDDDDD  DDDD  D DDDD                               DDDDDDDDD  DDDDDDDDDD   D       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSDIAVLRRQQRMIKNRESACQSRKKKKEYMLGLEARLKAALSENEQLKKENGTLKRQLDEVVSENQRLKVPSPKRRVVCVMIVLAFIILNYGPMSMLEQ 400
PathogenicSAV:                        C               P                                                            
BenignSAV:                                                                                                     I   
gnomAD_SAV:    SL    PK R CKL  Q   RH CNN         V  RT     K  #  D    Q  V  M #  S *    T*     TMA  CV  SC #V V   
Conservation:  2242233569686679775744885568654339524832661572163177218423541421651075232365644744444463346246243132
STMI:                                                                                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM  
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH   
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHEHE  HHHHH   H      
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         EEEEEHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    DDDDDDDDD                       DD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                 DDDDDDDD  DD                DDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD                               D
REGION:                                                       LKKENGTL                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DSRRMNPSVSPANQRRHLLGFSAKEAQDTSDGIIQKNSYRYDHSVSNDKALMVLTEEPLLYIPPPPCQPLINTTESLRLNHELRGWVHRHEVERTKSRRM 500
gnomAD_SAV:      #     MNR Y          EDS   L  #N EKN K GD ILSG G IMP   A     AS  RSR     P    Y  Q     LKI   E   L
Conservation:  1110001011111138588351101100101000211002100112213474523332444123338372683865456546646634664225441121
SS_PSIPRED:                          HHH                       HHH                        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                                                    HHHHH                     HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHH    
SS_PSSPRED:                                                                             HHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      D DDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDD DDD                         DD     DDDD              DDDDDDDDDDD
SITE:                            LG                                                                                
CARBOHYD:                                                                             N                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TNNQQKTRILQGALEQGSNSQLMAVQYTETTSSISRNSGSELQVYYASPRSYQDFFEAIRRRGDTFYVVSFRRDHLLLPATTHNKTTRPKMSIVLPAINI 600
PathogenicSAV:                                                                   N                                 
gnomAD_SAV:     DSPP NC PRD   RD    R S     I G   G   GK  A* T RG     L P H   N  S    #K# P   T #          V    V  
Conservation:  2311131221132012111222432221011112111111143452231113126554638537788577766546686643555536555654574323
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHH       EE                 EEE       HHHHHHHHHH    EEEEEE     EEE          EEEEEE     
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHH                              EEEE      HHHHHHHHH    EEEEEE     EEEE          EE EE      
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH HH                           EEE    HHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE    EE             EEEE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDD      DDD DDDDDDD D                                             DDDDDD  D D DDD       
CARBOHYD:                                                                                         N                

                       10        20        30        40        50        60        70
AA:            NENVINGQDYEVMMQIDCQVMDTRILHIKSSSVPPYLRDQQRNQTNTFFGSPPAATEATHVVSTIPESLQ 670
gnomAD_SAV:    SD   SE Y # T# F   L  AM      L  T * *#    P    #D SSE I E DI  NV#   K
Conservation:  3322111143324344343333342433333333213310122111121111111010011102112211
SS_PSIPRED:             EEEEEEEEEEEE  EEEEEE     HHHH                                
SS_SPIDER3:              EEEEEEEEEEE EEEEEEE     HHH                                 
SS_PSSPRED:             EEEEEEEEEEEE   EEEE                                          
DO_DISOPRED3:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DDDD       
CARBOHYD:                                                N