P20061  TCO1_HUMAN

Gene name: TCN1   Description: Transcobalamin-1

Length: 433    GTS: 2.16e-06   GTS percentile: 0.709     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 268      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRQSHQLPLVGLLLFSFIPSQLCEICEVSEENYIRLKPLLNTMIQSNYNRGTSAVNVVLSLKLVGIQIQTLMQKMIQQIKYNVKSRLSDVSSGELALIIL 100
BenignSAV:                                       H                                                                 
gnomAD_SAV:    I H  #    R     L A LPYKT   NKQ  TC  L F      SC  A RT Y A PV    T NPI L*   *    H  N F #I L  F  T  
Conservation:  3001102010131322212110600016111100041062016103200000024347564354400210212052114011100001234282554035
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                             
SS_PSIPRED:       HHHHHHHHHHHHH   HHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         HHHHHHHHHHH       EE    HHHHHHHHHHHHHHH H        HHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                
DO_SPOTD:      DDDD                                                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                               C                                                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALGVCRNAEENLIYDYHLIDKLENKFQAEIENMEAHNGTPLTNYYQLSLDVLALCLFNGNYSTAEVVNHFTPENKNYYFGSQFSVDTGAMAVLALTCVKK 200
BenignSAV:                   N                                                                                     
gnomAD_SAV:     S AYHKT    V*NH  TN VD  IREKTK   TQS  L I C#H I GIFV   SD  F  TKA H #NS  Q  H  R YPG ## VDIQT  *ANN
Conservation:  4444622310101010134109214421931230001113132462254446485301100110031033212120213101345621433456628322
SS_PSIPRED:    HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH              HHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHH      HHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHH            HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH      HHHHHHH  HHHH           HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                 DDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                 TNYYQ                                   QFSVD              
DISULFID:          C                                                 C                                         C   
CARBOHYD:                                                                 N                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLINGQIKADEGSLKNISIYTKSLVEKILSEKKENGLIGNTFSTGEAMQALFVSSDYYNENDWNCQQTLNTVLTEISQGAFSNPNAAAQVLPALMGKTFL 300
BenignSAV:                      I                                                                                  
gnomAD_SAV:      TDR  RT  ST*   ITCI T#   T   NE  # TR   #A   RHV   *A   S  HS    S    FM    ET   A T V#    VT N   
Conservation:  1200010000101100300031032214402210373443146551526591442113011144513421141024133141262445755525133565
SS_PSIPRED:    H          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:    HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H         HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH     H
SS_PSSPRED:    H         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                              N  S                                             Q           
DISULFID:                                                                      C                                   
CARBOHYD:                     N                                                                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DINKDSSCVSASGNFNISADEPITVTPPDSQSYISVNYSVRINETYFTNVTVLNGSVFLSVMEKAQKMNDTIFGFTMEERSWGPYITCIQGLCANNNDRT 400
BenignSAV:     Y       I                        V                                                                  
gnomAD_SAV:    Y  E    #   D     T#K VIMARLE*  #VFIS   I S  CSA  SMV D A  T#T  D    YIM V  LQ*H  WS VI  #DPRDT  N*#
Conservation:  3411013110011111001011011121000105071626101121230415302436605622631030016263221204532634533414302334
SS_PSIPRED:    HH                              EEEEEEEE     EEEEEEEE   HHHHHHHHHHH      EEEE        EEEE  EE       
SS_SPIDER3:    HHH                            EEEEEEEEE    EEEEEEEE     HHHHHHHHHH     EEEEEE       EEEE  EE      E
SS_PSSPRED:                                    EEEEEEEE      EEEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEEE        EHHH           
DO_DISOPRED3:            DDDDDDDDDDDD                                                                              
DO_SPOTD:           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                          
DO_IUPRED2A:                      DDD                                                                              
REGION:                  ASGNFNISADEPITVTPPDSQS                                                                    
DISULFID:             C                                                                               C    C       
CARBOHYD:                     N                    N     N     N    N              N                               

                       10        20        30   
AA:            YWELLSGGEPLSQGAGSYVVRNGENLEVRWSKY 433
gnomAD_SAV:      *  R  KLPIRR V  F H    VQFHC R 
Conservation:  674445201362282204230104131213301
SS_PSIPRED:    EEEEEE          EEE     EEEEEEEE 
SS_SPIDER3:    EEEEEE  EE      EEE     EEEEEEE E
SS_PSSPRED:    EEEEE          EEEEE    EEEEEEE  
DO_DISOPRED3:                                   
DO_SPOTD:                                       
DO_IUPRED2A:                                    
BINDING:                                       Y
REGION:         WEL