P20062  TCO2_HUMAN

Gene name: TCN2   Description: Transcobalamin-2

Length: 427    GTS: 2.68e-06   GTS percentile: 0.847     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 22      gnomAD_SAV: 333      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MRHLGAFLFLLGVLGALTEMCEIPEMDSHLVEKLGQHLLPWMDRLSLEHLNPSIYVGLRLSSLQAGTKEDLYLHSLKLGYQQCLLGSAFSEDDGDCQGKP 100
BenignSAV:                           V      R                                              M           L    S      
gnomAD_SAV:    R #V     F W  RTVI # VVA RG RR     RQ      Q CM L   GFS # C  N  T I GV C #  MF#  RYFV PTL KN R Y STL
Conservation:  9001003212011212120020120010032103321641221201100347634447655103220160046016300330011221011111000023
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                                  
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHH  H          HHHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHH HHHH         HHHHHHHHHHHHH H           EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                                   
DO_SPOTD:       DDDDDDDDDD                                                                            DDDDDDDDDDD  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                          C                                                             C            C    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SMGQLALYLLALRANCEFVRGHKGDRLVSQLKWFLEDEKRAIGHDHKGHPHTSYYQYGLGILALCLHQKRVHDSVVDKLLYAVEPFHQGHHSVDTAAMAG 200
BenignSAV:                                                                       L  Q    M       M L            T  
gnomAD_SAV:    YV  PV S  TF TS  C G ## HG FL FQ # GN R GVVYY   QA P C ##   T V  FLE WIR CM N IPC MGTS #DRR    ## V 
Conservation:  1262477815545639132120101055329911731740143001122515587786854666943163531153158403313020100348407545
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH         HHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHH           HHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH         HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                D                                                      
BINDING:          Q                                                                                                
REGION:                                                           TSYYQ                                 HHSVD      
METAL:                                                                                                  H          
DISULFID:                     C                                                C                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LAFTCLKRSNFNPGRRQRITMAIRTVREEILKAQTPEGHFGNVYSTPLALQFLMTSPMRGAELGTACLKARVALLASLQDGAFQNALMISQLLPVLNHKT 300
BenignSAV:            H      W   L       Q                               P  Q                                      
gnomAD_SAV:     V  GV CPDLHLDW  WM V VT  Q KF TT##S  RY#   GI     L T  ##HWTQV   #  V #    G   E  RKVFVVA*   IV # I
Conservation:  5852863110100011024006300331343043213824553786557473723211100200034013215520142131415332266468463246
SS_PSIPRED:    HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                N  S                                             Q         
DISULFID:          C                                                             C                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YIDLIFPDCLAPRVMLEPAAETIPQTQEIISVTLQVLSLLPPYRQSISVLAGSTVEDVLKKAHELGGFTYETQASLSGPYLTSVMGKAAGEREFWQLLRD 400
BenignSAV:                                     M              F                           S       M              Q 
gnomAD_SAV:    CV VVL# #  S* I  L VKI SH R #V#IM E#  F #R S# FF V EC#M     N#QV R* RCK * FS* LS   M# EV R  #SRKP # 
Conservation:  6424111191221221010001101000030507052100011010304204456434711510000736243163264462152311312315625522
SS_PSIPRED:     EEE                        EEEEEEEEE      EEEEEE     HHHHHHHHHHH     EEEE     EEEEE         EEEHH  
SS_SPIDER3:     HEEE                        EEEEEEE      EEEEEEE     HHHHHHHHHH     EEEEE   E  EEEE  EE     EEHEE  
SS_PSSPRED:                                EEEEEEEEE      EEEEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEEE      EEE          HHHHHH 
DO_DISOPRED3:                 DDDDD   D                                                                            
DO_SPOTD:                      DDDDD                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
REGION:                                                                                                      WQL   
DISULFID:              C                                                                                           

                       10        20       
AA:            PNTPLLQGIADYRPKDGETIELRLVSW 427
gnomAD_SAV:     SN V K #GGSGSRN   TK    #L
Conservation:  231260293143241023141431212
SS_PSIPRED:             EEE      EEEEEEEE 
SS_SPIDER3:              EE      EEEEEEEEE
SS_PSSPRED:              EE      EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                             
DO_SPOTD:                                 
DO_IUPRED2A:           D D