P20700  LMNB1_HUMAN

Gene name: LMNB1   Description: Lamin-B1

Length: 586    GTS: 1.452e-06   GTS percentile: 0.426     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 2      gnomAD_SAV: 230      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATATPVPPRMGSRAGGPTTPLSPTRLSRLQEKEELRELNDRLAVYIDKVRSLETENSALQLQVTEREEVRGRELTGLKALYETELADARRALDDTARER 100
gnomAD_SAV:         S   L   CS  H      P   W   TD M               G           MR   G  SC   A      NQ  HV    Y   G  
Conservation:  0000000000000000000000000111212211221111224101210120221211020211021110011224423012313221131132013011
SS_PSIPRED:                           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                        
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDD       D                DDD      
REGION:                                                                             VRGRELTGLKAL                   
MODRES_P:        T T              T  S T  S                                                                        
MODRES_M:                   R                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AKLQIELGKCKAEHDQLLLNYAKKESDLNGAQIKLREYEAALNSKDAALATALGDKKSLEGDLEDLKDQIAQLEASLAAAKKQLADETLLKVDLENRCQS 200
gnomAD_SAV:         D SR                   DDTK N Q     V   A  V A #R  N  QAG  Y        Q    V  N           FQ #   
Conservation:  1130101211102101000010433233012113212232132133312232122222410110322122012101210353451171803342452154
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                               S                               S                                         S
MODRES_A:                K                                             K                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LTEDLEFRKSMYEEEINETRRKHETRLVEVDSGRQIEYEYKLAQALHEMREQHDAQVRLYKEELEQTYHAKLENARLSSEMNTSTVNSAREELMESRMRI 300
BenignSAV:                                      C                                                                  
gnomAD_SAV:           HRG#   AM # GK   KP       H     H      R     N V             YST QS    TQV A AIS   G  I  HKIV
Conservation:  2054314241311352132531231230532130203431342125025803430541176134313502542342123212201312324440111152
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    E EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:              DDDDDDDDDDDDDD DDD                       DDDDDDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
REGION:                       INETRRKHETRLVEVDSGRQIEYEYKLA                                                         
MODRES_P:               S                     S                                             S                      
MODRES_A:                                                                            K                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ESLSSQLSNLQKESRACLERIQELEDLLAKEKDNSRRMLTDKEREMAEIRDQMQQQLNDYEQLLDVKLALDMEISAYRKLLEGEEERLKLSPSPSSRVTV 400
gnomAD_SAV:     R    V  I    GTS      V  #        #H  RET   IV  KG   RLMS C              G  G       D    # G   HL  
Conservation:  3132124001322102021421455113115430031130154264123401410451446286648546637714954697266154144322112112
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                EEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHH           EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            EE
DO_DISOPRED3:                                                                   D                DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                            DDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:      DDD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             DDDDDDDDDDDDDDDD
DISULFID:                      C                                                                                   
MODRES_P:       S                                                                        S                         
MODRES_A:                                   K                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SRASSSRSVRTTRGKRKRVDVEESEASSSVSISHSASATGNVCIEEIDVDGKFIRLKNTSEQDQPMGGWEMIRKIGDTSVSYKYTSRYVLKAGQTVTIWA 500
gnomAD_SAV:     Q  LRHN HA GR    I M     N   NV   T  N S   KV NIV   T#   SF  Y  # C      M   PIG  CI   M      L L S
Conservation:  2130011002111157530201101010221202131116051523451265472708132256252562433100201216354214362531144874
SS_PSIPRED:    EEEEE  EEEEE  EEEEEEEEEE EEE  EEEEEEEEEE EEEEEE     EEEEEE     EE   EEEEEEE    EEEEE    EE    EEEEEE
SS_SPIDER3:                     E             EEEEEE  E EEEEEE     EEEEEE     EE   EEEEEEE  EEEEEEE    EE    EEEEEE
SS_PSSPRED:    EE                           EEEEEEEE    EEEEEE     EEEEE           EEEEEEE    EEEEE   EEE   EEEEEEE
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     D  D DD  DDDDDDDD                             
MOTIF:                       KRKRVD                                                                                
MODRES_M:                  R                                                                                       
MODRES_A:                                                                                        K                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            ANAGVTASPPTDLIWKNQNSWGTGEDVKVILKNSQGEEVAQRSTVFKTTIPEEEEEEEEAAGVVVEEELFHQQGTPRASNRSCAIM 586
BenignSAV:     V                                                                                     
gnomAD_SAV:    VYTD I  HLAGF *  K L C DK  E         *   K   V   T#DK  D  AGVE      F  H   R   #   T  
Conservation:  32331112242356723303821201205291420356261214100010002211201001000100010111210000000010
SS_PSIPRED:                EEE           EEEEEE     EEEEEEEEEEEE    HHHHHHH     HHHHH            EE  
SS_SPIDER3:    H        HHHEEEE          EEEEEE     EEEEEEEEEEEE    HHHHHH                        EE 
SS_PSSPRED:                EEEE          EEEEEE      EEEEEEEEEE       HHHH       HHHH             E  
DO_DISOPRED3:                                           D D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD
DO_IUPRED2A:   DDD      D DDDDDDDD      DDD   DDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D DD  DDDDDD 
PROPEP:                                                                                           AIM
LIPID:                                                                                           C   
MODRES_P:                                       S                                        T