P21439  MDR3_HUMAN

Gene name: ABCB4   Description: Phosphatidylcholine translocator ABCB4

Length: 1286    GTS: 1.432e-06   GTS percentile: 0.417     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 77      BenignSAV: 15      gnomAD_SAV: 546      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDLEAAKNGTAWRPTSAEGDFELGISSKQKRKKTKTVKMIGVLTLFRYSDWQDKLFMSLGTIMAIAHGSGLPLMMIVFGEMTDKFVDTAGNFSFPVNFSL 100
PathogenicSAV:                           G      M            G                    R RH V    C                    F 
BenignSAV:        D                                                                                  E       S     
gnomAD_SAV:    VN DV     T CL##                RK A   M I    Q  N  Y   IL    T    R  H VI T #       G S#   YLS   F 
Conservation:  3111111111111111000000001110000011110004313134154210521332252326223622172323457142513300000000011111
STMI:                                                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:      HHHH                     HHH           HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:                                             HHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:                                             HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                S      T                                                                  
CARBOHYD:                                                                                                N     N   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SLLNPGKILEEEMTRYAYYYSGLGAGVLVAAYIQVSFWTLAAGRQIRKIRQKFFHAILRQEIGWFDINDTTELNTRLTDDISKISEGIGDKVGMFFQAVA 200
PathogenicSAV:                        S E           R           K   S          I          W                        
BenignSAV:                                                                               A                         
gnomAD_SAV:    L  I       QI        RF V       M A #   T  Q     K      # *  VA     N AD  AQI       N      F        
Conservation:  1110000032023102312422352243324225312522452463125510462245245546571123424234322441462264554332334124
STMI:                            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                 MMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE       HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     H      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TFFAGFIVGFIRGWKLTLVIMAISPILGLSAAVWAKILSAFSDKELAAYAKAGAVAEEALGAIRTVIAFGGQNKELERYQKHLENAKEIGIKKAISANIS 300
PathogenicSAV: M                                                P                                   V              
BenignSAV:                                          V                        V                                     
gnomAD_SAV:    KC  VIM   F    F      M R#P     IRT#LRW  R  K        TL      SV   #VLR      K HK YS  V*    R G     Y
Conservation:  2322542357215936543234336443234222312321431143145335524436452344662353451533125113510631274352232332
STMI:          MMMMMMMMMM       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                                          MMMM
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                     D D                                                                              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGIAFLLIYASYALAFWYGSTLVISKEYTIGNAMTVFFSILIGAFSVGQAAPCIDAFANARGAAYVIFDIIDNNPKIDSFSERGHKPDSIKGNLEFNDVH 400
PathogenicSAV: TD                                           I          L      V                              G     
BenignSAV:                                                                       V                                 
gnomAD_SAV:    V TS   T T         F   T   * T  TTAF    P    NA    L  ND     R   MV         T  V   E     MEE W LT   
Conservation:  1421233342333543643315321112324044275434214422382334233343264367104525422140563461182352042725371350
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMMMM              MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                              
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH                     EEEEEEEE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH             E     E EEEEE EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   EEEEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                    DD                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FSYPSRANVKILKGLNLKVQSGQTVALVGSSGCGKSTTVQLIQRLYDPDEGTINIDGQDIRNFNVNYLREIIGVVSQEPVLFSTTIAENICYGRGNVTMD 500
PathogenicSAV:   HA G                 AM               R                 H               A   L R                   
BenignSAV:                                                      G                                                  
gnomAD_SAV:        C#  A    RF    H   M     #RA     MF*      E   S   V   G       D GD # # GE RM      D   F  #     G
Conservation:  8276582233672254405125333448927737866334845866760250514731354135413372136552555335234512643372023210
SS_PSIPRED:    EE       EEE   EEEE    EEEEE      HHHHHHHHH        EEEE  EE HHH HHHHHHHEEEEE         HHHHHHH      HH
SS_SPIDER3:    EE       EEE   EEEEE   EEEEE      HHHHHHHHHH      EEEEE  EEHHHH HHHHHH H HH H       HHHHHHH       HH
SS_PSSPRED:            HHHH    EEE    EEEEE      HHHHHHHHHHH      EEEE      HHHHHHHHHHH  EE         HHHHHHH      HH
DO_DISOPRED3:                             DDD   DD D                                                               
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                   GSSGCGKS                                                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EIKKAVKEANAYEFIMKLPQKFDTLVGERGAQLSGGQKQRIAIARALVRNPKILLLDEATSALDTESEAEVQAALDKAREGRTTIVIAHRLSTVRNADVI 600
PathogenicSAV:          ST K                     DR    F   #D  H      R K     G                 Q      T Q #       
BenignSAV:                                D                                                                        
gnomAD_SAV:      TT   KVS     #          AD  V   S         CD LHK R   V  #M     #  T      Y VTGSQ     T PQ M Q #N  
Conservation:  4311733243542641137224261774383546468644635455643365474454465465336421452341333023635366445344325515
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH HHHHHHH    HH           HHHHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE   HHH     EE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH  HHHHHH        EE     EE   HHHHHHHHHHHHH   EEEEE        HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE          EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHH             HHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE         EE
DO_DISOPRED3:                               DDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDDDD                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                     D  D DDDD                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGFEDGVIVEQGSHSELMKKEGVYFKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDEKAATRMAPNGWKSRLFRHSTQKNLKNSQMCQKSLDVETDGLEANVPPVSFLKV 700
PathogenicSAV: S                            V                K                                                     
BenignSAV:                                                       NG                                                
gnomAD_SAV:    #R D     D    RK   E E    F TR      N  K   QSNK   SGVTA C   C  T  I  KF    L  RGPGMGAH       L A   A
Conservation:  3331161327272503641025343152113101110111000001010010011111100101011101101000010011110111120221433145
SS_PSIPRED:    EEEE  EEEEEE HHHHHHH  HHHHHHHHH        HHHHH HHHHHHH                HHHH HHH                    HHHH
SS_SPIDER3:    EEEE  EEEEE  HHHH     HHHHHHHHH     H   HHHHHHHHHHH H                                           HHHH
SS_PSSPRED:    EEEE  EEEEE  HHHHHHH  HHHHHHHHH               HHHHH                                             HHHH
DO_DISOPRED3:           DDDDDDDDDDDD           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        
DO_SPOTD:                                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_IUPRED2A:                                        DDDDD  DDDDD                                                   
REGION:                                FKLVNMQTSGSQIQSEEFELNDE                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKLNKTEWPYFVVGTVCAIANGGLQPAFSVIFSEIIAIFGPGDDAVKQQKCNIFSLIFLFLGIISFFTFFLQGFTFGKAGEILTRRLRSMAFKAMLRQDM 800
PathogenicSAV: P         S   I       E  #  L       V                        E                                      
BenignSAV:                                              S                                M            Q            
gnomAD_SAV:    P         LAM I S    A   LT#  #L#   VVL   N        HML F  IC  M  L   L    M #E  KT S  QQ VS       E 
Conservation:  4134127423432923452347331623443342443362003011240221124335223333353322353425434542652446103824442362
STMI:                     MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                       MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                        
SS_PSIPRED:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SWFDDHKNSTGALSTRLATDAAQVQGATGTRLALIAQNIANLGTGIIISFIYGWQLTLLLLAVVPIIAVSGIVEMKLLAGNAKRDKKELEAAGKIATEAI 900
PathogenicSAV:                                        D                                                            
gnomAD_SAV:    C  EN  T   EF AG  A      #T       T      I  A T    CS   N S V  L #      AA          V E    TE      V
Conservation:  2556201543826352942544264454416562331323342233356424283545534222834234323223232434124412540363432232
STMI:                                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                           
SS_PSIPRED:               HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             HHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ENIRTVVSLTQERKFESMYVEKLYGPYRNSVQKAHIYGITFSISQAFMYFSYAGCFRFGAYLIVNGHMRFRDVILVFSAIVFGAVALGHASSFAPDYAKA 1000
PathogenicSAV:                                                      S                    V  P    S                 
gnomAD_SAV:    D T      #  KTL# #     C         TY # M  GT  V I   # S   C    V K YTS    VV L ET LS LVP  V   V#NC   
Conservation:  2431333322251071015111400422132245242623644534314323432515544850010403104425323433452336332344644356
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KLSAAHLFMLFERQPLIDSYSEEGLKPDKFEGNITFNEVVFNYPTRANVPVLQGLSLEVKKGQTLALVGSSGCGKSTVVQLLERFYDPLAGTVFVDFGFQ 1100
PathogenicSAV:                                                                           M        W                
BenignSAV:                                                                                      Q                  
gnomAD_SAV:    E  T#  SI I  R  TE  R D M T    R T  S  M   SS*E E M R   PKAT    V  A  C   M MAF F KQ SNS V       S  
Conservation:  3257224305432061422111051131031724040340719733322157236241613736576583687997824576677866008151111111
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH                 EE EEEEEEEEEE        EE   EEEE    EEEEE      HHHHHHHHHHH      EEEE    E
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH                 EEEEEEEEE EEEE       HHH   EEEEE   EEEEE      HHHHHHHHHH H     EEEEE   E
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH                 EEEEEEEEEEEE               EEE    EEEEE      HHHHHHHHHHH      EEEEE    
DO_DISOPRED3:                                                                              D                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                                                                           GSSGCGKS                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLDGQEAKKLNVQWLRAQLGIVSQEPILFDCSIAENIAYGDNSRVVSQDEIVSAAKAANIHPFIETLPHKYETRVGDKGTQLSGGQKQRIAIARALIRQP 1200
PathogenicSAV:                         K                                          S              L S       T       
gnomAD_SAV:     FN  KT E S H  KTPF  L *    S  #  KS GC   RWL#    T R    ##  # VKM SD  G    #   #    R     V Q V    
Conservation:  1484013104451656444746466549633662477379122304212361166226354176218513728169149355656345554543444414
SS_PSIPRED:    E   EEHHH  HHHHHH               HHHHHH         HHHHHHHHHHH  HHHHH                  HHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    EE  EE HH  HHHHHHHH HH     H    HHHHHH         HHHHHHHHHH    HHHH        E           HHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:        HHHHHH HHHHHHHH             HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                              DDDDDDDDDD              
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                             DDDDD                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80      
AA:            QILLLDEATSALDTESEKVVQEALDKAREGRTCIVIAHRLSTIQNADLIVVFQNGRVKEHGTHQQLLAQKGIYFSMVSVQAGTQNL 1286
gnomAD_SAV:      F      L  V        *   R  K C#GT    H    E                SMR E     D C   FNI*D   Y 
Conservation:  14556385475463535237605942531545544546354654455265742171427153912842123162174113100111
SS_PSIPRED:     EEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEEE  HHH     EEEEEE  EEEEEE HHHHHH   HHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:     EEEE         HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE         EEEEEE  EEEEE  HHHHH    HHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:     HHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   EEEEEEHHH      EEEEEE  EEEEE  HHHHHHH   HHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:        DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                     D   DDDDDD
DO_SPOTD:                                                                                       DDDDD
DO_IUPRED2A:                         D