P21695  GPDA_HUMAN

Gene name: GPD1   Description: Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic

Length: 349    GTS: 3.24e-06   GTS percentile: 0.932     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 203      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MASKKVCIVGSGNWGSAIAKIVGGNAAQLAQFDPRVTMWVFEEDIGGKKLTEIINTQHENVKYLPGHKLPPNVVAVPDVVQAAEDADILIFVVPHQFIGK 100
BenignSAV:                                                          V                        G                     
gnomAD_SAV:    V  MEAFTI  R G   VT  M A     E* N W #T      TESINMIK VKMHDG   C LAQ F R  M   #G  V K T#F         #S 
Conservation:  2221211101110483344424705211000632052586457252434654545126464574562246146563524024302544747747678602
SS_PSIPRED:        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHH   HHHHHHHHH                EEE   HHHHH    EEEE   HHHHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE   HH    EHHHHHH                 EEE   HHHHH    EEEE   HHHHHH
SS_PSSPRED:        EEEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEE      HHHHHHHH                EEE   HHHHHHH  EEEEE  HHHHHH
DO_DISOPRED3:  D                                                                                                   
DO_SPOTD:      DD                                                                                                  
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                GSGNWG                                                                                     
BINDING:                                               F                                                       F   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ICDQLKGHLKANATGISLIKGVDEGPNGLKLISEVIGERLGIPMSVLMGANIASEVADEKFCETTIGCKDPAQGQLLKELMQTPNFRITVVQEVDTVEIC 200
BenignSAV:                 P       R  K                                                                        A   
gnomAD_SAV:       R        T  ## L R NKC DE  VVL AT  H S  T#  L D           Y    D   QTH #H QG T  L  C      A  A   
Conservation:  4922412241014285565884225317538482473314141447877774736773539885867322000404461644703644375040355547
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH     EEEE     EE      HHHHHHHHHH   EEEEE    HHHHH     EEEEEE  HHHHHHHHHHH     EEEEE  HHH HH 
SS_SPIDER3:    HHHHH HH     EEEEE   EEE    EEEHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHH     EEEEEE  HHHHHHHHHHH     EEEE     EEEH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHH     EEEEE           HHHHHHHHHHH   EEEE   HHHHHHHH    EEEE    HHHHHHHHHHHH    EEEE    EEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                          K                                A                                               
MODRES_P:                                                           S                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GALKNVVAVGAGFCDGLGFGDNTKAAVIRLGLMEMIAFAKLFCSGPVSSATFLESCGVADLITTCYGGRNRKVAEAFARTGKSIEQLEKELLNGQKLQGP 300
PathogenicSAV:                             P                                                                       
BenignSAV:                           I                                                                             
gnomAD_SAV:     S   L  MV        I N I VT  QP IT  TTLVQ   G   YFVI SG YD G PV#I  R Q Q #  PVVHIR  MD  * A   E* M R#
Conservation:  7688445434455555311636656556756747751843254110711169757695667776866997645665661526422245064618664566
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHH    HHHHHHH   HHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH      HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHH   HHHHEH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHH        H
SS_PSSPRED:        EEEEE            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH    EEE      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                                                                           R                          K Q  
REGION:                                                                            RN                              
ACT_SITE:         K                                                                                                

                       10        20        30        40        5
AA:            ETARELYSILQHKGLVDKFPLFMAVYKVCYEGQPVGEFIHCLQNHPEHM 349
gnomAD_SAV:    KI Q PCT  P N      SSS       * AKS D L Y     S R 
Conservation:  1641633144204132133556223313631222502230374258250
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH   HH  HHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH     HHHHHHHHH      
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHH    HHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                BBB
DO_SPOTD:                                                    DDD
DO_IUPRED2A:                                                    
MODRES_P:                               Y