P22670  RFX1_HUMAN

Gene name: RFX1   Description: MHC class II regulatory factor RFX1

Length: 979    GTS: 7.809e-07   GTS percentile: 0.132     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 442      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATQAYTELQAAPPPSQPPQAPPQAQPQPPPPPPPAAPQPPQPPTAAATPQPQYVTELQSPQPQAQPPGGQKQYVTELPAVPAPSQPTGAPTPSPAPQQY 100
gnomAD_SAV:       H S KP#V   QA LSR L   P# LRLLSH VSA  L S  T  A  S#C  KM#T K R   L      LMD    ST L  AD    L    R 
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111101111111111111111111111111111111111111111111111111111111211
SS_PSIPRED:                                                                            EEEEE                     EE
SS_SPIDER3:          HHH                                              H                  E                       EE
SS_PSSPRED:        HHHHH                                                                EEE                       E
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD D
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                 S                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IVVTVSEGAMRASETVSEASPGSTASQTGVPTQVVQQVQGTQQRLLVQTSVQAKPGHVSPLQLTNIQVPQQALPTQRLVVQSAAPGSKGGQVSLTVHGTQ 200
BenignSAV:                                                                                       T                 
gnomAD_SAV:    #M     VT G  K LL PGRS  V   S      RR RVI EQQ    #M  R   ML      # E P      #  AH T      DR   M  D  
Conservation:  1111112221011112211121122111113333233222221111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:    EEEEEEE                           EEE      EEEEEEE                           EEEEE        EEEEEE  EE
SS_SPIDER3:    EEEEEEE                           E  E        EEE E    E                   E  E E          E  EE   E
SS_PSSPRED:    EEEEEE                                       EEE                                          EEEEE     
DO_DISOPRED3:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:            DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QVHSPPEQSPVQANSSSSKTAGAPTGTVPQQLQVHGVQQSVPVTQERSVVQATPQAPKPGPVQPLTVQGLQPVHVAQEVQQLQQVPVPHVYSSQVQYVEG 300
gnomAD_SAV:     M L     LGH         R  R          SI     I  KKP   T   V  RSR  #P   SF TIR     RHF PM I   F   LR   S
Conservation:  1111111111111111111111111111111111111111131111423132121135212031001111111111111111111121224312324453
SS_PSIPRED:    E                                              EEEE              EE  EEEEE   EEE  EE    EE     EEE  
SS_SPIDER3:    E                                              EEE                      E     E                     
SS_PSSPRED:                                                   EEE                                                  
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD D DDDDD D D     DDD D D  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDASYTASAIRSSTYSYPETPLYTQTASTSYYEAAGTATQVSTPATSQAVASSGSMPMYVSGSQVVASSTSTGAGASNSSGGGGSGGGGGGGGGGGGGGS 400
BenignSAV:                                                                          A                              
gnomAD_SAV:    SN   M  T CC  C  SKML  MEMT IR *K V M  RI NTTI  # T  S  S# M S   IT  A        G R# S    RSSRRDS R#SG
Conservation:  2312422312433353424423323333214442111123342231333111123231432342233211111111111111111111111111111111
SS_PSIPRED:                                                                    EEE                                 
SS_SPIDER3:                                                              E      E E                                
SS_PSSPRED:                                  HHH                                                                   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:    DDD D DDDDD   DDDDDD    DDDDD   DDDDDDD DDDDDDDDD DDD               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GSTGGGGSGAGTYVIQGGYMLGSASQSYSHTTRASPATVQWLLDNYETAEGVSLPRSTLYCHYLLHCQEQKLEPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRG 500
gnomAD_SAV:      NRVSS R D  M   S TPSG G F*#   H    M K  V    M   M    NI   Q           SI           I V    CH     
Conservation:  1111111143234342341221211111221232252535643356637475353433532335253322265543553354455346565454556344
SS_PSIPRED:                EEEE  EE               HHHHHHHHH EEE        HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHH            
SS_SPIDER3:                 E                     HHHHEEHEH EEE         HHHHHHHHHHHH         H    EEEEE    EEE     
SS_PSSPRED:               EEEEE                    HHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH            HHHHH             
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                     DDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDD                 D   D                                                                      
DNA_BIND:                                           TVQWLLDNYETAEGVSLPRSTLYCHYLLHCQEQKLEPVNAASFGKLIRSVFMGLRTRRLGTRG

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NSKYHYYGLRIKASSPLLRLMEDQQHMAMRGQPFSQKQRLKPIQKMEGMTNGVAVGQQPSTGLSDISAQVQQYQQFLDASRSLPDFTELDLQGKVLPEGV 600
BenignSAV:                                                               S                                         
gnomAD_SAV:             H        Q    R    TQC L          RRI   I  MV    S R  L M#T   L        WG  N K  NV  R  L  I
Conservation:  5344644644244143303203412338233341221142342471331243010311122211333441443435451551443622332110133313
SS_PSIPRED:             EE    HHHHHHHHHHHHHH      HHH                             HHHHHHHHH  HHH       HH          
SS_SPIDER3:                      HHHHHHHHHHH                                     HHHHHHHHH                   E     
SS_PSSPRED:                   HHHHHHHHHHHH         HHH                            HHHHHHHH                         
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    
DO_IUPRED2A:                         D     D DD       DDD        DD DD D                                           
DNA_BIND:      NSKYHYYGLRIKA                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GPGDIKAFQVLYREHCEAIVDVMVNLQFTLVETLWKTFWRYNLSQPSEAPPLAVHDEAEKRLPKAILVLLSKFEPVLQWTKHCDNVLYQGLVEILIPDVL 700
gnomAD_SAV:    ATR S TLH       DPV  IVM        M  Q    CSV     V L     # K Q  Q    R    # MI  S     M * S L     NL 
Conservation:  0113522550356286663478445865255625624972221211111123111230111461017305532334217330555144626533533434
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHH                 HHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH                  HHHH   HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH 
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH                HHHHHH  HHHHHHHH HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                              DDDDDDDDDDD DD                                          
DO_SPOTD:                                                    DDD   D                                               
DO_IUPRED2A:                                                       DDD                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RPIPSALTQAIRNFAKSLESWLTHAMVNIPEEMLRVKVAAAGAFAQTLRRYTSLNHLAQAARAVLQNTAQINQMLSDLNRVDFANVQEQASWVCRCEDRV 800
BenignSAV:                                       Q                                                                 
gnomAD_SAV:    Q     FN V     R  G    R VIS  A  VQL  VV  T T         K             T         K     S         H     
Conservation:  3524233443575546465364126411362134238424444444467537443634354543535444535695676677736467466865442513
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH     HH   HH     HHH
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH HH    HHHHH HHH     HHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH    HHHHHH      HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VQRLEQDFKVTLQQQNSLEQWAAWLDGVVSQVLKPYQGSAGFPKAAKLFLLKWSFYSSMVIRDLTLRSAASFGSFHLIRLLYDEYMYYLIEHRVAQAKGE 900
BenignSAV:                                                                                                       S 
gnomAD_SAV:             MM  H   Q        S   R #      TS         FE      T  W       G       #   C       S D  TRDRSK
Conservation:  5335528642464353674456166424613474231222244349533643335365445757554644345343456466666666656474513352
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                         D
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        8
AA:            TPIAVMGEFANLATSLNPLDPDKDEEEEEEEESEDELPQDISLAAGGESPALGPETLEPPAKLARTDARGLFVQALPSS 979
gnomAD_SAV:    N T A #K SS     SL# #  #VD  # Q R E MS #   S AD  A  DRD M         N    L   #   
Conservation:  2433333452322102121524111111111202001110111111111000001002110212201112101111111
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHH             HHHHHHH        HHHH                 HHH                
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHH             HH                                     EE    EEEE     
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH              HHH                                           EE      
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDD
DO_IUPRED2A:                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDD DD               
MODRES_P:                                                                                   SS