P23378  GCSP_HUMAN

Gene name: GLDC   Description: Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial

Length: 1020    GTS: 3.001e-06   GTS percentile: 0.902     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 81      BenignSAV: 18      gnomAD_SAV: 659      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MQSCARAWGLRLGRGVGGGRRLAGGSGPCWAPRSRDSSSGGGDSAAAGASRLLERLLPRHDDFARRHIGPGDKDQREMLQTLGLASIDELIEKTVPANIR 100
PathogenicSAV: T                                                         T                      W                  
BenignSAV:                  S   C                                             T                                    
gnomAD_SAV:                 S   C    T    T   L    N    EERV  E  G#  GF   NE  TQT         TG  P   M  MNKF K #LLVD H
Conservation:  9112322312311331111101000000100001301133300001001130322214324242354334331312233113421422253213351353
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                                 
SS_PSIPRED:     HHHHHHHH                                         HHHHHH     HHHHHH    HHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHH                                        HHHHHH      HHH      HHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH                                      HHHHHH     HHHHH     HHHHHHHHHHH    HHHHHHHH  HHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_IUPRED2A:                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  DDDDDDDD  DDD  D                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKRPLKMEDPVCENEILATLHAISSKNQIWRSYIGMGYYNCSVPQTILRNLLENSGWITQYTPYQPEVSQGRLESLLNYQTMVCDITGLDMANASLLDEG 200
PathogenicSAV:                                #     F       K   T          C           P             K             
BenignSAV:           V                                                                                             
gnomAD_SAV:       TFEV NS  D  V #IV #V      * L#   S FKR  # MV W    KL    P   * S*AC   M# S S** V ##      TS       
Conservation:  3022322222345353621712442263444544543643423834529666484464669899979769999958887684555486433556699887
SS_PSIPRED:                HHHHHHHHHHHHH                   HHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HH
SS_SPIDER3:                HHHHHHHHHHHH    E E E E      E  HHHHHHHHH   HHH      HHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH           HH
SS_PSSPRED:                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHH              H HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH      HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TAAAEALQLCYRHNKRRKFLVDPRCHPQTIAVVQTRAKYTGVLTELKLPCEMDFSGKDVSGVLFQYPDTEGKVEDFTELVERAHQSGSLACCATDLLALC 300
PathogenicSAV:  V         K                                                      A M             P            R    
BenignSAV:                            H                                                                  G         
gnomAD_SAV:      GS SV   HIN TG  S IVRG Q      AES#  *NE       LW T  N NYLG   L  L MD R KH SKIM  PP RWC #G   EI P G
Conservation:  8878666575272384327347137767734644577241651434334344752237648467888784936485326532433273453485789776
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH    EEEE     HHHHHHHHH  HH  EEEEE  HHH       EEEEEEEE      EE HHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH      EEEE     HHHHHHHHHHHH    EEEE  HHHH      EEEEEEE E     EE HHHHHHHHHH   EEEEE  HHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH   EEEE       HHHHHHHHHHHH EEEEE            EEEEEEE          HHHHHHHHHHH  EEHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                               DD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ILRPPGEFGVDIALGSSQRFGVPLGYGGPHAAFFAVRESLVRMMPGRMVGVTRDATGKEVYRLALQTREQHIRRDKATSNICTAQALLANMAAMFAIYHG 400
PathogenicSAV:    L        P                                      R         C        D W  E     Y      V           
gnomAD_SAV:      W T* #V  MT   C* LR  V        CLVA*  F   #T    #     #  GLCH G *   # VGKY# IR TYI H#V VHTT V VNS  
Conservation:  3656766566974495677999954677766974674335596699767767575285456766677777997967999999997799767758746888
SS_PSIPRED:          HH   EEEE              HHHHHHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:               EEE    H         H HHHHHHHHHHHH     EEEEEE     EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    H          EEEE             HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                       D  D                           
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SHGLEHIARRVHNATLILSEGLKRAGHQLQHDLFFDTLKIQCGCSVKEVLGRAAQRQINFRLFEDGTLGISLDETVNEKDLDDLLWIFGCESSAELVAES 500
PathogenicSAV:                                       NN                    #       R                               
BenignSAV:                                                Y                 V                                      
gnomAD_SAV:    F##VG VVSKIQYT   F Q   *   HFHR RSL  FN H DY AMG FVK PHW    #VLQ DRF      I SG  V YFFC  CW T   PFT  
Conservation:  4086346836793565555574345851623218899646187522345414823224557151421453658845353565464538555685884542
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          EEEEEEE    HHHHHHHHHH   EEEE    EEEEEE     HHHHHHHHHHH     HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            EEEEEE   HHHHHHHHHH    EEE    EEEEE      HHHHHHHHHHH      HHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           EEEEE    HHHHHHHHHHH   EEEE   EEEEEE     HHHHHHHHHHH      HHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                    K                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGEECRGIPGSVFKRTSPFLTHQVFNSYHSETNIVRYMKKLENKDISLVHSMIPLGSCTMKLNSSSELAPITWKEFANIHPFVPLDQAQGYQQLFRELEK 600
PathogenicSAV:               S           T    RY              #  IV           I               YR                   
BenignSAV:       A                                    Q                                                        D   
gnomAD_SAV:    VAAQ TD A CLLNS  R  S EM ## Y  #S  W L N  S   C  YI MLR       SI YVVSAM#     H  RC LM EP   RE L*D   
Conservation:  4342065512517485517836469556669543386656855786586768889788689866668726558126364689575464298527413953
SS_PSIPRED:    HHHHH    HHH            HHHH  HHHHHHHHHHH                          EE    HHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HH H      HH      HH    H     HHHHHHHHHHHH   HHHH    E      E      EE E HHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H                             HHHHHHHHHHHHHH HHH               HHH      HHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                   K                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLCELTGYDQVCFQPNSGAQGEYAGLATIRAYLNQKGEGHRTVCLIPKSAHGTNPASAHMAGMKIQPVEVDKYGNIDAVHLKAMVDKHKENLAAIMITYP 700
PathogenicSAV:           G            D     P             F      R                                          P     A
BenignSAV:                                                                               T                         
gnomAD_SAV:      W  I   E G *  TR  A  T    #QVH K  V E  M    LT       TNS#R      LLKMEE  SM#VIRFM VL  RQ  V#  V RN 
Conservation:  4866599762676998785796868635663762246402626658936687668755484963534855452866821443435435334674365797
SS_PSIPRED:    HHHHHH   EEE     HH  HHHHHHHHHHHHHH       EEEEE       HHHHHH   EEEEEEE       HHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE  
SS_SPIDER3:    HHHHHH   EEE        HHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE       HHHHHH   EEEEEEE     E HHHHHHHHHH HHHEEEEEE   
SS_PSSPRED:    HHHHHH    EE       HHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEE        HHHHHHH  EEEEEE        HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                               D           DDD DD                                      
MODRES_A:                                                     K               K                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STNGVFEENISDVCDLIHQHGGQVYLDGANMNAQVGICRPGDFGSDVSHLNLHKTFCIPHGGGGPGMGPIGVKKHLAPFLPNHPVISLKRNEDACPVGTV 800
PathogenicSAV:  I                       Q R          H             P       RRD S  EL R   #              W          
BenignSAV:             S                         L                                                          T      
gnomAD_SAV:    F S M   SF E#S HVRE# *# #  R  #   L  SC#EH VC IL      S SL  R  SSV  ##  *IR TL  SSRRF *V Q  VTS   SI
Conservation:  7759779917365927591499796697777775997679975967766764444977799999997999776166355682764302011111144856
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHH   EEEE                                              HHH                        E
SS_SPIDER3:           HHHHHHHHHHHH   EEEE    E EEEEEE        E  H H  EE             HHHHHH H H                   EE
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHH  EEEE  HHHHHH                                     EHHH                        E
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SAAPWGSSSILPISWAYIKMMGGKGLKQATETAILNANYMAKRLETHYRILFRGARGYVGHEFILDTRPFKKSANIEAVDVAKRLQDYGFHAPTMSWPVA 900
PathogenicSAV:  V                E     D    M  V     C                      K   H             V                    
gnomAD_SAV:     VVQ V I V SVF T   V# #Q   * M AVM   K V NQ# IR K RL D#  S S    M R#R RNPV ##      IP N    TL T  L  
Conservation:  5759477547596653753588438623554386666685657642284466563173556656673785555456454656666565999976779773
SS_PSIPRED:    EE       HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE     EEEEEEEE    HHHH   HHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:    EE     HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     EEEE    EEEEEEEEE   HHHH    HHHHHHHHHH       EE    
SS_PSSPRED:    E          HHHHHHHHHH HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE       EEEEEEEE    HHH    HHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GTLMVEPTESEDKAELDRFCDAMISIRQEIADIEEGRIDPRVNPLKMSPHSLTCVTSSHWDRPYSREVAAFPLPFVKPENKFWPTIARIDDIYGDQHLVC 1000
PathogenicSAV:     G             I             T               L       P        G                           R      
BenignSAV:                                                           I                                             
gnomAD_SAV:    W   G  A L G   #H  Y S FC W#    #D SHMNS I L  I   F S IIPFP*NQ *FK A    VTSM QDD L  MF #THNTC  HQ  F
Conservation:  9767679676756376777767645775964577395362139777679754345355174574443163563444343375663344565365666738
SS_PSIPRED:      EEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHH          HHH          HH                 EEE
SS_SPIDER3:      EEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHH         HHH E        HH        H HH      EE
SS_PSSPRED:      EE        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHH         HHH                             EE 
DO_DISOPRED3:      DDDDD DDD                                                                                       
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:          D                                D                                                           

                       10        20
AA:            TCPPMEVYESPFSEQKRASS 1020
BenignSAV:     N                   
gnomAD_SAV:    N SA        F #NKV #
Conservation:  58666327456555343533
SS_PSIPRED:    E   HHHH    HHHHH   
SS_SPIDER3:    E   HHHH   H  H     
SS_PSSPRED:                        
DO_DISOPRED3:         DDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:               DD    DD