P23381  SYWC_HUMAN

Gene name: WARS1   Description: Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic

Length: 471    GTS: 1.617e-06   GTS percentile: 0.500     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 2      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 191      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MPNSEPASLLELFNSIATQGELVRSLKAGNASKDEIDSAVKMLVSLKMSYKAAAGEDYKADCPPGNPAPTSNHGPDATEAEEDFVDPWTVQTSSAKGIDY 100
BenignSAV:             V                                            S                                              
gnomAD_SAV:    T SG  T V D  S  T K  F##A  V*SV  G ###   T L      ES S DV E  R  RIAT   S    T V  K      A  INN      
Conservation:  0201200123344214326521652542134132446285426426722670338446433255020110011231111223518587463334536577
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHH EEEE                                                 H
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHH  HHHHHHH      HHHHHHHHHHHH   EEE E                                E   EEE        H
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHEEE        HHHHHHHHHHHH                                           EEE        H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDD                      D DDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD         
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_IUPRED2A:   DD        D            DD DDD                           DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKLIVRFGSSKIDKELINRIERATGQRPHHFLRRGIFFSHRDMNQVLDAYENKKPFYLYTGRGPSSEAMHVGHLIPFIFTKWLQDVFNVPLVIQMTDDEK 200
PathogenicSAV:                                      Y                                                              
gnomAD_SAV:    N    Q   G  E #   Q Q   S  S    H ST        H  HD G  NS F    Q    K # I  FV  T     H  L M    P A    
Conservation:  4777569875766439649445543536959889948979986347954562354968669889885558577655759777996574699779779979
SS_PSIPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHH   EEE   HHHHHHHHH    EEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEEE  HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HHHE   EE    HHHHHHHHH    EEEEEE       E HHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHHHHH     HH H  EE     HHHHHHHHHH   EEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH    EEEEE  HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                    DDD                                                                                
MOTIF:                                                                        PSSEAMHVGH                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            YLWKDLTLDQAYSYAVENAKDIIACGFDINKTFIFSDLDYMGMSSGFYKNVVKIQKHVTFNQVKGIFGFTDSDCIGKISFPAIQAAPSFSNSFPQIFRDR 300
PathogenicSAV:                                                         R                                           
gnomAD_SAV:            N  C  D        T   N     #      I  NL      GE   LF LK        IN N M           S  NTL  K  QNM
Conservation:  6797666354532663995796657597559797997737571632994965676969969777999795679679765776776697965577469236
SS_PSIPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHH        EEEE HHHHH   HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH        HHH  HHHHHHHHHHH  HHHH   
SS_SPIDER3:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEE  HH     HHHHHHHHHH    HHHHHHH         HH   HHHHHHHHH     HH    
SS_PSSPRED:    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEE HHHHHH  HHHHHHHHHHH   HHHHHHHH          E  HHHHHH              
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDIQCLIPCAIDQDPYFRMTRDVAPRIGYPKPALLHSTFFPALQGAQTKMSASDPNSSIFLTDTAKQIKTKVNKHAFSGGRDTIEEHRQFGGNCDVDVSF 400
gnomAD_SAV:    #     TA             G     SSL       I        EI    TNSTC  S   MT   E   S  V     H MQ    S A   L    
Conservation:  2664997965769977797699999646347767679499789774456656853764886476596974765545559653446364226432246845
SS_PSIPRED:       EEEEEEE      HHHHHHHHHHH     HHH                       EEE   HHHHHHHHHHH        HHHHHHH       HHH
SS_SPIDER3:       EEEEE      HHHHHHHHHHHHH                              EEEE   HHHHHHHHHHH        HHHHHH        HHH
SS_PSSPRED:       EEE          HHHHHHHHHHH       HHH                     EE    HHHHHHHHHHH        HHHHHHH        HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                 D   D                 
MOTIF:                                                         KMSAS                                               
MODRES_P:                                                        S                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70 
AA:            MYLTFFLEDDDKLEQIRKDYTSGAMLTGELKKALIEVLQPLIAEHQARRKEVTDEIVKEFMTPRKLSFDFQ 471
BenignSAV:                                               S                            
gnomAD_SAV:         L K NNR K L# N N#  T  S   #T T       T    QCRD#M  V     I W    NSR
Conservation:  46757885443254344445347246685554064425472442742383246342824454463713233
SS_PSIPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH           
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHH           
SS_PSSPRED:    HHHHHH   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           
DO_DISOPRED3:                                                                         
DO_SPOTD:                                                                          DDD
DO_IUPRED2A: