P23786  CPT2_HUMAN

Gene name: CPT2   Description: Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial

Length: 658    GTS: 2.28e-06   GTS percentile: 0.746     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 28      BenignSAV: 13      gnomAD_SAV: 344      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MVPRLLLRAWPRGPAVGPGAPSRPLSAGSGPGQYLQRSIVPTMHYQDSLPRLPIPKLEDTIRRYLSAQKPLLNDGQFRKTEQFCKSFENGIGKELHEQLV 100
PathogenicSAV:                                                  H                                                  
gnomAD_SAV:     E           L F LA##N     CP   H         TY     HS         V K  RG*  FSSND   T             R    H  
Conservation:  4102121110222220000000100100000011310212211212124447546356355256626427973112441531231183272742651174
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                                           
SS_PSIPRED:       HHHHHH                                               HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHH                          H                      HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH
SS_PSSPRED:      HHHHHHH                         E                     HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDD DDD                                           
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                        
DO_IUPRED2A:               DD  DDDDDDDDDDDDD D                                                                     
MODRES_A:                                                                                    K                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ALDKQNKHTSYISGPWFDMYLSARDSVVLNFNPFMAFNPDPKSEYNDQLTRATNMTVSAIRFLKTLRAGLLEPEVFHLNPAKSDTITFKRLIRFVPSSLS 200
PathogenicSAV:             L      C                              Q                      K                          
BenignSAV:     V                                  S                                                        C       
gnomAD_SAV:    V  *R    N VL  # G C FGQ #II  L    S SR  EA NT R #Q# S  I   Q     QT R   KA Q  L     #  EK T#  H    
Conservation:  1272143488565447464882394754653857337229651348286475584438547646663222969576643826546108734653594356
STMI:                                                                                        IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII
SS_PSIPRED:    HHHHH        HHHHHH       EEEEE                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE          HHHHHHHH     H
SS_SPIDER3:    HHHH          HHHHHH      EEEEE  HHE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EE         HHHHHHH       H
SS_PSSPRED:    HHHH           HHHHH       EE                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHH     HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                D DD                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            WYGAYLVNAYPLDMSQYFRLFNSTRLPKPSRDELFTDDKARHLLVLRKGNFYIFDVLDQDGNIVSPSEIQAHLKYILSDSSPAPEFPLAYLTSENRDIWA 300
PathogenicSAV:          D  GT            L                           G                                        #    
BenignSAV:                                   Q                                                                     
gnomAD_SAV:    #CAVCV #V S       W  ST CSL L#Q G   N   GYF I W  HV#  GI Y*E  T N L  L     L L    TSK       G K#  # 
Conservation:  6438444476969888624696459694114929343114696875639648576655236344152873658138617022252555439569497498
STMI:          IIIIIIII                                                                                            
SS_PSIPRED:    HHHHHH   EEE  HHHHHHH          EEEE      EEEEEE  EEEEEEEE     EE HHHHHHHHHHHHH          EEEE   HHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHH    E  HHHHHHH   EE       EEE      EEEEEE  EEEEEEEE     E  HHHHHHHHHHHH           EEEE    HHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHH      HHHHHHHH           EEE      EEEEEE  EEEEEEEE        HHHHHHHHHHHHHH        EEEE      HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                  D                                                                    
MODRES_A:                                            K                                                             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELRQKLMSSGNEESLRKVDSAVFCLCLDDFPIKDLVHLSHNMLHGDGTNRWFDKSFNLIIAKDGSTAVHFEHSWGDGVAVLRFFNEVFKDSTQTPAVTPQ 400
PathogenicSAV:                            G                R                                    KY                 
BenignSAV:                                                        C               I                                
gnomAD_SAV:      KH PI R S  NVS ##L     Y GEV    F  SF #T  WYA DC#CE A  F TT Y  SDI     *V    L TY  A L HCI    I   
Conservation:  1583292016834161367484886678411325023335359573818896999665545249166657977879646557623655367421835171
SS_PSIPRED:    HHHHHHH   HHHHHHHHHH  EEEEE       HHHHHHHHH            EEEEEE    EEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHHHHHHHH  EEEE        HHHHHHHHH      E     EEEEEE    EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEE        HHHHHHHH              EEEEE    EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHH        
DO_DISOPRED3:                                                                                                   DDD
DO_SPOTD:                                                                                                     DDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                 DDDDDD
ACT_SITE:                                                                             H                            
MODRES_A:          K                                                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SQPATTDSTVTVQKLNFELTDALKTGITAAKEKFDATMKTLTIDCVQFQRGGKEFLKKQKLSPDAVAQLAFQMAFLRQYGQTVATYESCSTAAFKHGRTE 500
PathogenicSAV:                                                L                              F                     
gnomAD_SAV:    I   AA CAIMLH  SL VN    S    TE QL  IV  F V  D#L # S    EQ    RN A   TL*    ##CR  AG  # R   T   SCSK
Conservation:  2042122221242581927412532561193135222212524202371359622452345988753796585544344533335394887749689969
SS_PSIPRED:                EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEEE    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:                EEEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EEEEEEE    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:                EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE     HHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:  DDDDD                                                                                               
DO_SPOTD:      DDDDDDDD                                                                                            
DO_IUPRED2A:   DDDDDD D                                                                                            
BINDING:                                                                                            Y S          T 
REGION:                                                           GKEFLKKQKLSPD                                    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TIRPASVYTKRCSEAFVREPSRHSAGELQQMMVECSKYHGQLTKEAAMGQGFDRHLFALRHLAAAKGIILPELYLDPAYGQINHNVLSTSTLSSPAVNLG 600
PathogenicSAV:   C                                             DR  N                                              R
BenignSAV:                                     A                                                      C            
gnomAD_SAV:      HL  IC  TYY    KKL    G K     A R   Q     K VVD S N*Q    W     RW            R   Y I CMNI RG   KV 
Conservation:  3556562363284275501223443236216402782782294358438488559854643530324004525517347114754464553805534124
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH     HHHHH HHHHH                EEE
SS_SPIDER3:    EE E  HHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH      HHH  HHHHH    EEE        E EE
SS_PSSPRED:     EE   HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH    HHHH  HHHHH                   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:               K                                 K                                                        

                       10        20        30        40        50        
AA:            GFAPVVSDGFGVGYAVHDNWIGCNVSSYPGRNAREFLQCVEKALEDMFDALEGKSIKS 658
PathogenicSAV:    S                       S  C                           
BenignSAV:                                                   #       Y   
gnomAD_SAV:    R   LIC#    E   YN R DY  A  L CD#Q V #  A# S#GTSG  K  P R 
Conservation:  4648364686855813131332423534212311243133123624331433531311
SS_PSIPRED:    EEE      EEEEEEE   EEEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EE E    EEEEEEEE   EEEEEEEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    EE        EEE E     EEEEEE      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                         DDD
DO_SPOTD:                                                            DDDD
DO_IUPRED2A: