P23975  SC6A2_HUMAN

Gene name: SLC6A2   Description: Sodium-dependent noradrenaline transporter

Length: 617    GTS: 1.442e-06   GTS percentile: 0.421     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 16      gnomAD_SAV: 258      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLLARMNPQVQPENNGADTGPEQPLRARKTAELLVVKERNGVQCLLAPRDGDAQPRETWGKKIDFLLSVVGFAVDLANVWRFPYLCYKNGGGAFLIPYTL 100
BenignSAV:           K                                                             I                             I 
gnomAD_SAV:    L PE #KL LPS  SRVN  A *S W  RN Q P   KHH#F S V  S  V  T    DE       I           H  N       SV   L I 
Conservation:  2222222213131001111121222112314242433335644332332112111543545424564556644466677977954753534767968443
STMI:                                                                        MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM    MMMMMMMM
SS_PSIPRED:                                     EEE                        HHHHHHHHHHHHH         HH HHH      HHHHHH
SS_SPIDER3:                                H  H HH       E                HHHHHHHHHHHHHH    HH   HHHH     E   HHHHH
SS_PSSPRED:                                   HHH                           HHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                             
DO_IUPRED2A:            DDDDDDDDDDDDDDD                                                                            
METAL:                                                                               G AV   N                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FLIIAGMPLFYMELALGQYNREGAATVWKICPFFKGVGYAVILIALYVGFYYNVIIAWSLYYLFSSFTLNLPWTDCGHTWNSPNCTDPKLLNGSVLGNHT 200
gnomAD_SAV:       MT  T           YG  #  I   W        V    T           T       F  A      A S     TS I LRF    M  S#S
Conservation:  5635384557466573654364888758545725455854785675979879888979764974564502987218451865328321001312111125
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                  
SS_PSIPRED:    HHHHH HHHHHHHHHH        HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                  
SS_SPIDER3:    HHHH  HHHHHHHHHHHH      HHHHHH HHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H                          
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:                                                                                 C        C               
CARBOHYD:                                                                                         N       N     N  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KYSKYKFTPAAEFYERGVLHLHESSGIHDIGLPQWQLLLCLMVVVIVLYFSLWKGVKTSGKVVWITATLPYFVLFVLLVHGVTLPGASNGINAYLHIDFY 300
BenignSAV:                                                 I                                     R        T        
gnomAD_SAV:      Y    M  D#   C   N  K  R RY#S  HCR  P  I II I    F  V    E    V    S  M LMF A VIRQSRVPS       VNI 
Conservation:  3842121476254445255423371652444184745226612543444446646565585967788869837735974684785871398347745751
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                  
SS_PSIPRED:            HHHHHHH     EEE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHH  HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH    HH
SS_SPIDER3:            HHHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH     EEEHE   HHHHHHHHH  H         EEEEEE  HH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHH     EE          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHEEEEE  HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RLKEATVWIDAATQIFFSLGAGFGVLIAFASYNKFDNNCYRDALLTSSINCITSFVSGFAIFSILGYMAHEHKVNIEDVATEGAGLVFILYPEAISTLSG 400
BenignSAV:                                                            L            P     S                         
gnomAD_SAV:    HF         TP# # F E        #    T    G T      N   LI LI   #V  N    V      V N  K         H  TFT   R
Conservation:  3823437766674766676747697967668674737697989446645964889499975964886572442526249846656656466558564834
STMI:                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                                      
SS_PSIPRED:    HH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH     EEE HHHHH   H
SS_SPIDER3:    H     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH  EEEEEE HHHHH    
SS_PSSPRED:    HH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH   EEEEE HHHHHH   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                          S                               N                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            STFWAVVFFVMLLALGLDSSMGGMEAVITGLADDFQVLKRHRKLFTFGVTFSTFLLALFCITKGGIYVLTLLDTFAAGTSILFAVLMEAIGVSWFYGVDR 500
PathogenicSAV:                                                         P                                           
BenignSAV:                                                     I             R              S                      
gnomAD_SAV:    FA      SI H V     L       T           QRQ F    I    S FT   VS DRN IV R  S   S      AVVKTVR  *   M  
Conservation:  6436643693884699698698989666995396623544586268425322666258396648856655685236647468666646447567566424
STMI:            MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM        
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHH H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                       L  DS                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FSNDIQQMMGFRPGLYWRLCWKFVSPAFLLFVVVVSIINFKPLTYDDYIFPPWANWVGWGIALSSMVLVPIYVIYKFLSTQGSLWERLAYGITPENEHHL 600
BenignSAV:                                C                   HT                                                   
gnomAD_SAV:      K          C H       F  T    M    # T  SF  NH T L#    A  VMT      M  HIM   VGMK F     S   M D K DV
Conservation:  4535423325246336544334324624543345253332224173261580854038714415541246153246312235423243423327323312
STMI:                                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                               
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH          
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH      E   E   HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH     HHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                      DDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10       
AA:            VAQRDIRQFQLQHWLAI 617
BenignSAV:             Y        
gnomAD_SAV:    L  M   HY      TN
Conservation:  31122332322112202
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:     H   HHHHHHHH    
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:     D             
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A: