P28067  DMA_HUMAN

Gene name: HLA-DMA   Description: HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain

Length: 261    GTS: 1.3e-06   GTS percentile: 0.356     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 118      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MGHEQNQGAALLQMLPLLWLLPHSWAVPEAPTPMWPDDLQNHTFLHTVYCQDGSPSVGLSEAYDEDQLFFFDFSQNTRVPRLPEFADWAQEQGDAPAILF 100
gnomAD_SAV:          K  V   VV  M#R  NA   S  LI   TH#    IL  A C  GV SN EI    ND   Y  N     G  #  K  G    R E      
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
STMI:          SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS                                                                          
SS_PSIPRED:          HHHHHHHHHHHHHHH               HHH   EEEEEEEEE     EEEEEEE   EEEEEE    EEEE              HHHHHH
SS_SPIDER3:          HH HH   HHHHHH     E           H    EEEEEEEEE     EEEEEEE   EEEEEE    EEEE    H  H      HHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHH                     EEEEEEEE      EEEEEE    EEEEEE     EE    HH HH   HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  BDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                       
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                                      
DO_IUPRED2A:   D                              DD                                                  D D              
DISULFID:                                                       C                                                  
CARBOHYD:                                              N                                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DKEFCEWMIQQIGPKLDGKIPVSRGFPIAEVFTLKPLEFGKPNTLVCFVSNLFPPMLTVNWHDHSVPVEGFGPTFVSAVDGLSFQAFSYLNFTPEPSDIF 200
BenignSAV:                                                                  QH  I              A                   
gnomAD_SAV:         K T H   A #N   LM K   VTK  M  S   S #   I SI S         *  Y I    ##LA     EA   L       IS T    
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH               EEEEEE          EEEEEE        EEEEEE  EE   EEE EEEE     EEEEEEEEEE     EE
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH  H             EEEEEE         EEEEEEE        EEEEEE  EE EEEEE EEEE    EEEEEEEEE       EE
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHH               EEEEE           EEEEEE       EEEEEEE       EEE  EE      EEEEEE         EE
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
DISULFID:          C                                         C                                                     

                       10        20        30        40        50        60 
AA:            SCIVTHEIDRYTAIAYWVPRNALPSDLLENVLCGVAFGLGVLGIIVGIVLIIYFRKPCSGD 261
BenignSAV:              #                        M                          
gnomAD_SAV:    C # IQK  C  T T   LWKT       KM   M       CLVM      H WR    A
Conservation:  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333
STMI:                                           MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM       
SS_PSIPRED:    EEEEE HH    EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       
SS_SPIDER3:    EEEEE       EEEEE       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        
SS_PSSPRED:    EEEEEE      EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE       
DO_DISOPRED3:                                                      DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                             DDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                
REGION:                         VPRNALPSDLLENVLC                            
DISULFID:       C