P28370  SMCA1_HUMAN

Gene name: SMARCA1   Description: Probable global transcription activator SNF2L1

Length: 1054    GTS: 1.111e-06   GTS percentile: 0.273     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 5      gnomAD_SAV: 252      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MEQDTAAVAATVAAADATATIVVIEDEQPGPSTSQEEGAAAAATEATAATEKGEKKKEKNVSSFQLKLAAKAPKSEKEMDPEYEEKMKADRAKRFEFLLK 100
gnomAD_SAV:      H  DS VTA    ATIT  L TQ#Q  RL A     TT G SK AE    SKN   QS#     #H   V      T      E    * NK      
Conservation:  4444444444444111000004444401100114444444444444444000444444000010000010000011221133775843359578765994
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:       HHHHHHHHHHH                    HH HHHHHHHHH       HHHHH    HHHHHH     HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHH                    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDD DDD                    
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    
DO_IUPRED2A:   DDDD DDDDD         DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QTELFAHFIQPSAQKSPTSPLNMKLGRPRIKKDEKQSLISAGDYRHRRTEQEEDEELLSESRKTSNVCIRFEVSPSYVKGGPLRDYQIRGLNWLISLYEN 200
gnomAD_SAV:             R      AA    KT  #SG M N            R L  E          W I     S       L                      
Conservation:  7777797757956676958964453656436266883445455785878969999988596354555759974995876392799996997996999999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH      HHH           HHHHHH           HHHHHHHHHHHHH    EEEEEE           HHHHHHHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    H HHHHHHH HHH                     HHH       HH H  HHH HHHH         EEEEE      E     HHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHH                    HHH                  HHHHHHHHH    EEEEEE          HHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:              DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                    
DO_SPOTD:                DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:            DDDD  DDDDDDDDDDDDDDD DD  DDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDD                                         
MODRES_P:                     S  S                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GVNGILADEMGLGKTLQTIALLGYLKHYRNIPGPHMVLVPKSTLHNWMNEFKRWVPSLRVICFVGDKDARAAFIRDEMMPGEWDVCVTSYEMVIKEKSVF 300
BenignSAV:                                                                               C                         
gnomAD_SAV:     IS               T M       Q      VI G    I#S   D  Q# S  H     R        #C  T    C   I T    VQD  L 
Conservation:  9779999999999999797799997968754677766766677647653776475755367977945627336569566997976979997659697579
SS_PSIPRED:        EEHHH     HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   HHHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHH       EEEEEHHHHH  HHHH
SS_SPIDER3:       EEHHHH     HHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE    HHHHHHHHHH    EEEEEE  HHHHHHHHHHH       EEEEEHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:       EEE        HHHHHHHHHHHHHHH      EEEEE   HHHHHHHHHHH   EEEEEEE  HHHHHHHHHHHH     EEEEEEHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:              DEMGLGKT                                                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KKFHWRYLVIDEAHRIKNEKSKLSEIVREFKSTNRLLLTGTPLQNNLHELWALLNFLLPDVFNSADDFDSWFDTKNCLGDQKLVERLHAVLKPFLLRRIK 400
gnomAD_SAV:    R  Y                          NL  H                       S     E          DY   R PM G        F CCV 
Conservation:  9797979779999999979779999959799799699999999999999997997799776767636796999979979965999978266567686588
SS_PSIPRED:    H   EEEEEEE HHHHH HH HHHHHHHHH     EEE        HHHHHHHHHHH HHHH  HHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:         EEEEE H H       HHHHHHHH     EEEE        HHHHHHHHH H  HH   HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:        EEEEEEE HHHH HHHHHHHHHHHHH    EEEE        HHHHHHHHHHH       HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MOTIF:                   DEAH                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TDVEKSLPPKKEIKIYLGLSKMQREWYTKILMKDIDVLNSSGKMDKMRLLNILMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTDEHIVSNSGKMVVLDKLLAKLKE 500
gnomAD_SAV:     E                  E    G     T   E      T   LQ        Q             T    IS              #N       
Conservation:  3687667557573767677799997777769979797999599699999975969999997969999977969799693955296996479697946444
SS_PSIPRED:    HHHHHH    EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHH     EEEEEEE   HHHHHHHHHHHH    E      HHHH HHHHHHHHHHH                  HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    H         EEEEEEE  HHHHHHHHHHHHH    E        HHHHHHHHHHHHHHH                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                               DD                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QGSRVLIFSQMTRLLDILEDYCMWRGYEYCRLDGQTPHEEREDKFLEVEFLGQREAIEAFNAPNSSKFIFMLSTRAGGLGINLASADVVILYDSDWNPQV 600
gnomAD_SAV:        IVV               I H   C Q   R L                 Q     H                      G     V #        
Conservation:  9479796797777677997767696464767979665944974444444444441472379333927969997777979997997996564565776777
SS_PSIPRED:       EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH    EEE      HHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH       EEEEEE              EEEEE     HHH
SS_SPIDER3:       EEEEEE HHHHHHHHHHHH H   EEEE      HHHHHH HHHHHHHHHHHHHHH        EEEEEE     E EE     EEEEE     H H
SS_PSSPRED:    H  EEEEEEHHHHHHHHHHHHHHH    EE         HH HHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEEE        EEE   EEEEE        
DO_DISOPRED3:                                                D                                                     
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DLQAMDRAHRIGQKKPVRVFRLITDNTVEERIVERAEIKLRLDSIVIQQGRLIDQQSNKLAKEEMLQMIRHGATHVFASKESELTDEDITTILERGEKKT 700
BenignSAV:                                                            R                                            
gnomAD_SAV:        V        E   CI C    K      AQ T L  T     T       R     G  KI     Q   Q            NL S    R    
Conservation:  7776777977777474969776797797969979799597697797977757456437756757776799999677976875467766732667754558
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH     EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH            HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:     HHHHHHHHH      EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHH  HHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH HHHH
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHH     EEEEEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHEEEE           H HHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHH HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                            DDDDDDDDDDD             D 
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                  DD              DD      DDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AEMNERLQKMGESSLRNFRMDIEQSLYKFEGEDYREKQKLGMVEWIEPPKRERKANYAVDAYFREALRVSEPKIPKAPRPPKQPNVQDFQFFPPRLFELL 800
BenignSAV:          C                                                                    Q                         
gnomAD_SAV:     D   C #  R  C      N                R P     T      H  S T  T      C      Q  S  S            LCS    
Conservation:  4974665347893697496772739795997999979794444689979979797697799997777799997599797979996799999977597999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHH        HH      HHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHH                         HHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH HHHHH      H HHH      HHHHHH            H HH HHHHHHHHHHH                          HHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHH         HHHH     HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                        HHHHHHH
DO_DISOPRED3:       DDDD D DD                    D DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:               DDDDDDDDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDDDDDD    DDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDD                                   DD                        DDDDDDDDDDDDDDDDDD            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EKEILYYRKTIGYKVPRNPDIPNPALAQREEQKKIDGAEPLTPEETEEKEKLLTQGFTNWTKRDFNQFIKANEKYGRDDIDNIAREVEGKSPEEVMEYSA 900
BenignSAV:                                         A                                                               
gnomAD_SAV:     N  V FW                  G  G  N T ASKS  A    DNQ    #           #   T            V    SRC         
Conservation:  7797746677679659756735654328658829994833641393698738948797476999979979779769799676796999994976756765
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH             HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH     HHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH            HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH    HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                               
DO_IUPRED2A:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD                         DDDDD DD             

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VFWERCNELQDIEKIMAQIERGEARIQRRISIKKALDAKIARYKAPFHQLRIQYGTSKGKNYTEEEDRFLICMLHKMGFDRENVYEELRQCVRNAPQFRF 1000
gnomAD_SAV:        C Y     D   TE  H       K  V           N      C                             K        L    V     
Conservation:  4666976977977646675779966667786566565255566655666756569677997979999579666967596677679797979779699999
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHH              HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH      
SS_SPIDER3:    HHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH E            HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH       
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHH              HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                           Y                                              

                       10        20        30        40        50    
AA:            DWFIKSRTAMEFQRRCNTLISLIEKENMEIEERERAEKKKRATKTPMVKFSAFS 1054
gnomAD_SAV:       N          C  I        YI     GK     Q     T  Y    
Conservation:  997567566576776656767999799597996767989863382223645132
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:     EEE    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH             
SS_PSSPRED:     EEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH              
DO_DISOPRED3:                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                 D DDDDDDD DD