P29401  TKT_HUMAN

Gene name: TKT   Description: Transketolase

Length: 623    GTS: 2.734e-06   GTS percentile: 0.858     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 1      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 313      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MESYHKPDQQKLQALKDTANRLRISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMRYKSQDPRNPHNDRFVLSKGHAAPILYAVWAEAGFLAEAELLNL 100
gnomAD_SAV:    L       EP       A S    G LH        PA T   #T  # I   Y  HH F  LQKL S C          TF T       PVKV  P V
Conservation:  2222012211223242214237521222222221134333445257435454542635200352313574544247464535243548371412135233
SS_PSIPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHHH             EEEE  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHHHHHHHHHH              EEEE  HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHH
SS_PSSPRED:            HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHH            EEEE    HHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDDD                                                                                              
DO_IUPRED2A:   DDDD DDDDDDDD DD             D                                 D  D DDD                             
BINDING:                                           H  S                                    H                       
SITE:                                              H                                                               
MODRES_P:        S                                                                                                 
MODRES_A:           K    K                                                                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RKISSDLDGHPVPKQAFTDVATGSLGQGLGAACGMAYTGKYFDKASYRVYCLLGDGELSEGSVWEAMAFASIYKLDNLVAILDINRLGQSDPAPLQHQMD 200
BenignSAV:                                                                                     V                  E
gnomAD_SAV:         N    L    T   LV SF  R  R TS  G  S   #E # Q  S   #  P A  LS T   #R C       V## SC     L A    TE
Conservation:  4321613534434421233233632634472457464255343245645685464372467548864377433164744454447443352225323123
SS_PSIPRED:    HHH              EEE      HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEEE    HHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE               HH
SS_SPIDER3:                 E   EEEE      HHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE     HHHHHHHHHHHHH     EEEEEE    EE         HH
SS_PSSPRED:    HHH                       HHHHHHHHHHHHHHHH     EEEEEE        HHHHHHHHHHHH    EEEEEE               HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
NP_BIND:                             GSL                                                                           
BINDING:                                                              G                            N               
METAL:                                                               D                             N L             
MODRES_P:         S                                                                                                
MODRES_A:                                                 K                                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IYQKRCEAFGWHAIIVDGHSVEELCKAFGQAKHQPTAIIAKTFKGRGITGVEDKESWHGKPLPKNMAEQIIQEIYSQIQSKKKILATPPQEDAPSVDIAN 300
BenignSAV:                                                  Q                                    M                 
gnomAD_SAV:    M   QW  VS Y L MG  #MD  R V    RY LIT   R    Q  M     DP#Q  T LR V#K#  R  F   H   MN  # S   TLL NT H
Conservation:  2531754466735236785463297256133424835556583664532147522276575444424313412403461323230301914533033201
SS_PSIPRED:    HHHHHHHH   EEEEE    HHHHHHHHHHH    EEEEEE                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHH   EEEEE    HHHHHHHHHH     EEEEEEE                     HHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHH  EEEEE    HHHHHHHHHHHH   EEEEEE                      HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                           DDDDDDDD       
DO_IUPRED2A:                                                     D  DDD DDD DD                     DDD DD    DDDD  
BINDING:                                                  K             H                                          
SITE:                                                                   H                                          
MODRES_P:                                                                                Y           T       S     
MODRES_A:         K                           K        K                  K                                        

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IRMPSLPSYKVGDKIATRKAYGQALAKLGHASDRIIALDGDTKNSTFSEIFKKEHPDRFIECYIAEQNMVSIAVGCATRNRTVPFCSTFAAFFTRAFDQI 400
PathogenicSAV:                  C                                                                                  
gnomAD_SAV:     HL N    E   RT  H VCRE    V Y#R CM#TP E      YLKVL    L##  K NV     MN V# Y  C  M  #   SV  L Q     
Conservation:  4043337162153336534657186265812326454625844426444273424835576733458765458486425353448434654544754574
SS_PSIPRED:                     HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE        HHHHHHH    EEEEEE HHHHHHHHHHHHH   EE     HHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:                     HHHHHHHHHHHHHH   EEEEE        HHHHHHH    EEEEEHHHHHHHHHHHHHHH    EEHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE          HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EE  HHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                  D                                                    
BINDING:                        R                          S                                              F        
ACT_SITE:                                                                       E                                  
MODRES_P:                                                  S                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RMAAISESNINLCGSHCGVSIGEDGPSQMALEDLAMFRSVPTSTVFYPSDGVATEKAVELAANTKGICFIRTSRPENAIIYNNNEDFQVGQAKVVLKSKD 500
BenignSAV:                                        V                                                                
gnomAD_SAV:    CI  V KN V F SC   I          G    TV W A A         I         T #N#   FW  #   T MF  H N * R  EM      
Conservation:  5354233245352655574425355332436474236634714558593755537365066422264865433335215682216052471646501211
SS_PSIPRED:    HHHHHH   EEEEEE          HHH  HHHHHHHH     EEEEE  HHHHHHHHHHHHH   EEEEEEE                  EEEEE    
SS_SPIDER3:    HHHHH    EEEEEE    EE         HHHHHHHH     EEEE   HHHHHHHHHHHH     EEEEEE               EEEEEEEEE   
SS_PSSPRED:    HHHHH     EEEEE            HHHHHHHHHH      EEEE   HHHHHHHHHHHHH    EEEEE                   EEEEEE   
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
BINDING:                      H       D   Q                                             R                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DQVTVIGAGVTLHEALAAAELLKKEKINIRVLDPFTIKPLDRKLILDSARATKGRILTVEDHYYEGGIGEAVSSAVVGEPGITVTHLAVNRVPRSGKPAE 600
BenignSAV:                 Q                                                                                   R   
gnomAD_SAV:     L SIM   A #Q    T K     E  VCM  S   Q VN    #N TCT  D    MG Y C*S     LTGV M K  VNL      Q     RLG 
Conservation:  8255655884363745283306213421445365675585600353123425242544668751695354642223203133031255410352352404
SS_PSIPRED:     EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE         HHHHHHHHHH    EEEEE       HHHHHHHHHH     EEEEEEE        HHH
SS_SPIDER3:      EEEEE  HHHHHHHHHHHHHHH    EEEE         HHHHHHHHHH    EEEE        HHHHHHHHHH     EEEEE          HHH
SS_PSSPRED:     EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE         HHHHHHHHHH    EEEEEE      HHHHHHHHHH     EEEEEE         HHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                           K                                                              

                       10        20   
AA:            LLKMFGIDRDAIAQAVRGLITKA 623
gnomAD_SAV:      NK   N    T  MSVP   S
Conservation:  45213344311510344012211
SS_PSIPRED:    HHHH    HHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHH    HHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:    HHHHH   HHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                         
DO_SPOTD:                           DD
DO_IUPRED2A:                          
MODRES_A:        K