P31645  SC6A4_HUMAN

Gene name: SLC6A4   Description: Sodium-dependent serotonin transporter

Length: 630    GTS: 1.686e-06   GTS percentile: 0.531     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 7      gnomAD_SAV: 274      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            METTPLNSQKQLSACEDGEDCQENGVLQKVVPTPGDKVESGQISNGYSAVPSPGAGDDTRHSIPATTTTLVAELHQGERETWGKKVDFLLSVIGYAVDLG 100
BenignSAV:                                                            A                                            
gnomAD_SAV:      MM S   R  LE      Y   RA  M F  AE IMG R   S  L L    VAH  Q C  VSI A      H  W A SR# Y  F    H     
Conservation:  8100100110001011102211342142531102323121232353321122231112220113232234146232128428246468867556478656
STMI:                                                                                                 MMMMMMMMMMMMM
SS_PSIPRED:                                                                        HHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:            HHHH              E                                         HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:             HHH                                                                        HHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                      
DO_IUPRED2A:   DDDD DDDDDDDDDD         DDDDDD D     D  DDDD   DDDDD DDDDDDDD D                                     
METAL:                                                                                                      G AV   
MODRES_P:                                                    Y                                                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NVWRFPYICYQNGGGAFLLPYTIMAIFGGIPLFYMELALGQYHRNGCISIWRKICPIFKGIGYAICIIAFYIASYYNTIMAWALYYLISSFTDQLPWTSC 200
gnomAD_SAV:     I   L V  HS          TT VS  #   FV  T    YQS  V  R * S V      GTS T       #TIV   V #   FY MNR      
Conservation:  8786853486665599995893699599979999899669865439587684359958884955584535666799896558545973496211999538
STMI:          MMMMMMMMMMMM   MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                         MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM              
SS_PSIPRED:         HH HH       HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH HHH   HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
SS_SPIDER3:          EE      EEE HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       H  
SS_PSSPRED:     EEE  EEE      EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:         N                                                                                                   
MODRES_P:                                               Y                                                          
DISULFID:                                                                                                         C

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KNSWNTGNCTNYFSEDNITWTLHSTSPAEEFYTRHVLQIHRSKGLQDLGGISWQLALCIMLIFTVIYFSIWKGVKTSGKVVWVTATFPYIILSVLLVRGA 300
BenignSAV:     N                                                                                                   
gnomAD_SAV:          DS #S   KEIT  IP  M S     M##I    Q   F    D   #  I  V   SIT   #   I A  R  CL      VVIF       
Conservation:  0818891382283101544931183996868638279344261861349155959369443684578987989666888854346559535935574684
STMI:                                                              MMMMMMMMMMMMMMMMMMM      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM   
SS_PSIPRED:                              HHHHHHH     EEE           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHH   HHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:                              HHHHHHH   E E             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      EEEEEE   HHHHHHHHHH H 
SS_PSSPRED:                              HHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHH       EEEEEEE  HHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_P:                                                                                 T                        
DISULFID:              C                                                                                           
CARBOHYD:             N        N                                                                                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TLPGAWRGVLFYLKPNWQKLLETGVWIDAAAQIFFSLGPGFGVLLAFASYNKFNNNCYQDALVTSVVNCMTSFVSGFVIFTVLGYMAEMRNEDVSEVAKD 400
gnomAD_SAV:      H       L   LSC  V    M     TP         E        S   SS      L #MM Y #  IL  A C        I          E
Conservation:  5654464953565393715523228967985978987989999869679993739987556555824673986468566878896998492327339975
STMI:                                  MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM             MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
SS_SPIDER3:        H H HHEHEE  HHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH
SS_PSSPRED:        HHHHHHEEE   HHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                            S                               N                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AGPSLLFITYAEAIANMPASTFFAIIFFLMLITLGLDSTFAGLEGVITAVLDEFPHVWAKRRERFVLAVVITCFFGSLVTLTFGGAYVVKLLEEYATGPA 500
BenignSAV:                             #                                       L                                   
gnomAD_SAV:    T #    TM   VV    G AS  V       MQ S  ML       MG  N    I   CW QL# #M  #SL    IIV      M   P D  MA  
Conservation:  2955999956699766946648676499495659999896688856797559957325325881476154226537772866288765558595675544
STMI:                               MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                    MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM           MMMMMM
SS_PSIPRED:    H   EEEEE HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHH
SS_SPIDER3:        EEEEE HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHH HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEHEHHHHH  HHHH
SS_PSSPRED:        EEEHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
METAL:                                          L  DS                                                              

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VLTVALIEAVAVSWFYGITQFCRDVKEMLGFSPGWFWRICWVAISPLFLLFIICSFLMSPPQLRLFQYNYPYWSIILGYCIGTSSFICIPTYIAYRLIIT 600
BenignSAV:                                                      V                                                  
gnomAD_SAV:    #   V  K  #M CLC  #  RK M   PSLIL   *  # MTVC    V    G   R S  *   H FR G    D  K    L#  LK V   F   
Conservation:  4555464834563887942595265429693298279549944769368456438553143151773608807631395256288434782744735326
STMI:          MMMMMMMMMMMMMMMM                      MMMMMMMMMMMMMMMMMMMM                MMMMMMMMMMMMMMMMMMMMM     
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30
AA:            PGTFKERIIKSITPETPTEIPCGDIRLNAV 630
BenignSAV:         N                         
gnomAD_SAV:    S   N #F QTV    R   S R TH    
Conservation:  496446632143242211033223111111
SS_PSIPRED:       HHHHHHHH             EEE   
SS_SPIDER3:       HHHHHHHH             EEE   
SS_PSSPRED:       HHHHHHHH             EEEE  
DO_DISOPRED3:                               D
DO_SPOTD:                                 DDD
DO_IUPRED2A:                                 
REGION:                  SITPETPTEIPCGDIRLNAV
MODRES_P:                S T  T