P32780  TF2H1_HUMAN

Gene name: GTF2H1   Description: General transcription factor IIH subunit 1

Length: 548    GTS: 1.397e-06   GTS percentile: 0.401     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 203      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MATSSEEVLLIVKKVRQKKQDGALYLMAERIAWAPEGKDRFTISHMYADIKCQKISPEGKAKIQLQLVLHAGDTTNFHFSNESTAVKERDAVKDLLQQLL 100
gnomAD_SAV:        P     T  E HR   G S FI     S       KLIVI#T     G    A   S  H   #    N A    TK       Q        L  
Conservation:  7445999999779799579999799997995993979999947972959977999997997979979499497454799575457277775597997999
SS_PSIPRED:        HHHHEEEEEE        EEEEE  EEEEE       EEEEEHHHHH           EEEEEEE    EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:          HHEEEEEEEE   E EEEEEE  EEEEEE      EEEEEHHHHHE          EEEEEEEE   EEEEEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:         HHHHHHH          HHHHH H EEE        EEEEEHHHHHH         HHHHHHE     EEEEEEE HHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDD                                                                                              
DO_SPOTD:      DDDDD                                                                                               
DO_IUPRED2A:                                                                                  DD                   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKFKRKANKELEEKNRMLQEDPVLFQLYKDLVVSQVISAEEFWANRLNVNATDSSSTSNHKQDVGISAAFLADVRPQTDGCNGLRYNLTSDIIESIFRTY 200
gnomAD_SAV:    L  R   S          R  R          M # MIT     S#     I   P CSQ  N        G  W H VD  S      FE T  # G  
Conservation:  9799775997999995995999499999799977777557577755412321211002324977979779779779979999995999949997977799
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH             HHHH            EEEE  HHHHHHHHHH 
SS_SPIDER3:    HH HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHH                HHHHH    EE     EEEE  HHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHH                  HHH           EEEEEE HHHHHHHHHH 
DO_DISOPRED3:                                                          DDDDDDDDDDDDDDDD                            
DO_SPOTD:                                                          DDDDDDDDDDDDD                                   
DO_IUPRED2A:             DD D                                      DDDDDDD                                         

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PAVKMKYAENVPHNMTEKEFWTRFFQSHYFHRDRLNTGSKDLFAECAKIDEKGLKTMVSLGVKNPLLDLTALEDKPLDEGYGISSVPSASNSKSIKENSN 300
BenignSAV:                                      W                                                  F               
gnomAD_SAV:            KS SRSV      AC L        W     R V    VR V   V R A           A         S   FF           A  S
Conservation:  9797499195799377975997497997999999475727979499773793795357049967474593377942644546111144573253176796
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHH HHHHHHHHH         HHHH                           H
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHH   H   HHHH                                  H HHHH H
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHH   HHH   HHH                                     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                               DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:                                         DDDDDD        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                                     DD   DDD D        
MODRES_A:                                             K                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AAIIKRFNHHSAMVLAAGLRKQEAQNEQTSEPSNMDGNSGDADCFQPAVKRAKLQESIEYEDLGKNNSVKTIALNLKKSDRYYHGPTPIQSLQYATSQDI 400
gnomAD_SAV:    VTVV  Y Y  V   V #       K  S     VH S R G R       V     #     R   P Q MV   E     C    LV  V  V    V
Conservation:  3979676756647676673370421164047344386354916175443775677756777790003115543969675699479957435346366769
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHHHHHHHHHHHHHH         EE     HHHHH       HH    HHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH H                    HHHHHHHHHHHHHHH H        EEEEE             HH       HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH                   HHHHHHHHHHHHHHHH         EEE    HHHH         HHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDD                      DDDDDDDDDDDDDD   
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD       DDD   DDDD DD D     DD
DO_IUPRED2A:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD        DD  DD         D                             
MODRES_P:                                            S                 S                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            INSFQSIRQEMEAYTPKLTQVLSSSAASSTITALSPGGALMQGGTQQAINQMVPNDIQSELKHLYVAVGELLRHFWSCFPVNTPFLEEKVVKMKSNLERF 500
gnomAD_SAV:     YY #R      V  ST S           F       TFI        K  M HGT#    Q H  I  I Q L       RQ   #  A IR    QL
Conservation:  6473117416610717264653341274234148768816643424645565373559179757939579979779469745737955762673448667
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHH     HH   HHHHHHHH    HHHHHHH   HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH             H           HHH      H        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHH         HHHHHH        HHHH      HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                
DO_SPOTD:      D D  D   DD  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                 
DO_IUPRED2A:                                               DD     DD                                               

                       10        20        30        40        
AA:            QVTKLCPFQEKIRRQYLSTNLVSHIEEMLQTAYNKLHTWQSRRLMKKT 548
BenignSAV:                     V       V                       
gnomAD_SAV:     FM   L H E W#H V     N V  IF KT#K FY   L#C RT M
Conservation:  613563996794446964366145353745255467418643443565
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_SPIDER3:    HHH  HHHHHHHHHH    H HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                         DDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                DDDDDD
DO_IUPRED2A: