P33240  CSTF2_HUMAN

Gene name: CSTF2   Description: Cleavage stimulation factor subunit 2

Length: 577    GTS: 4.189e-07   GTS percentile: 0.027     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 89      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAGLTVRDPAVDRSLRSVFVGNIPYEATEEQLKDIFSEVGPVVSFRLVYDRETGKPKGYGFCEYQDQETALSAMRNLNGREFSGRALRVDNAASEKNKEE 100
gnomAD_SAV:        #   T                           C               I     C                    HK         T     S   
Conservation:  4000001010012121100123253533324422535322363337995977697767679996777779979997797794599799797975765979
SS_PSIPRED:                    EEEE        HHHHHHHHHHH  EEEEEEEEE       EEEEEEE  HHHHHHHHHHH          EEE       HHH
SS_SPIDER3:                   EEEEEE       HHHHHHHHHH   EEEEEEEE      EE EEEEEE  HHHHHHHHHH    EE  EE EEEE      HHH
SS_PSSPRED:                    EEEE        HHHHHHHHHHH  EEEEEEEE          EEEE   HHHHHHHHHHH         EEE        HHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDD                                                                                        
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDD                                                                       D       DDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                             DD              DD           DDD  D   DDDD
MODRES_P:                   S                                                                                      

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LKSLGTGAPVIESPYGETISPEDAPESISKAVASLPPEQMFELMKQMKLCVQNSPQEARNMLLQNPQLAYALLQAQVVMRIVDPEIALKILHRQTNIPTL 200
gnomAD_SAV:                                          H                   Q                                 H    SM 
Conservation:  9444753395279779435054577657556679699775369656664754675777647777699956774964736443466475757954302343
SS_PSIPRED:    HHHH                    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHH        
SS_SPIDER3:    HH               E      HHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHH         
SS_PSSPRED:    HHH                     HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:  D DDDDDDDDDDD   DDDDDDDDDDD                                                                DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           DDDDDDD    DD                          DDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDD DD   DDDDDDDDDDDDD DDDDDDD             DD       DDDDD DD                                  DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            IAGNPQPVHGAGPGSGSNVSMNQQNPQAPQAQSLGGMHVNGAPPLMQASMQGGVPAPGQMPAAVTGPGPGSLAPGGGMQAQVGMPGSGPVSMERGQVPMQ 300
gnomAD_SAV:            R     L    TVS   L G   HC      S #S   E    CV   S  T  T     TS                N          LI 
Conservation:  2363351232325123310112132231212311223323424133633122433264221213133334121345112132636124443576562431
SS_PSIPRED:                                                                                                        
SS_SPIDER3:                                                                                                        
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPRAAMQRGSLPANVPTPRGLLGDAPNDPRGGTLLSVTGEVEPRGYLGPPHQGPPMHHVPGHESRGPPPHELRGGPLPEPRPLMAEPRGPMLDQRGPPLD 400
gnomAD_SAV:         V      V    A      G       A             V        T  I  R      SR                              
Conservation:  4553331344123141234966765746764634435337346623336336444343123451545333427334424571344647653463753333
SS_PSIPRED:       HHH                                                                                              
SS_SPIDER3:      HHHHH                                                                                             
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:             R                                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GRGGRDPRGIDARGMEARAMEARGLDARGLEARAMEARAMEARAMEARAMEARAMEVRGMEARGMDTRGPVPGPRGPIPSGMQGPSPINMGAVVPQGSRQ 500
gnomAD_SAV:      D S       QE            V    TH    CV  G#VI       C  # Q      V A   G         V   S  V   V  H    E
Conservation:  1632553544637246222224547739377376462222222222222382646626464262331445111254423144534141233013531156
SS_PSIPRED:                      HHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                             
SS_SPIDER3:                  HHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                           
SS_PSSPRED:                   HHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_M:                                                                         R      R                         

                       10        20        30        40        50        60        70       
AA:            VPVMQGTGMQGASIQGGSQPGGFSPGQNQVTPQDHEKAALIMQVLQLTADQIAMLPPEQRQSILILKEQIQKSTGAP 577
gnomAD_SAV:          I        D R   S   V                      V                            
Conservation:  42012213434321322233444533722253252667779455846524445589446644244555546425413
SS_PSIPRED:                                     HHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:                                   HHHHHHHHHHHHHH   HHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHH    
SS_PSSPRED:                                     HHHHHHHHHHHH   HHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD     DD                        DD DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                               DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD        DDDDDD DDDD DDDDDDDDDD DDDD
MODRES_P:                       S     S