P33241  LSP1_HUMAN

Gene name: LSP1   Description: Lymphocyte-specific protein 1

Length: 339    GTS: 9.055e-07   GTS percentile: 0.182     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 3      gnomAD_SAV: 189      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MAEASSDPGAEEREELLGPTAQWSVEDEEEAVHEQCQHERDRQLQAQDEEGGGHVPERPKQEMLLSLKPSEAPELDEDEGFGDWSQRPEQRQQHEGAQGA 100
BenignSAV:                                                                                                        T
gnomAD_SAV:     V  LNEL TKKQ      PD  NM     TI KRYRN*        NQ   D  LKWL   IP  V  L  LQ    Q      R    W   KE   T
Conservation:  1111111111111111113636543963667545445546334731512322112310431512223561123425343747545443332522021111
SS_PSIPRED:             HHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHH                      HHHHHHH      
SS_SPIDER3:             HHHHHHH        HH  HHH  HHHHHHHHHHHHH  H          HHHHH                   H   H  HHH       
SS_PSSPRED:              HHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHH                      HHHHHHHHHH   
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                             S                                                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LDSGEPPQCRSPEGEQEDRPGLHAYEKEDSDEVHLEELSLSKEGPGPEDTVQDNLGAAGAEEEQEEHQKCQQPRTPSPLVLEGTIEQSSPPLSPTTKLID 200
BenignSAV:            L                                                                                            
gnomAD_SAV:     G RD LL K      K KSD #  KRD   K#  G WG NQ EA#SG S   S RDS PGK K#K   WP    A L      MK NL         MG
Conservation:  1112432222242213312111111111111120421314112201224001201110322121351200222524430223310102211123313511
SS_PSIPRED:                           HHHHH HHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                           HHH
SS_SPIDER3:                             HH   HHHHHHHH                      HHHHHHHHH                               
SS_PSSPRED:                            HHH   HHHHHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                              
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                S                                                               T S          SS   S       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            RTESLNRSIEKSNSVKKSQPDLPISKIDQWLEQYTQAIETAGRTPKLARQASIELPSMAVASTKSRWETGEVQAQSAAKTPSCKDIVAGDMSKKSLWEQK 300
BenignSAV:                                 K                                                                       
gnomAD_SAV:      K  KPP   RSTL R KA SR A TG * QR #H  K T#QI R VCK  T M  V      GW* M  I* #CV   L R  M   N #  TI# H 
Conservation:  2311312251221233427422442553346475466473624234433553395423265335438616332442445244454555765345578822
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHH               HHH      HHHH                        HHHHH  
SS_SPIDER3:    HHHHH HHH                 HHHHHHHHHHHHHH                 HHH  H HHH                           EHHE  
SS_PSSPRED:      HHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHH                                                           
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   DDDDDDDDDD                  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                    DDDDDDDDDDD      DD DD  D  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DD       DD DDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD  DDD  DDDDDDD
MODRES_P:                                                         S                                                

                       10        20        30        4
AA:            GGSKTSSTIKSTPSGKRYKFVATGHGKYEKVLVEGGPAP 339
gnomAD_SAV:    R F S  A   #L R  HT # IRP  D    AVE LP 
Conservation:  443332211411423555345243463223624323324
SS_PSIPRED:                    EEEEEEE     EEEE       
SS_SPIDER3:                   E EEEEE   EEEEEEE       
SS_PSSPRED:                    EEEEEE     EEEEE       
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDD              DDD DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDD                    DDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDD   DDD  D          DDDDDDD D
MODRES_A:                                K