P34897  GLYM_HUMAN

Gene name: SHMT2   Description: Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial

Length: 504    GTS: 1.744e-06   GTS percentile: 0.557     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


            gnomAD_SAV: 236      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MLYFSLFWAARPLQRCGQLVRMAIRAQHSNAAQTQTGEANRGWTGQESLSDSDPEMWELLQREKDRQCRGLELIASENFCSRAALEALGSCLNNKYSEGY 100
gnomAD_SAV:           #E W P  Y    S  TQT  # TD  #        R   R LHT S I  F *K  H  R#          #CQ V  T E Y K     V 
Conservation:  1111111111113111111111111111100010010010003022112111614321331262056002434334453412433554642424554442
STMI:          TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT                                                                       
SS_PSIPRED:      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH                HHHH HHHHHHHHHHHHHHHH            HHHHHHH  HHH       
SS_SPIDER3:       HHHH    HHHH  HHHHHHHHH  H  H                HHHH HHHHHHHHHHHHHHH   EEEE      HHHHHH             
SS_PSSPRED:       HHHHHHHHH HH    HHHHHHHHHHHHHH               HHHH HHHHHHHHHHHHHHHH  EEEEE HHH HHHHHHH            
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                                                          
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DD                                                       
DO_IUPRED2A:                                 DD DDDDDDDDDDDDDDD     DDDD                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PGKRYYGGAEVVDEIELLCQRRALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAVYTALLQPHDRIMGLDLPDGGHLTHGYMSDVKRISATSIFFESMPYKLNPK 200
gnomAD_SAV:     S  H A           G#CQ  D     L   E    T  R    V IC     S NWT     SN     Y  # EI #  SM T  * #   RD  
Conservation:  6325544524356248167329753472532118868756267635824442565173654666344466544685332144451363373424735211
SS_PSIPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH  EE       HHHHHHHHHH     EEEEE                    EEE  EE         
SS_SPIDER3:            HHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHH          HHHHHHHHH      EEEEE           EE    E EEEEEEEEEEEEEE   
SS_PSSPRED:             HHHHHHHHHHHHHHHHHH                 HHHHHHHHHH                            EEEEEEHHH         
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:        K                                                                             K              K    

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            TGLIDYNQLALTARLFRPRLIIAGTSAYARLIDYARMREVCDEVKAHLLADMAHISGLVAAKVIPSPFKHADIVTTTTHKTLRGARSGLIFYRKGVKAVD 300
gnomAD_SAV:      F   S  #  VQ  WRQR V       C    #L     E*  G       Q     S  LV L  E VVMIA      V# V      FW E  TL 
Conservation:  3423443142122113233223441434452244123414523236374364754375554322446524444466665637663544365343333223
SS_PSIPRED:         HHHHHHHHHHH   EEEE          HHHHHHHHHH   EEEEE   HHHHHH            EEEE          EEEEEEE       
SS_SPIDER3:       E  HHHHHHHHHH   EEEE          HHHHHHHHHH   EEEEHHHHHHHHHH         E EEEE            EEEEEEE    E 
SS_PSSPRED:         HHHHHHHHHHH  EEEEE   HHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH         EEE          HHHEEEEEE       
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                                                                      K   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            PKTGREIPYTFEDRINFAVFPSLQGGPHNHAIAAVAVALKQACTPMFREYSLQVLKNARAMADALLERGYSLVSGGTDNHLVLVDLRPKGLDGARAERVL 400
gnomAD_SAV:     RS Q    I   *    M    * # Q D    AGA       #V WK        VQ  T     * S M  AD G   LVME W  S   #P GG  
Conservation:  2335232163462334254763358865362656362362340231621520343163335412521143134634352654434523143362335325
SS_PSIPRED:              HHHHHHHH          HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EE        EEEEE       HHHHHHHH
SS_SPIDER3:         EE   HHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   EEEE     EEEEEE       HHHHHHHH
SS_PSSPRED:              HHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  EEEE     EEEEE        HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       
MODRES_A:                                                             K                                            

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            ELVSITANKNTCPGDRSAITPGGLRLGAPALTSRQFREDDFRRVVDFIDEGVNIGLEVKSKTAKLQDFKSFLLKDSETSQRLANLRQRVEQFARAFPMPG 500
gnomAD_SAV:      I #I  E     N*    # S W  DL   F*  C #  PT  G  VDAL T F  RG     *  R S FN  G I C  SF  W    S V SV  
Conservation:  4123532664335422332154746464873867350613511440442342042313410111423512151120120002123302631331054234
SS_PSIPRED:    HH  EE                 EEE    HH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:    HH   EEE E        E                  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     
SS_PSSPRED:    HHH HEE                              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:               DDDDDDDD                                                                                
MODRES_P:                                                                           S                              
MODRES_A:                                                                     K    K    K                          

                   
AA:            FDEH 504
gnomAD_SAV:      G 
Conservation:  1111
SS_PSIPRED:        
SS_SPIDER3:        
SS_PSSPRED:        
DO_DISOPRED3:      
DO_SPOTD:       DDD
DO_IUPRED2A: