P35221  CTNA1_HUMAN

Gene name: CTNNA1   Description: Catenin alpha-1

Length: 906    GTS: 8.481e-07   GTS percentile: 0.158     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


PathogenicSAV: 4      BenignSAV: 4      gnomAD_SAV: 296      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MTAVHAGNINFKWDPKSLEIRTLAVERLLEPLVTQVTTLVNTNSKGPSNKKRGRSKKAHVLAASVEQATENFLEKGDKIAKESQFLKEELVAAVEDVRKQ 100
PathogenicSAV:                                                      C                                              
gnomAD_SAV:      GL T  V   L  E R F  Q      A           SD  WL S    CFM VR  SPFI KT           P  N   E KF VTA G G R
Conservation:  1120324231422332354545255646344452655453233523442344534566354536652670555457344625312423560145126324
SS_PSIPRED:                          HHHHHHHHHHHHHHHHHHH                HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:             EEEE     EE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHH              HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHH 
SS_PSSPRED:             EE       EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHE             HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                DD D          DDDDDDDDDDD                                             
DO_SPOTD:      DDDDD                                       DDDDDDDDDDD                                             
DO_IUPRED2A:                                         DDDDDDDDDDDDDDDDDDD   D                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GDLMKAAAGEFADDPCSSVKRGNMVRAARALLSAVTRLLILADMADVYKLLVQLKVVEDGILKLRNAGNEQDLGIQYKALKPEVDKLNIMAAKRQQELKD 200
BenignSAV:                                                                                   V                     
gnomAD_SAV:    SG   T    LTG  YC   Q  V P  *  FF I Q    # V    R   E E   GD  E    DD #  *   TV        S            
Conservation:  3227316532863567223463446234523733663643845425412760242243323115344242345111432633652284023133334673
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:        D                                                                                             
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            VGHRDQMAAARGILQKNVPILYTASQACLQHPDVAAYKANRDLIYKQLQQAVTGISNAAQATASDDASQHQGGGGGELAYALNNFDKQIIVDPLSFSEER 300
BenignSAV:          H            S                                                                                 
gnomAD_SAV:       HNR V    VP   IS  SA  R      GITVCT T NQLH#    T K   S     DLE    Y*SA E    H  S LE RV A  S     H
Conservation:  1135735734442642422363332253634454363253552663643264236525564320010001122214264064334311532243112411
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHH           HH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               HHHHHHHHHHHHHH         HH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH         HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                    DDDDDDDDDDDD                          
DO_IUPRED2A:   DD                                                        DDDDDDDDDDDDDDDD                          
MODRES_P:                                                                     S   S                          S S   

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            FRPSLEERLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMGNAGRKERSDALNSAIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVP 400
PathogenicSAV:       K          S                                                                                  
gnomAD_SAV:           H     G           H  CH QL               L   RS  C     T S     I       H   H S  NNI       SI 
Conservation:  2473663454344545454353245651344554354433546664653554143332342325315432323533243433445324324413332314
SS_PSIPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH
SS_SPIDER3:      HHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    H
SS_PSSPRED:     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                             D  DDDDDDDDDD       D                     

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLVLIEAAKNGNEKEVKEYAQVFREHANKLIEVANLACSISNNEEGVKLVRMSASQLEALCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTD 500
PathogenicSAV:                               M                                                                     
gnomAD_SAV:      IV D     S    Q      # R SR V  DS VY V  I   I R QI V     F L  SD        S        V     L*  K C   N
Conservation:  3333234212412342232213312331232112132312214233233221332312144746463765764572955321574276228624355556
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                     D                                                                                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            AVDDITSIDDFLAVSENHILEDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLLSNTVMPRFTEQVEAAVEALSS 600
gnomAD_SAV:    V E  A                   S      N A   HH       #    TYI   QL H  S     R       F S  TA#    IA      RT
Conservation:  6666444567664565353543344853574425242653485444555355244433554467484674375123229322546433145325522540
SS_PSIPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH  
SS_SPIDER3:    HHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHH  
SS_PSSPRED:    HHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHH  
DO_DISOPRED3:                                                                                                  DDDD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                     D                          DDDDDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            DPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELDDSDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVASFQEEKSKLDA 700
gnomAD_SAV:     S L        NV C I    Q    S      S *       I  V       I    #         V      P         M G          
Conservation:  2000132633455454546435435633455573677663886756535258456257565543374666634325443343345446536345523655
SS_PSIPRED:           HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                             HHHH    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:        HH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                              HH      HHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:          HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     HHHHHHHH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH H
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDD                       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDD D   
DO_SPOTD:                                        DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                             
DO_IUPRED2A:   DDDDDDD  DD                         D   DDDDDDDDDDDDDDDDD DDDD    DDDD     DD      DDDD            D
MODRES_P:                                       T      S   T      S  S  T                                          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAGSRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEV 800
gnomAD_SAV:         E           E            *   RF       N  T    V        C          Y        EC                  
Conservation:  4423558365656777745674666655555546576433666386438445856633454344225553344356466543436445766346456565
SS_PSIPRED:    HHHH      HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHH
SS_SPIDER3:    HHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHE H HHHH
SS_PSSPRED:    HH        HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      
DO_DISOPRED3:                                                                                                    DD
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:   DD                                                                                                  

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLVKREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEF 900
gnomAD_SAV:              R   T               R   V  IT N H    SV   I       V           D       N  #     QM L    G# 
Conservation:  7496565534524613333435333452532434252223342222231233324443534434344454454434302422322113312142232221
SS_PSIPRED:          EEE  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 EE               HH     HHH      HHHHHHHH
SS_SPIDER3:                 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HH                                      E E        HHHHHHHH
SS_PSSPRED:          EEE     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                                     HHHHH         HHHHHHHH
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDD                              DDDDDDD    DDDD   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                    DDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                                   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD           
MODRES_P:                                                        S                                                 

                     
AA:            KAMDSI 906
BenignSAV:         N 
gnomAD_SAV:     V  N 
Conservation:  311100
SS_PSIPRED:    HH    
SS_SPIDER3:    H     
SS_PSSPRED:    H     
DO_DISOPRED3:  DDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDD
DO_IUPRED2A: