P35251  RFC1_HUMAN

Gene name: RFC1   Description: Replication factor C subunit 1

Length: 1148    GTS: 1.377e-06   GTS percentile: 0.392     


gnomAD     SWISS-MODEL     InterPro     ProViz     PDB    


      BenignSAV: 6      gnomAD_SAV: 507      SnvSAV


                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MDIRKFFGVIPSGKKLVSETVKKNEKTKSDEETLKAKKGIKEIKVNSSRKEDDFKQKQPSKKKRIIYDSDSESEETLQVKNAKKPPEKLPVSSKPGKISR 100
gnomAD_SAV:           E    R    N I   S  RM       TE A  KM I   H  N VN*  #NR  S  CY  L TG # R    QNS G R  Y RL E  W
Conservation:  5665475542232331111222122111212310104231211442230041101112136563252388562541011232540222221222102213
SS_PSIPRED:      HHHHH                      HHHHHHHH             HHH           EEE      HHHHH                      
SS_SPIDER3:       HHH                        HHHHHH              HHH           EEE        HHHH                     
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  D   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                    DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                                        Y S S S                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QDPVTYISETDEEDDFMCKKAASKSKENGRSTNSHLGTSNMKKNEENTKTKNKPLSPIKLTPTSVLDYFGTGSVQRSNKKMVASKRKELSQNTDESGLND 200
gnomAD_SAV:    EN  IC   RV    LT      E  D  GCIK R E     E  Q S   SR   LV # S  LF    NR   # SN    N      RD       H
Conservation:  2346144444546523012210131424312102112210111112232211224332835357536697222537825557447532322301311229
SS_PSIPRED:                                                                    HHHH                               H
SS_SPIDER3:        EE          H                                               HHHH                               H
SS_PSSPRED:                                                                                                        
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:             S T                                             S    T TS        S                S          

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            EAIAKQLQLDEDAELERQLHEDEEFARTLAMLDEEPKTKKARKDTEAGETFSSVQANLSKAEKHKYPHKVKTAQVSDERKSYSPRKQSKYESSKESQQHS 300
gnomAD_SAV:    KD T   H    V   K  R # G   IV V ED      V#    ER M   #RGTFG  D    SQ         GKN   S R    G PE      
Conservation:  6458358844852539664959849869985483273185343222221213113121012331312122121021011110112101001002131112
SS_PSIPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHH   HHHHHHHHH                     HHHH   HHHH                              HHHH   
SS_SPIDER3:    HHHHHH    HHHHHHHH  HHHHHHHHHHH                       HHHH HHHH                                  H  
SS_PSSPRED:     HHHHHH   HHHHHHHH    HHHHHHHHH                                                                     
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MODRES_P:                                                          S                           S S                 

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KSSADKIGEVSSPKASSKLAIMKRKEESSYKEIEPVASKRKENAIKLKGETKTPKKTKSSPAKKESVSPEDSEKKRTNYQAYRSYLNREGPKALGSKEIP 400
BenignSAV:                                                       I                                                 
gnomAD_SAV:    R  T      Y LR  T  V T KNG T        PL       I    I     SRN S R   LNL  F   HPDF  FQ    QD  E P F  M 
Conservation:  2330021220231634566414514340011200000100212011022221355304278252351596548876163377567989799699998569
SS_PSIPRED:                  HHHHHHHH  HHH          HHHHHHH                        HHH HHH   HHHHHHHHH             
SS_SPIDER3:                       HHHHH                HHH                              H    HHHHHHHH              
SS_PSSPRED:                                                                                 HHHHHHHH               
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD 
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD    
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD DDDDDDDDDDD
MODRES_P:                 S                                                       S                                

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            KGAENCLEGLIFVITGVLESIERDEAKSLIERYGGKVTGNVSKKTNYLVMGRDSGQSKSDKAAALGTKIIDEDGLLNLIRTMPGKKSKYEIAVETEMKKE 500
gnomAD_SAV:    R       DV#C    M A V * KV  V  #HR  L  H N#      V HVN R  N   T  E  S A       TQ L D  A       AG    
Conservation:  3967997975499677767759977695979969998997796796656399859359269834799465488597465534996687844546261211
SS_PSIPRED:              EEEEE       HHHHHHHHHHH  EEE        EEE        HHHHHHH    EE   HHHHHHHH        HHHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:              EEEEE       HHHHHHHHHH   EE        EEEE       HHHHHHHH         HHHHHHH         HHHHHHHH HH
SS_PSSPRED:        HHH   EEEEE       HHHHHHHHHHH  EEE        EEE      HHHHHHHHHH       HHHHHHHHH        HHHHHHH    
DO_DISOPRED3:                                        D DD D  DDD    DDDDDDDDDDDD                 DDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                              DDDDDD  DDDD    DD         DDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                               DD DDDDD     D DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                        DDDDD   DDDD

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            SKLERTPQKNVQGKRKISPSKKESESKKSRPTSKRDSLAKTIKKETDVFWKSLDFKEQVAEETSGDSKARNLADDSSENKVENLLWVDKYKPTSLKTIIG 600
BenignSAV:                                                                                                      V  
gnomAD_SAV:         #SPRK   Q R T  EE P  #   L  RK# W#  M   AE L  I     H     N#  R S       G     W        ALF  VV 
Conservation:  2302364130011233155051121133031332311101012111112351124001112010111011101011021111198999996925573669
SS_PSIPRED:    H                                   HHHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHHH    HHH               HHHH     HHHH  
SS_SPIDER3:    H                                   HHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHH                       HH       HHHHH 
SS_PSSPRED:                                         HHHHHHHHHHHHHHHH HHHHHHHH                                HHHHH 
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                  
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                   
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD                     DDDDDDDDDDDDDDD                         
MODRES_P:                                          S                                                               

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            QQGDQSCANKLLRWLRNWQKSSSEDKKHAAKFGKFSGKDDGSSFKAALLSGPPGVGKTTTASLVCQELGYSYVELNASDTRSKSSLKAIVAESLNNTSIK 700
BenignSAV:                 L                                                                              D        
gnomAD_SAV:    R RN    T   C  QS R RFFKV  R GR #  FV  GSF   GV    S# I      # MR       LA S    QTM G  VF GD     N  
Conservation:  9996587857945984394222222242336237245776444299799999997999797597944685569769775476655572265767577563
SS_PSIPRED:        HHHHHHHHHHHHH HH     HHHHH              EEEHH       HHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHHHH     
SS_SPIDER3:        HHHHHHHHHHHHH        HH  H             EEEEEEE      HHHHHHHHHHHH  EEEEEE      HHHHHHHHHHH    EE 
SS_PSSPRED:        HHHHHHHHHHHHHHHHH                     HHHEEEEE      HHHHHHHHHHHH   EEEEE      HHHHHHHHHHHHH     
DO_DISOPRED3:                           DDDDDDDDDDDDDD                                                             
DO_SPOTD:                             DDDDDDDDDDDDDDDDD                                                            
DO_IUPRED2A:                               DDDDD                                                                   
NP_BIND:                                                        SGPPGVGK                                           

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            GFYSNGAASSVSTKHALIMDEVDGMAGNEDRGGIQELIGLIKHTKIPIICMCNDRNHPKIRSLVHYCFDLRFQRPRVEQIKGAMMSIAFKEGLKIPPPAM 800
gnomAD_SAV:       AK T   L AR VV          I   R T   F    #     VYV S    L  LF  RHS   C P LQ       VI VE I    FS  T 
Conservation:  3752232213351495669997799996999996997939772656877769999774769795779699975777579776646556799955677797
SS_PSIPRED:                  EEEEE            HHHHHHHHHHHH    EEEEE     HHHHHHHHHEEEEE     HHHHHHHHHHHHHH      HHHH
SS_SPIDER3:     EE           EEEEEE E       HHHHHHHHHHHHHH    EEEE      HHHHHHH  EEEE E    HHHHHHHHHHHHHH      HHHH
SS_PSSPRED:                  EEEEE             HHHHHHHHHHHH  EEEEE        HHHHHHHHHHE      HHHHHHHHHHHHHHH     HHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            NEIILGANQDIRQVLHNLSMWCARSKALTYDQAKADSHRAKKDIKMGPFDVARKVFAAGEETAHMSLVDKSDLFFHDYSIAPLFVQENYIHVKPVAAGGD 900
gnomAD_SAV:        F   L V  I Q       Q  V ACGLSRG CRI # GV V L    W   T      YV PG   H  LR   VV   I    V#M     ED 
Conservation:  6959767779699769964777633747699467356137699376799775999932557435776499479997995567997799955757396345
SS_PSIPRED:    HHHHHH    HHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH   HHHH  HHHHHHH      HHHHHHHH             
SS_SPIDER3:    HHHHHH   HHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH        HHHHHHHHH    HHHHHHHHH  H       HHHHHHHH H           
SS_PSSPRED:    HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH   HHH  HHHHHHHH    HHHHHHHHHHH            
DO_DISOPRED3:                                  D                                                                   
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            MKKHLMLLSRAADSICDGDLVDSQIRSKQNWSLLPAQAIYASVLPGELMRGYMTQFPTFPSWLGKHSSTGKHDRIVQDLALHMSLRTYSSKRTVNMDYLS 1000
BenignSAV:                                                           K                                             
gnomAD_SAV:    #*E  II     E L A      RMWN    R   V  V G    AG I  C# K  IY      Y#    YHH  R  G  #   S    T   V    
Conservation:  2736639797777796799796337952629596957777799699798883725993983989749645763954979529649571347365747983
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HH  HHHHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHHHHHHHHH           HHHH     HHHHHHHHHHHHH         HHHHHHHHHH
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH          HHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHH       HHHHHHHHHH
DO_DISOPRED3:                                                                                                      
DO_SPOTD:                                                                                                          
DO_IUPRED2A:                                                                                                       

                       10        20        30        40        50        60        70        80        90     
AA:            LLRDALVQPLTSQGVDGVQDVVALMDTYYLMKEDFENIMEISSWGGKPSPFSKLDPKVKAAFTRAYNKEAHLTPYSLQAIKASRHSTSPSLDSEYNEELN 1100
gnomAD_SAV:      KE F#         R R   V TGA  M  DH   VV   N D   T V E   Q     I   YEK RV AS   D QS  Y IN F  L  S   H
Conservation:  4472355188210824951256145739264779375588342854354377488799978899499783885995821252251223321325124320
SS_PSIPRED:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHHH      HHHHH           HHH     
SS_SPIDER3:    HHHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHH    HHHHHHHHHH H            HHHHHHHHHHHH         HHHHH                   
SS_PSSPRED:    HHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH   HHHHHHHHHHH             HHHHHHHHHHHHHH      HHH H                    
DO_DISOPRED3:                                                                     DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:                                                    DDDDDDDDDDDDDDD       DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:                                                         D                     DDDDDDDD DDDDDDDDDDDDDDD

                       10        20        30        40        
AA:            EDDSQSDEKDQDAIETDAMIKKKTKSSKPSKPEKDKEPRKGKGKSSKK 1148
BenignSAV:                                                  L  
gnomAD_SAV:        *         D       NRE   S  S  G K       TLE 
Conservation:  131001333524232295867551432502304312212524352113
SS_PSIPRED:              HHHHHHHHHHHH                          
SS_SPIDER3:                 HH                                 
SS_PSSPRED:                                                    
DO_DISOPRED3:  DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_SPOTD:      DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
DO_IUPRED2A:   DDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDD
MOTIF:                            IKKKT                        
MODRES_P:         S S